About: Establishment of the secondary plastid in euglenids

Facets (new session)
Description
Metadata
Settings
- owl:sameAs
- Inference Rule:

About: Establishment of the secondary plastid in euglenids Goto Sponge NotDistinct Permalink

An Entity of Type : http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/Projekt, within Data Space : linked.opendata.cz associated with source document(s)

Attributes	Values
rdf:type	http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/Projekt
rdfs:seeAlso	http://www.isvav.cz/projectDetail.do?rowId=GAP506/11/1320
Description	The project is focused on the secondary plastids of euglenids. We will perform environmental survey in order to reveal a green alga related to the ancestor of the euglenid plastid closer than the so far known Pyramimonas parkeae. Using 454 technique we will sequence the transcriptome (cDNA) of this alga or P. parkeae and three species of euglenids - Eutreptiella gymnastica, Phacus caudatus a non-photosynthetic Rhabdomonas sp. Furthermore we will sequence the plastid genome of the alga and photosynthetic euglenids. From the data we will reconstruct plastid proteomes and perform a comparative analysis including the well studied plastid of E. gracilis. We will notice the similarities and differences between genomes and proteomes of plastid established in three lineages of euglenids. We will be interested in the phylogenetic origin of proteins of euglenids, particularly in the contribution of proteins originating from the cyanobacteria (ancestor of the primary plastid) and the green alga (endosymbiot). The contributions will be compared between the euglenid lineages. (en) Projekt je zaměřen na výzkum euglen - vhodnou skupinu pro studium vzniku sekundárního plastidu. Budeme pátrat po zelené řase, která je ještě příbuznější předku euglenidího plastidu než dosud známý druh Pyramimonas parkeae. Metodou 454 osekvenujeme transkriptom (cDNA) této zelené řasy nebo P. parkeae a tří druhů euglen Eutreptiella gymnastica, Phacus caudatus a nefotosyntetické eugleny Rhabdomonas sp. U fotosyntetických druhů euglen a u zelené řasy osekvenujeme také plastidový genom. Ze získaných dat se pokusíme rekonstruovat proteomy plastidů a provedeme srovnávací analýzu plastidových genomů a proteomů (včetně studovaného plastidu E. gracilis). Budeme si všímat, jak podobné či odlišné jsou plastidy, které se etablovaly ve třech liniích euglen. Budeme analyzovat také fylogenetický původ proteinů v plastidu i cytosolu u jednotlivých euglen a zajímat nás bude především příspěvek genů pocházejících ze sinice (předka primárního plastidu) a zelené řasy (endosymbionta). Srovnáme příspěvky endosymbiózy do proteomu různých linií euglenidů.
Title	Establishment of the secondary plastid in euglenids (en) Vznik sekundárního plastidu u euglenidů
skos:notation	GAP506/11/1320
http://linked.open...avai/cep/aktivita	Standard projects
http://linked.open...kovaStatniPodpora	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/projekt/GAP506%2F11%2F1320/celkovaStatniPodpora
http://linked.open...ep/celkoveNaklady	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/projekt/GAP506%2F11%2F1320/celkoveNaklady
http://linked.open...datumDodatniDoRIV	2015-04-23 (xsd:date)
http://linked.open...i/cep/druhSouteze	VS - Veřejná soutěž ve výzkumu a vývoji
http://linked.open...ep/duvernostUdaju	S - Úplné a pravdivé údaje nepodléhající ochraně podle zvláštních právních předpisů
http://linked.open.../cep/fazeProjektu	100780050
http://linked.open...ai/cep/hlavniObor	EB - Genetika a molekulární biologie
http://linked.open...vai/cep/kategorie	ZV - Základní výzkum
http://linked.open.../cep/klicovaSlova	secondary endosymbiosis endosymbiotic gene transfer euglenids plastid (en)
http://linked.open...ep/partnetrHlavni	Přírodovědecká fakulta
http://linked.open...inujicichPrijemcu	0 (xsd:int)
http://linked.open...cep/pocetPrijemcu	1 (xsd:int)
http://linked.open...ocetSpoluPrijemcu	1 (xsd:int)
http://linked.open.../pocetVysledkuRIV	4 (xsd:int)
http://linked.open...enychVysledkuVRIV	4 (xsd:int)
http://linked.open...lneniVMinulemRoce	2014-05-16 (xsd:date)
http://linked.open.../prideleniPodpory	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/prideleniPodpory/P506-11-1320
http://linked.open...iciPoslednihoRoku	2015
http://linked.open...atUdajeProjZameru	2015
http://linked.open.../vavai/cep/soutez	SGA02011GA-ST
http://linked.open...usZobrazovaneFaze	DRRVK
http://linked.open...ai/cep/typPojektu	P - Projekt výzkumu a vývoje financovaný ze státního rozpočtu
http://linked.open...ep/ukonceniReseni	2015-12-31 (xsd:date)
http://linked.open.../cep/vedlejsiObor	EE - Mikrobiologie, virologie
http://linked.open...ep/zahajeniReseni	2011-01-01 (xsd:date)
http://linked.open...tniCyklusProjektu	ZBBBK
is http://linked.open...vavai/cep/projekt of	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GAP506%2F11%2F1320/2011/ico%3A68378050 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GAP506%2F11%2F1320/2011/orjk%3A11310 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GAP506%2F11%2F1320/2012/ico%3A68378050 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GAP506%2F11%2F1320/2012/orjk%3A11310 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GAP506%2F11%2F1320/2013/ico%3A68378050 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GAP506%2F11%2F1320/2013/orjk%3A11310 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GAP506%2F11%2F1320/2014/ico%3A68378050 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GAP506%2F11%2F1320/2014/orjk%3A11310 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GAP506%2F11%2F1320/2015/ico%3A68378050 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GAP506%2F11%2F1320/2015/orjk%3A11310

Faceted Search & Find service v1.16.118 as of Jun 21 2024

Alternative Linked Data Documents: ODE Content Formats:

RDF

ODATA

Microdata

About

OpenLink Virtuoso version 07.20.3240 as of Jun 21 2024, on Linux (x86_64-pc-linux-gnu), Single-Server Edition (126 GB total memory, 24 GB memory in use)
Data on this page belongs to its respective rights holders.
Virtuoso Faceted Browser Copyright © 2009-2024 OpenLink Software