About: Polyploidization as a key factor in genome evolution of basal vertebrates´ lineages

Facets (new session)
Description
Metadata
Settings
- owl:sameAs
- Inference Rule:

About: Polyploidization as a key factor in genome evolution of basal vertebrates´ lineages Goto Sponge NotDistinct Permalink

An Entity of Type : http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/Projekt, within Data Space : linked.opendata.cz associated with source document(s)

Attributes	Values
rdf:type	http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/Projekt
rdfs:seeAlso	http://www.isvav.cz/projectDetail.do?rowId=GPP506/11/P596
Description	Double whole genome duplication at the base of vertebrates´ evolution belongs to unexplained issues of the genome evolution. Traces of these events old about 600-640 Myr are obscured by consequent genome reductions and by another rounds of duplication specific to derived groups (e.g. ray-finned fishes). Sturgeons (Acipenseriformes) are the earliest and most ancient group diverged within ray-finned fishes where duplications by means of allopolyploidization take place also nowadays resulting in 3 ploidy levels (4n, 8n, 12 n; the 2n ancestor has not survived). Sturgeons are a unique model system to study genome evolution of early vertebrates with features enabling interspecies hybridisation giving rise to fertile offspring. This project proposes to use sturgeons and their hybrids of the FFPW USB to contribute to elucidation the issue of paleo-ploidy level by undertaking 1) cytogenetics mapping of selected conserved genes (Hox, Sox), 2) testing hypotheses that allopolyploidization is facilitated by nonexistence of sex chromosomes and 3) gene silencing is involved in rediploidisation. (en) Dvojnásobné zdvojení genomu bazálních linií obratlovců patří k neobjasněným aspektům evoluce genomu. Stopy těchto 600-640 mil. let starých událostí jsou zastřeny následnými redukcemi genomu a duplikacemi arediploidizací již jen u některých skupin obratlovců (př. paprskoploutví). Jeseteři (Acipenseriformes) jsou nejrannější, velmi starobylou vývojovou divergencí paprskoploutvých, u nichž duplikace allopolyploidizací probíhá až dosud. Jejím výsledkem jsou 3 ploidní úrovně (4n, 8n, 12n; diploidní předek se nedochoval). Jeseteři tak představují jedinečný model ke studiu evoluce genomu nejstarších obratlovců. Jsou unikátní tím, že jedinci různých ploidií ale i různých druhů se mezi sebou kříží a produkují fertilní potomstvo. Tento projekt navrhuje na jeseterech a jejich hybridech z chovu FROV JU přispět k řešení otázky paleo- a recentní ploidie, provést 1) cytogenetická mapování některých konzervativních genů (Hox, Sox), 2) testování hypotéz, že allopolyploidizaci umožňuje neexistence pohlavních chromozómů a 3) gene silencing (histonové modifikace) je jedním z mechanismů rediploidizace.
Title	Polyploidization as a key factor in genome evolution of basal vertebrates´ lineages (en) Polyploidizace jako klíčový faktor v evoluci genomu bazálních linií obratlovců
skos:notation	GPP506/11/P596
http://linked.open...avai/cep/aktivita	Post-graduate (doctorate) grants
http://linked.open...kovaStatniPodpora	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/projekt/GPP506%2F11%2FP596/celkovaStatniPodpora
http://linked.open...ep/celkoveNaklady	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/projekt/GPP506%2F11%2FP596/celkoveNaklady
http://linked.open...datumDodatniDoRIV	2014-06-25 (xsd:date)
http://linked.open...i/cep/druhSouteze	VS - Veřejná soutěž ve výzkumu a vývoji
http://linked.open...ep/duvernostUdaju	S - Úplné a pravdivé údaje nepodléhající ochraně podle zvláštních právních předpisů
http://linked.open.../cep/fazeProjektu	100662247
http://linked.open...ai/cep/hlavniObor	EG - Zoologie
http://linked.open...hodnoceniProjektu	V - Vynikající výsledky (s mezinárodním významem apod.). Zároveň byly splněny cíle a předpokládané výsledky uvedené ve smlouvě / rozhodnutí o poskytnutí podpory.
http://linked.open...vai/cep/kategorie	ZV - Základní výzkum
http://linked.open.../cep/klicovaSlova	genome evolution allopolyploidization hybridization chromosomes evolution FISH CGH determination of homologue chromosomes (en)
http://linked.open...ep/partnetrHlavni	Ústav živočišné fyziologie a genetiky AV ČR, v.v.i.
http://linked.open...inujicichPrijemcu	0 (xsd:int)
http://linked.open...cep/pocetPrijemcu	1 (xsd:int)
http://linked.open...ocetSpoluPrijemcu	0 (xsd:int)
http://linked.open.../pocetVysledkuRIV	4 (xsd:int)
http://linked.open...enychVysledkuVRIV	4 (xsd:int)
http://linked.open...lneniVMinulemRoce	2013-06-12 (xsd:date)
http://linked.open.../prideleniPodpory	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/prideleniPodpory/P506-11-P596
http://linked.open...iciPoslednihoRoku	2013
http://linked.open...atUdajeProjZameru	2014
http://linked.open.../vavai/cep/soutez	SGA02011GA1PD
http://linked.open...usZobrazovaneFaze	DUU
http://linked.open...ai/cep/typPojektu	P - Projekt výzkumu a vývoje financovaný ze státního rozpočtu
http://linked.open...ep/ukonceniReseni	2013-12-31 (xsd:date)
http://linked.open...ep/zahajeniReseni	2011-01-01 (xsd:date)
http://linked.open...jektu+dodavatelem	V průběhu projektu se podařilo úspěšně aplikovat metody genomové in situ hybridizace (GISH) a komparativní genomové hybridizace (CGH) u polyploidních a vysoce polyploidních hybridních ryb. Projekt přinesl čtyři publikace, tři z nich byly publikovány v kvalitních časopisech. (cs) Within the project several methods of genomic in situ hybridization (GISH) and comparative genomic hybridization (CGH) in polyploid and highly polyploid hybrid fish have been successfully applied. The project yielded four publications, three of them published in highly recognized journals. (en)
http://linked.open...tniCyklusProjektu	ZBKU
is http://linked.open...vavai/cep/projekt of	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GPP506%2F11%2FP596/2011/ico%3A67985904 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GPP506%2F11%2FP596/2012/ico%3A67985904 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GPP506%2F11%2FP596/2013/ico%3A67985904 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GPP506%2F11%2FP596/2014/ico%3A67985904

Faceted Search & Find service v1.16.118 as of Jun 21 2024

Alternative Linked Data Documents: ODE Content Formats:

RDF

ODATA

Microdata

About

OpenLink Virtuoso version 07.20.3240 as of Jun 21 2024, on Linux (x86_64-pc-linux-gnu), Single-Server Edition (126 GB total memory, 47 GB memory in use)
Data on this page belongs to its respective rights holders.
Virtuoso Faceted Browser Copyright © 2009-2024 OpenLink Software