About: Genome sequencing of oxymonad and Trimastix

Facets (new session)
Description
Metadata
Settings
- owl:sameAs
- Inference Rule:

About: Genome sequencing of oxymonad and Trimastix Goto Sponge NotDistinct Permalink

An Entity of Type : http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/Projekt, within Data Space : linked.opendata.cz associated with source document(s)

Attributes	Values
rdf:type	http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/Projekt
rdfs:seeAlso	http://www.isvav.cz/projectDetail.do?rowId=GAP506/12/1010
Description	The boom of the whole genome sequencing that we experience recently affects the diversity of eukaryotes very unevenly. The main attention is obviously paid to animals, fungi and plants. 372 out of 443 finished genomes listed in GenBank belong to these groups. The research in the last decade showed clearly that the main portion of the eukaryotic diversity at the level of cell structure and function lies in unicellular protists. In the proposal we would like to use the methods of next generation sequencing to obtain drafts of genomes of two flagellates of the group Preaxostyla - Monocercomonoides and Trimastix. Preaxostyla belong to the group of anaerobes called Metamonada together with parasites Trichomonas vaginalis and Giardia intestinalis. In contrary to markedly derived trichomonads and Giardia, the cells and genomes of Preaxostyla may resemble more closely the original state in the common ancestor of Metamonada. The information in their genomes will be interesting for the understanding of the cell biology of the ancestors of Metamonada and the first eukaryotes in general. (en) Rozmach genomického sekvenování, který zažíváme v posledních době, postihuje různorodost eukaryot značně nerovnoměrně. Největší pozornosti se z pochopitelných důvodů těší živočichové, rostliny a houby takže 372 z celkového počtu 443 osekvenovaných eukaryotických genomů vedených v databázi GenBank spadá do těchto skupin. Výzkumy diverzity a evoluce eukaryot za poslední desetiletí však jasně ukázaly, že hlavní část diverzity eukaryot na úrovni struktury a funkce buněk spočívá v jednobuněčných protistech. V předkládaném projektu se chceme pokusit získat metodami next generation sequencing drafty kompletních genomů dvou zástupců linie Preaxostyla - bičíkovců Monocercomonoides a Trimastix. Preaxostyla spadají do skupiny anaerobů zvané Metamonada společně s parazity, jako je Trichomonas vaginalis a Giardia intestinalis. Na rozdíl od značně odvozených trichomonád a giardie lze očekávat, že buňka i genom preaxostyl je blíže původnímu stavu u společného předka metamonád. Sekvence jejich genomů bude tedy zajímavá pro poznání buněčné biologie předků skupiny metamonada a prvních eukaryot vůbec.
Title	Genome sequencing of oxymonad and Trimastix (en) Sekvenace genomu oxymonády a trimastixe
skos:notation	GAP506/12/1010
http://linked.open...avai/cep/aktivita	Standard projects
http://linked.open...kovaStatniPodpora	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/projekt/GAP506%2F12%2F1010/celkovaStatniPodpora
http://linked.open...ep/celkoveNaklady	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/projekt/GAP506%2F12%2F1010/celkoveNaklady
http://linked.open...datumDodatniDoRIV	2015-04-23 (xsd:date)
http://linked.open...i/cep/druhSouteze	VS - Veřejná soutěž ve výzkumu a vývoji
http://linked.open...ep/duvernostUdaju	S - Úplné a pravdivé údaje nepodléhající ochraně podle zvláštních právních předpisů
http://linked.open.../cep/fazeProjektu	100778222
http://linked.open...ai/cep/hlavniObor	EE - Mikrobiologie, virologie
http://linked.open...vai/cep/kategorie	ZV - Základní výzkum
http://linked.open.../cep/klicovaSlova	oxymonads Trimastix Preaxostyla genome 454 transcriptome (en)
http://linked.open...neniPrubehuReseni	Deferred Final Report (en) Odložená závěrečná zpráva (cs)
http://linked.open...ep/partnetrHlavni	Přírodovědecká fakulta
http://linked.open...inujicichPrijemcu	0 (xsd:int)
http://linked.open...cep/pocetPrijemcu	1 (xsd:int)
http://linked.open...ocetSpoluPrijemcu	1 (xsd:int)
http://linked.open.../pocetVysledkuRIV	1 (xsd:int)
http://linked.open...enychVysledkuVRIV	1 (xsd:int)
http://linked.open...lneniVMinulemRoce	2014-05-16 (xsd:date)
http://linked.open.../prideleniPodpory	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/prideleniPodpory/P506-12-1010
http://linked.open...iciPoslednihoRoku	2015
http://linked.open...atUdajeProjZameru	2015
http://linked.open.../vavai/cep/soutez	SGA02012GA-ST
http://linked.open...usZobrazovaneFaze	DRP
http://linked.open...ai/cep/typPojektu	P - Projekt výzkumu a vývoje financovaný ze státního rozpočtu
http://linked.open...ep/ukonceniReseni	2016-12-31 (xsd:date)
http://linked.open...ep/zahajeniReseni	2012-01-01 (xsd:date)
http://linked.open...tniCyklusProjektu	ZBKP
is http://linked.open...vavai/cep/projekt of	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GAP506%2F12%2F1010/2015/ico%3A68378050 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GAP506%2F12%2F1010/2015/orjk%3A11310 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GAP506%2F12%2F1010/2016/ico%3A68378050 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GAP506%2F12%2F1010/2016/orjk%3A11310 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GAP506%2F12%2F1010/2012/ico%3A68378050 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GAP506%2F12%2F1010/2012/orjk%3A11310 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GAP506%2F12%2F1010/2013/ico%3A68378050 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GAP506%2F12%2F1010/2013/orjk%3A11310 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GAP506%2F12%2F1010/2014/ico%3A68378050 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GAP506%2F12%2F1010/2014/orjk%3A11310

Faceted Search & Find service v1.16.118 as of Jun 21 2024

Alternative Linked Data Documents: ODE Content Formats:

RDF

ODATA

Microdata

About

OpenLink Virtuoso version 07.20.3240 as of Jun 21 2024, on Linux (x86_64-pc-linux-gnu), Single-Server Edition (126 GB total memory, 58 GB memory in use)
Data on this page belongs to its respective rights holders.
Virtuoso Faceted Browser Copyright © 2009-2024 OpenLink Software