About: Identification of cis-acting signal and trans-acting proteins involved in DNA encapsidation and viral assembly of mouse polyomavirus.

Facets (new session)
Description
Metadata
Settings
- owl:sameAs
- Inference Rule:

About: Identification of cis-acting signal and trans-acting proteins involved in DNA encapsidation and viral assembly of mouse polyomavirus. Goto Sponge NotDistinct Permalink

An Entity of Type : http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/Projekt, within Data Space : linked.opendata.cz associated with source document(s)

Attributes	Values
rdf:type	http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/Projekt
rdfs:seeAlso	http://www.isvav.cz/projectDetail.do?rowId=GPP302/10/P118
Description	The project focuses on the mouse polyomavirus virion assembly process. The aim of this proposal is to identify cis-acting DNA signal sequence for encapsidation of viral genome as well as trans-acting protein/s involved in virion assembly. The experimental system for identification these elements is based on the transduction of reporter gene by way of pseudovirions produced in specially designed cell line. Several experimental methods for verification of requirement of these elements in viral genome encapsidation are proposed. These include site directed mutagenesis of the encapsidation signal sequence, electrophoretic mobility shift assay and chromatin immunoprecipitation (ChIP) procedure for confirmation of trans-acting protein/s binding to the encapsidation sequence. The specific role of trans-acting protein/s in virion assembly will be clarified in the series of experiments in the cell line with regulated level of selected protein/s prepared by RNA interference technology. Moreover, the significance of newly identified elements in a design of the mammalian gene delivery system will be evaluated. (en) Tento projekt je zaměřen na proces tvorby virionů u myšího polomaviru. Cílem předkládaného projektu je identifikovat v rámci virového genomu signální sekvence nutné pro jeho enkapsidaci a protein/y účastnící se vzniku virionu. Experimentální systém pro identifikaci těchto elementů je založen na schopnosti psedovirionů produkovaných ve speciálně navržené buněčné linii transdukovat reportérový gen. V projektu je navrženo několik experimentálních metod pro ověření nezbytnosti takto identifikovaných elementů pro encapsidaci virového genomu. Mezi metody sloužící k potvrzení vazby identifikovaného proteinu na enkapsidační signální sekvenci patří místně specifická mutageneze enkapsidační sekvence, test změny mobility EMSA (electrophoretic mobility shift assay) a chromatinová imunoprecipitace. Konkrétní role identifikovaného protein (nebo proteinů) při vzniku virionu bude osvětlena pomocí série experimentů v buněčné linii s regulovatelnou hladinou tohoto proteinu připravenou pomocí technologie RNA interference. Kromě toho bude vyhodoncena i nezbytnost nově identifikovaných elementů v návrhu systému pro dopravu genů do savčích buněk.
Title	Identification of cis-acting signal and trans-acting proteins involved in DNA encapsidation and viral assembly of mouse polyomavirus. (en) Identifikace enkapsidačního signálu a proteinů zúčastněných při enkapsidaci DNA v průběhu virové morfogeneze myšího polyomaviru.
skos:notation	GPP302/10/P118
http://linked.open...avai/cep/aktivita	Post-graduate (doctorate) grants
http://linked.open...kovaStatniPodpora	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/projekt/GPP302%2F10%2FP118/celkovaStatniPodpora
http://linked.open...ep/celkoveNaklady	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/projekt/GPP302%2F10%2FP118/celkoveNaklady
http://linked.open...datumDodatniDoRIV	2014-07-15 (xsd:date)
http://linked.open...i/cep/druhSouteze	VS - Veřejná soutěž ve výzkumu a vývoji
http://linked.open...ep/duvernostUdaju	S - Úplné a pravdivé údaje nepodléhající ochraně podle zvláštních právních předpisů
http://linked.open.../cep/fazeProjektu	100237043
http://linked.open...ai/cep/hlavniObor	EE - Mikrobiologie, virologie
http://linked.open...vai/cep/kategorie	ZV - Základní výzkum
http://linked.open.../cep/klicovaSlova	mouse polomavirus encapsidation signal assembly (en)
http://linked.open...ep/partnetrHlavni	Přírodovědecká fakulta
http://linked.open...inujicichPrijemcu	0 (xsd:int)
http://linked.open...cep/pocetPrijemcu	1 (xsd:int)
http://linked.open...ocetSpoluPrijemcu	0 (xsd:int)
http://linked.open.../pocetVysledkuRIV	1 (xsd:int)
http://linked.open...enychVysledkuVRIV	1 (xsd:int)
http://linked.open.../prideleniPodpory	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/prideleniPodpory/P302-10-P118
http://linked.open...iciPoslednihoRoku	2014
http://linked.open...atUdajeProjZameru	2014
http://linked.open.../vavai/cep/soutez	SGA02010GA1PD
http://linked.open...usZobrazovaneFaze	DRRVK
http://linked.open...ai/cep/typPojektu	P - Projekt výzkumu a vývoje financovaný ze státního rozpočtu
http://linked.open...ep/ukonceniReseni	2014-12-31 (xsd:date)
http://linked.open...ep/zahajeniReseni	2010-01-01 (xsd:date)
http://linked.open...tniCyklusProjektu	ZBK.K
is http://linked.open...vavai/cep/projekt of	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GPP302%2F10%2FP118/2010/orjk%3A11310 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GPP302%2F10%2FP118/2011/orjk%3A11310 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GPP302%2F10%2FP118/2012/orjk%3A11310 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GPP302%2F10%2FP118/2013/orjk%3A11310 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GPP302%2F10%2FP118/2014/orjk%3A11310

Faceted Search & Find service v1.16.118 as of Jun 21 2024

Alternative Linked Data Documents: ODE Content Formats:

RDF

ODATA

Microdata

About

OpenLink Virtuoso version 07.20.3240 as of Jun 21 2024, on Linux (x86_64-pc-linux-gnu), Single-Server Edition (126 GB total memory, 58 GB memory in use)
Data on this page belongs to its respective rights holders.
Virtuoso Faceted Browser Copyright © 2009-2024 OpenLink Software