About: Electrochemical methods for bioanalysis of nucleic acids and their application in cancer diagnostics

Facets (new session)
Description
Metadata
Settings
- owl:sameAs
- Inference Rule:

About: Electrochemical methods for bioanalysis of nucleic acids and their application in cancer diagnostics Goto Sponge NotDistinct Permalink

An Entity of Type : http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/Projekt, within Data Space : linked.opendata.cz associated with source document(s)

Attributes	Values
rdf:type	http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/Projekt
rdfs:seeAlso	http://www.isvav.cz/projectDetail.do?rowId=GP14-24931P
Description	Gene misregulation often leads to occurrence of severe diseases, including cancer, and thus substantial effort is devoted to development of new methods for their analysis. For instance, alterations in microRNA expression and changes in DNA methylation patterns play an important role during malignant transformation and carcinogenesis. Compared to currently used methods, electrochemistry is considered less expensive and time-consuming alternative with simpler instrumentation. Based on our recent results, we wish to develop and optimize a protocol which could lead to more effective cancer diagnostics. The research will focus on (i) detection of specific microRNAs as potential cancer biomarkers using electroactive labeling, and (ii) discrimination of methylated and unmethylated DNA by applying sodium bisulfite, which converts reducible cytosine to nonreducible uracil, but not the reducible methylcytosine. In a systematic approach, selection of methods, electrode surfaces and electroactive labels will be optimized. Feasibility of the method will be tested in real biological samples. (en) Deregulace genové exprese často vede ke vzniku závažných chorob včetně rakoviny. Velké úsilí je proto věnováno k hledání nových metod pro její analýzu. V rakovinných buňkách byly mezi jinými pozorovány změny v expresi mikroRNA či DNA metylaci. V porovnání s běžně používanými technikami je elektrochemie považována za levnější a rychlejší alternativu s jednodušší instrumentací. Navrhujeme proto aplikovat výsledky našeho nedávného výzkumu elektrochemie nukleových kyselin pro vývoj a optimalizaci postupů, které by vedly ke zlepšení včasné diagnostiky rakoviny. Výzkum bude zaměřen na (i) detekci specifických sekvencí mikroRNA jakožto potenciálních biomarkerů za použití elektroaktivního značení a (ii) rozlišení metylované a nemetylované DNA pomocí reakce s hydrogensiřičitanem sodným, který transformuje redukovatelný cytozin na neredukovatelný uracil, ale nemění redukovatelný metylcytozín. Systematickým přístupem bude optimalizován výběr jednotlivých technik, elektrodových povrchů i elektroaktivních značek, a vhodnost metody bude otestována použitím reálných biologických vzorků.
Title	Electrochemical methods for bioanalysis of nucleic acids and their application in cancer diagnostics (en) Elektrochemické metody pro bioanalýzu nukleových kyselin a jejich aplikace v diagnostice nádorových onemocnění
skos:notation	GP14-24931P
http://linked.open...avai/cep/aktivita	Post-graduate (doctorate) grants
http://linked.open...kovaStatniPodpora	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/projekt/GP14-24931P/celkovaStatniPodpora
http://linked.open...ep/celkoveNaklady	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/projekt/GP14-24931P/celkoveNaklady
http://linked.open...datumDodatniDoRIV	2015-02-09 (xsd:date)
http://linked.open...i/cep/druhSouteze	VS - Veřejná soutěž ve výzkumu a vývoji
http://linked.open...ep/duvernostUdaju	S - Úplné a pravdivé údaje nepodléhající ochraně podle zvláštních právních předpisů
http://linked.open.../cep/fazeProjektu	100994028
http://linked.open...ai/cep/hlavniObor	BO - Biofyzika
http://linked.open...vai/cep/kategorie	ZV - Základní výzkum
http://linked.open.../cep/klicovaSlova	Electrochemistry; Nucleic acids; microRNA; Biomarker; DNA methylation (en)
http://linked.open...ep/partnetrHlavni	Masarykův onkologický ústav
http://linked.open...inujicichPrijemcu	0 (xsd:int)
http://linked.open...cep/pocetPrijemcu	1 (xsd:int)
http://linked.open...ocetSpoluPrijemcu	0 (xsd:int)
http://linked.open.../pocetVysledkuRIV	3 (xsd:int)
http://linked.open...enychVysledkuVRIV	3 (xsd:int)
http://linked.open...lneniVMinulemRoce	2014-04-07 (xsd:date)
http://linked.open.../prideleniPodpory	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/prideleniPodpory/14-24931P
http://linked.open...iciPoslednihoRoku	2015
http://linked.open...atUdajeProjZameru	2015
http://linked.open.../vavai/cep/soutez	SGA0201400003
http://linked.open...usZobrazovaneFaze	DRRVB
http://linked.open...ai/cep/typPojektu	P - Projekt výzkumu a vývoje financovaný ze státního rozpočtu
http://linked.open...ep/ukonceniReseni	2016-12-31 (xsd:date)
http://linked.open.../cep/vedlejsiObor	CB - Analytická chemie, separace CG - Elektrochemie
http://linked.open...ep/zahajeniReseni	2014-01-01 (xsd:date)
http://linked.open...tniCyklusProjektu	ZB
http://linked.open.../cep/klicoveSlovo	Electrochemistry Biomarker Nucleic acids microRNA
is http://linked.open...vavai/cep/projekt of	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GP14-24931P/2014/ico%3A00209805 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GP14-24931P/2015/ico%3A00209805 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GP14-24931P/2016/ico%3A00209805

Faceted Search & Find service v1.16.118 as of Jun 21 2024

Alternative Linked Data Documents: ODE Content Formats:

RDF

ODATA

Microdata

About

OpenLink Virtuoso version 07.20.3240 as of Jun 21 2024, on Linux (x86_64-pc-linux-gnu), Single-Server Edition (126 GB total memory, 58 GB memory in use)
Data on this page belongs to its respective rights holders.
Virtuoso Faceted Browser Copyright © 2009-2024 OpenLink Software