About: Development of in vitro transcription system for Corynebacterium glutamicum and characterization of RNA polymerase activity

Facets (new session)
Description
Metadata
Settings
- owl:sameAs
- Inference Rule:

About: Development of in vitro transcription system for Corynebacterium glutamicum and characterization of RNA polymerase activity Goto Sponge NotDistinct Permalink

An Entity of Type : http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/Projekt, within Data Space : linked.opendata.cz associated with source document(s)

Attributes	Values
rdf:type	http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/Projekt
rdfs:seeAlso	http://www.isvav.cz/projectDetail.do?rowId=GPP302/12/P633
Description	In vitro transcription is an efficient tool to analyze regulation of gene expression in bacteria. No in vitro transcription system for an important amino acid producer Corynebacterium glutamicum has yet been available. We have already isolated RNA polymerase (RNAP) from C. glutamicum and demonstrated its in vitro function. In the present project, the fully active RNAP holoenzyme reconstituted from the purified core RNA polymerase and sigma subunits will form the basis for a reliable in vitro transcription system for C. glutamicum. Various combinations of the core RNAP with particular sigma factors will enable us to identify sigma factors involved in the transcription of the studied C. glutamicum promoters. Optimization of the transcriptional activity will allow to use this system for analysis of some properties of C. glutamicum RNAP holoenzyme and to compare them with those of RNAPs from Bacillus subtilis and Escherichia coli. (en) Transkripce in vitro je účinným nástrojem analýzy regulace genové exprese u bakterií. Pro studium významného producenta aminokyselin Corynebacterium glutamicum nebyl dosud systém transkripce in vitro k dispozici. V předběžných experimentech jsme RNA polymerasu (RNAP) z C. glutamicum izolovali a prokázali její funkci in vitro. V předkládaném projektu bude plně aktivní holoenzym RNAP, připravený rekonstitucí purifikovaného jádra RNAP a sigma podjednotek, tvořit základ spolehlivého systému transkripce in vitro pro C. glutamicum. Různé kombinace jádra RNA polymerasy a jednotlivých sigma faktorů umožní identifikaci sigma faktorů účastnících se transkripce ze studovaných promotorů C. glutamicum. Optimalizovaný systém transkripce in vitro bude použit při analýze některých vlastností RNAP z C. glutamicum a pro jejich porovnání s vlastnostmi RNA polymeras z Bacillus subtilis a Escherichia coli.
Title	Development of in vitro transcription system for Corynebacterium glutamicum and characterization of RNA polymerase activity (en) Vývoj systému in vitro transkripce pro Corynebacterium glutamicum a charakterizace aktivity RNA polymerasy
skos:notation	GPP302/12/P633
http://linked.open...avai/cep/aktivita	Post-graduate (doctorate) grants
http://linked.open...kovaStatniPodpora	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/projekt/GPP302%2F12%2FP633/celkovaStatniPodpora
http://linked.open...ep/celkoveNaklady	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/projekt/GPP302%2F12%2FP633/celkoveNaklady
http://linked.open...datumDodatniDoRIV	2015-05-22 (xsd:date)
http://linked.open...i/cep/druhSouteze	VS - Veřejná soutěž ve výzkumu a vývoji
http://linked.open...ep/duvernostUdaju	S - Úplné a pravdivé údaje nepodléhající ochraně podle zvláštních právních předpisů
http://linked.open.../cep/fazeProjektu	101098910
http://linked.open...ai/cep/hlavniObor	EE - Mikrobiologie, virologie
http://linked.open...hodnoceniProjektu	V - Vynikající výsledky (s mezinárodním významem apod.). Zároveň byly splněny cíle a předpokládané výsledky uvedené ve smlouvě / rozhodnutí o poskytnutí podpory.
http://linked.open...vai/cep/kategorie	ZV - Základní výzkum
http://linked.open.../cep/klicovaSlova	in vitro transcription RNA polymerase Corynebacterium glutamicum (en)
http://linked.open...ep/partnetrHlavni	Mikrobiologický ústav AV ČR, v.v.i.
http://linked.open...inujicichPrijemcu	0 (xsd:int)
http://linked.open...cep/pocetPrijemcu	1 (xsd:int)
http://linked.open...ocetSpoluPrijemcu	0 (xsd:int)
http://linked.open.../pocetVysledkuRIV	3 (xsd:int)
http://linked.open...enychVysledkuVRIV	3 (xsd:int)
http://linked.open...lneniVMinulemRoce	2014-03-31 (xsd:date)
http://linked.open.../prideleniPodpory	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/prideleniPodpory/P302-12-P633
http://linked.open...iciPoslednihoRoku	2014
http://linked.open...atUdajeProjZameru	2015
http://linked.open.../vavai/cep/soutez	SGA02011GA1PD
http://linked.open...usZobrazovaneFaze	DUU
http://linked.open...ai/cep/typPojektu	P - Projekt výzkumu a vývoje financovaný ze státního rozpočtu
http://linked.open...ep/ukonceniReseni	2014-12-31 (xsd:date)
http://linked.open.../cep/vedlejsiObor	EI - Biotechnologie a bionika EB - Genetika a molekulární biologie
http://linked.open...ep/zahajeniReseni	2012-01-01 (xsd:date)
http://linked.open...jektu+dodavatelem	Byl vyvinut systém transkripce in vitro pro bakterii Corynebacterium glutamicum a využit pro studium specifity sigma faktorů. Systém se stal základem pro novou techniku ROSE, která umožňuje analýzu promotorů na úrovni genomu. Výstupem projektu jsou dvě velmi kvalitní publikace a kapitola v knize. Získané výsledky významně přispívají k objasnění regulační sítě řízené sigma faktory RNA polymerázy. (cs) The in vitro transcription system for Corynebacterium glutamicum was developed and exploited for the study of sigma factor specificity. The system became the basis for newly developed ROSE technique for analysis of promotors on genome level. The project output consists of two high quality papers and one book chapter. Obtained results are significant for understanding of transcription regulation. (en)
http://linked.open...tniCyklusProjektu	ZBKU
is http://linked.open...vavai/cep/projekt of	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GPP302%2F12%2FP633/2015/ico%3A61388971 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GPP302%2F12%2FP633/2012/ico%3A61388971 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GPP302%2F12%2FP633/2013/ico%3A61388971 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GPP302%2F12%2FP633/2014/ico%3A61388971

Faceted Search & Find service v1.16.118 as of Jun 21 2024

Alternative Linked Data Documents: ODE Content Formats:

RDF

ODATA

Microdata

About

OpenLink Virtuoso version 07.20.3240 as of Jun 21 2024, on Linux (x86_64-pc-linux-gnu), Single-Server Edition (126 GB total memory, 26 GB memory in use)
Data on this page belongs to its respective rights holders.
Virtuoso Faceted Browser Copyright © 2009-2024 OpenLink Software