About: Protein adsorption on molecular sieves: Ab initio modeling

Facets (new session)
Description
Metadata
Settings
- owl:sameAs
- Inference Rule:

About: Protein adsorption on molecular sieves: Ab initio modeling Goto Sponge NotDistinct Permalink

An Entity of Type : http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/Projekt, within Data Space : linked.opendata.cz associated with source document(s)

Attributes	Values
rdf:type	http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/Projekt
rdfs:seeAlso	http://www.isvav.cz/projectDetail.do?rowId=GP14-18521P
Description	Porozumění adsorpce proteinů na mezoporézních molekulových sítích (ordered mesoporous silica, OMS) je podstatné zejména z důvodu průmyslového využití (biokatalýza, léčiva, atd.). Teoretický popis těchto systémů je výzvou vzhledem k jejich komplikované struktuře. Popis na úrovni standardních silových polí nemusí být dostatečný a jejich přesnost nebyla pořádně ověřena. V tomto projektu navrhuji systematický přístup k popisu interakce mezi OMS materiály a proteiny. Základním výchozím bodem je velmi přesný ab initio popis modelových systémů, které slouží pro parametrizaci silového pole. Parametry silového pole jsou testovány (ověřeny) proti přesným výpočtům adsorpce malých peptidů na dobře definovaných mikroporézních materiálech. Rovněž je nutné porozumět roli solventu (voda) mezi OMS a proteiny. S výsledným silovým polem lze modelovat adsorpci proteinů na OMS materiálech s dostatečnou přesností, a tudíž získat obecné trendy, na jejichž základě je možné navrhovat nové a z hlediska adsorpce lepší mezoporézní materiály. The adsorption of proteins onto ordered mesoporous silica (OMS) is important due to the possible industrial applications as biocatalyst or drug delivery systems etc. The theoretical description of those materials is quite challenging task due to the complex structural features of both adsorbent (such as SBA-15) and adsorbate (protein). The common theoretical description of those host-guest systems is with force-fields, which accuracy has not been validated. A new systematic approach for the interactions between the OMS and protein interface is proposed. The strategy is based on highly accurate ab initio calculations of model systems to parameterize the force-field parameters and its validation is performed by means of adsorption of small peptides at well-defined microporous materials. The role of the solvent (water) on the interaction between OMS and proteins will be also addressed. The search for the interaction patterns between OMS and proteins should indicate some general features, which could be helpful in designing new OMS materials. (en)
Title	Protein adsorption on molecular sieves: Ab initio modeling (en) Adsorpce proteinů na molekulových sítech: Ab initio modelování
skos:notation	GP14-18521P
http://linked.open...avai/cep/aktivita	Post-graduate (doctorate) grants
http://linked.open...kovaStatniPodpora	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/projekt/GP14-18521P/celkovaStatniPodpora
http://linked.open...ep/celkoveNaklady	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/projekt/GP14-18521P/celkoveNaklady
http://linked.open...datumDodatniDoRIV	2015-02-09 (xsd:date)
http://linked.open...i/cep/druhSouteze	VS - Veřejná soutěž ve výzkumu a vývoji
http://linked.open...ep/duvernostUdaju	S - Úplné a pravdivé údaje nepodléhající ochraně podle zvláštních právních předpisů
http://linked.open.../cep/fazeProjektu	100993586
http://linked.open...ai/cep/hlavniObor	CF - Fyzikální chemie a teoretická chemie
http://linked.open...vai/cep/kategorie	ZV - Základní výzkum
http://linked.open.../cep/klicovaSlova	adsorption, mesoporous silica, proteins, ab initio modeling, force-field parameterization (en)
http://linked.open...ep/partnetrHlavni	Ústav organické chemie a biochemie AV ČR, v. v. i.
http://linked.open...inujicichPrijemcu	0 (xsd:int)
http://linked.open...cep/pocetPrijemcu	1 (xsd:int)
http://linked.open...ocetSpoluPrijemcu	0 (xsd:int)
http://linked.open.../pocetVysledkuRIV	1 (xsd:int)
http://linked.open...enychVysledkuVRIV	1 (xsd:int)
http://linked.open...lneniVMinulemRoce	2014-04-07 (xsd:date)
http://linked.open.../prideleniPodpory	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/prideleniPodpory/14-18521P
http://linked.open...iciPoslednihoRoku	2015
http://linked.open...atUdajeProjZameru	2015
http://linked.open.../vavai/cep/soutez	SGA0201400003
http://linked.open...usZobrazovaneFaze	DRRVB
http://linked.open...ai/cep/typPojektu	P - Projekt výzkumu a vývoje financovaný ze státního rozpočtu
http://linked.open...ep/ukonceniReseni	2016-12-31 (xsd:date)
http://linked.open...ep/zahajeniReseni	2014-01-01 (xsd:date)
http://linked.open...tniCyklusProjektu	ZB
http://linked.open.../cep/klicoveSlovo	adsorption ab initio modeling mesoporous silica proteins
is http://linked.open...vavai/cep/projekt of	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GP14-18521P/2014/ico%3A61388963 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GP14-18521P/2015/ico%3A61388963 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GP14-18521P/2016/ico%3A61388963

Faceted Search & Find service v1.16.118 as of Jun 21 2024

Alternative Linked Data Documents: ODE Content Formats:

RDF

ODATA

Microdata

About

OpenLink Virtuoso version 07.20.3240 as of Jun 21 2024, on Linux (x86_64-pc-linux-gnu), Single-Server Edition (126 GB total memory, 58 GB memory in use)
Data on this page belongs to its respective rights holders.
Virtuoso Faceted Browser Copyright © 2009-2024 OpenLink Software