About: Mapping interactions of CyaA protein with complement receptor using mass spectrometry and electron microscopy

Facets (new session)
Description
Metadata
Settings
- owl:sameAs
- Inference Rule:

About: Mapping interactions of CyaA protein with complement receptor using mass spectrometry and electron microscopy Goto Sponge NotDistinct Permalink

An Entity of Type : http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/Projekt, within Data Space : linked.opendata.cz associated with source document(s)

Attributes	Values
rdf:type	http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/Projekt
rdfs:seeAlso	http://www.isvav.cz/projectDetail.do?rowId=GP310/07/P115
Description	Complement receptor type 3 (CR3) is a member of the beta-2 integrin family that is found on the surface of leukocytes. Recently, it has been demonstrated that CR3 serves as a target for CyaA protein. CyaA is a member of Repeats in ToXin (RTX) protein family that comprises major virulence factors of several Gram-negative bacteria. Interaction of CyaA with CR3 on immune cells triggers inhibition of microbicidal functions, induction of apoptosis and disrupts innate antibacterial immune response. The aimof the study is to clarify the mutual interaction of CyaA with CR3. The interaction of CyaA will be studied both in vivo on CR3 expressing cells and in vitro using isolated CR3 complex. Interaction of CR3 with CyaA will be analyzed taking advantage of the mass spectrometry equipment that allows very high precision and resolution tandem mass spectrometric analyzes for probing protein structure using chemical modification and cross-linking reagents. In the next step the structure of the CyaA-CR3 complex (en) Komplementový receptor typu 3 (CR3) je člen rodiny beta-2 integrinů, který se nachází na povrchu některých typů leukocytů. Nedávno bylo ukázáno, že CR3 slouží jako specifický buněčný receptor pro protein CyaA. Tento protein patří do rodiny tzv. RTX (Repeats in ToXin) toxinů produkovaných celou řadou gramnegativních bakterií, které jsou lidskými, živočišnými a rostlinnými patogeny. Vazba CyaA k buňkám imunitního systému vede k narušení jejich mikrobicidních funkcí, indukuje apoptózu a ovlivňuje maturaci dendritických buněk. Cílem tohoto projektu je analyzovat mechanismus vzájemné interakce proteinu CyaA s receptorem CR3. Vazba CyaA na CR3 bude studována jak na buňkách exprimujících CR3 receptor, tak na izolovaných komplexech CR3. K identifikacioblastí zodpovědných za vzájemnou interakci bude použita metoda chemického zesíťování molekul pomocí bifunkčních síťovacích činidel a hmotnostní spektrometrie. Dalším krokem bude určit trojrozměrnou strukturu komplexu CyaA-CR3 pomocí metody negativního
Title	Mapping interactions of CyaA protein with complement receptor using mass spectrometry and electron microscopy (en) Mapování interakcí proteinu CyaA s komplementovým receptorem pomocí hmotnostní spektrometrie a elektronové mikroskopie
skos:notation	GP310/07/P115
http://linked.open...avai/cep/aktivita	Post-graduate (doctorate) grants
http://linked.open...kovaStatniPodpora	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/projekt/GP310%2F07%2FP115/celkovaStatniPodpora
http://linked.open...ep/celkoveNaklady	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/projekt/GP310%2F07%2FP115/celkoveNaklady
http://linked.open...datumDodatniDoRIV	2015-01-22 (xsd:date)
http://linked.open...i/cep/druhSouteze	VS - Veřejná soutěž ve výzkumu a vývoji
http://linked.open...ep/duvernostUdaju	S - Úplné a pravdivé údaje nepodléhající ochraně podle zvláštních právních předpisů
http://linked.open.../cep/fazeProjektu	65825781
http://linked.open...ai/cep/hlavniObor	EE - Mikrobiologie, virologie
http://linked.open...hodnoceniProjektu	V - Vynikající výsledky (s mezinárodním významem apod.). Zároveň byly splněny cíle a předpokládané výsledky uvedené ve smlouvě / rozhodnutí o poskytnutí podpory.
http://linked.open...vai/cep/kategorie	ZV - Základní výzkum
http://linked.open.../cep/klicovaSlova	CR3; complement receptor; CyaA; RTX toxin; electron microscopy; cross-linking (en)
http://linked.open...ep/partnetrHlavni	Mikrobiologický ústav AV ČR, v.v.i.
http://linked.open...inujicichPrijemcu	0 (xsd:int)
http://linked.open...cep/pocetPrijemcu	1 (xsd:int)
http://linked.open...ocetSpoluPrijemcu	0 (xsd:int)
http://linked.open.../pocetVysledkuRIV	4 (xsd:int)
http://linked.open...enychVysledkuVRIV	4 (xsd:int)
http://linked.open...lneniVMinulemRoce	2009-04-22 (xsd:date)
http://linked.open.../prideleniPodpory	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/prideleniPodpory/310%2F07%2FP115
http://linked.open...iciPoslednihoRoku	2009
http://linked.open...atUdajeProjZameru	2010
http://linked.open.../vavai/cep/soutez	SGA02007GA1PD
http://linked.open...usZobrazovaneFaze	DUU
http://linked.open...ai/cep/typPojektu	P - Projekt výzkumu a vývoje financovaný ze státního rozpočtu
http://linked.open...ep/ukonceniReseni	2009-12-31 (xsd:date)
http://linked.open...ep/zahajeniReseni	2007-01-01 (xsd:date)
http://linked.open...jektu+dodavatelem	. (en) Řešení projektu považuje komise OK3 za výtečné. Řešitel má 3 publikace a 2 rukopisy v recenzním řízení, jedna z publikací, kde je řešitel prvním a současně korespondujícím autorem, vyšla v nejlepším časopise přislušného oboru. Vzhledem k přijetí této publ (cs)
http://linked.open...tniCyklusProjektu	ZBKU
http://linked.open.../cep/klicoveSlovo	CR3 CyaA RTX toxin complement receptor electron microscopy
is http://linked.open...vavai/cep/projekt of	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GP310%2F07%2FP115/2007/ico%3A61388971 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GP310%2F07%2FP115/2008/ico%3A61388971 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GP310%2F07%2FP115/2009/ico%3A61388971 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GP310%2F07%2FP115/2010/ico%3A61388971

Faceted Search & Find service v1.16.118 as of Jun 21 2024

Alternative Linked Data Documents: ODE Content Formats:

RDF

ODATA

Microdata

About

OpenLink Virtuoso version 07.20.3240 as of Jun 21 2024, on Linux (x86_64-pc-linux-gnu), Single-Server Edition (126 GB total memory, 58 GB memory in use)
Data on this page belongs to its respective rights holders.
Virtuoso Faceted Browser Copyright © 2009-2024 OpenLink Software