About: Phylogenetic relationships in the family Bovidae studied by analysis of subfamily specific DNA repeats and karyotype

Facets (new session)
Description
Metadata
Settings
- owl:sameAs
- Inference Rule:

About: Phylogenetic relationships in the family Bovidae studied by analysis of subfamily specific DNA repeats and karyotype Goto Sponge NotDistinct Permalink

An Entity of Type : http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/Projekt, within Data Space : linked.opendata.cz associated with source document(s)

Attributes	Values
rdf:type	http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/Projekt
rdfs:seeAlso	http://www.isvav.cz/projectDetail.do?rowId=GAP506/10/0421
Description	Repetitive DNA sequences in both (peri)-centromeric and genome heterochromatin in general represent rapidly evolving genome components, and have been used as efficient phylogenetic markers in several studies so far. In the proposed grant project, evolutionary and phylogenetic relationships of the wide and diverse family Bovidae will be studied by analysis of subfamily specific DNA repeats. Karyotypes of all investigated species will be determined and verified by comparative FISH using bovine painting probes. Subfamily specific DNA repeats isolated from sex chromosomes and centromeres of autosomes will be obtained by the techniques of laser microdissection, DOP-PCR, cloning, inversion PCR, and sequencing. On the basis of the karyotype analysis, and comparison of homologies and interspecific hybridizations (FISH) of examined sequences within the various subfamilies, phylogenetic associations between the investigated species and evolution of sex chromosomes will be specified. (en) Repetitivní DNA sekvence přítomné v (peri) centromerickém a genomovém heterochromatinu představují evolučně rychle se vyvíjející složku genomu a byly dosud s úspěchem použity v několika studiích jako fylogenetický marker. V předkládaném grantu budou na základě analýzy podčeleďově specifických satelitních DNA studovány evoluční a fylogenetické vztahy velmi rozsáhlé a různorodé čeledi Bovidae. Bude stanoven a pomocí komparativní FISH s bovinními celochromosomovými sondami ověřen karyotyp všech vyšetřovaných druhů. Podčeleďově specifické DNA sekvence izolované z pohlavních chromosomů a centromer autosomů budou získávány pomocí technik laserové mikrodisekce, DOP-PCR, klonování, inverzní PCR a sekvenování. Na základě analýzy karyotypu, srovnání homologií a mezidruhových hybridizací (FISH) sledovaných sekvencí budou specifikovány evoluční a fylogenetické vztahy mezi vyšetřovanými druhy a zkoumán vývoj pohlavních chromosomů.
Title	Phylogenetic relationships in the family Bovidae studied by analysis of subfamily specific DNA repeats and karyotype (en) Fylogenetické vztahy v rámci čeledi Bovidae definované na základě analýzy karyotypu a podčeleďově specifických satelitních DNA
skos:notation	GAP506/10/0421
http://linked.open...avai/cep/aktivita	Standard projects
http://linked.open...kovaStatniPodpora	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/projekt/GAP506%2F10%2F0421/celkovaStatniPodpora
http://linked.open...ep/celkoveNaklady	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/projekt/GAP506%2F10%2F0421/celkoveNaklady
http://linked.open...datumDodatniDoRIV	2014-07-01 (xsd:date)
http://linked.open...i/cep/druhSouteze	VS - Veřejná soutěž ve výzkumu a vývoji
http://linked.open...ep/duvernostUdaju	S - Úplné a pravdivé údaje nepodléhající ochraně podle zvláštních právních předpisů
http://linked.open.../cep/fazeProjektu	100264355
http://linked.open...ai/cep/hlavniObor	EB - Genetika a molekulární biologie
http://linked.open...hodnoceniProjektu	V - Vynikající výsledky (s mezinárodním významem apod.). Zároveň byly splněny cíle a předpokládané výsledky uvedené ve smlouvě / rozhodnutí o poskytnutí podpory.
http://linked.open...vai/cep/kategorie	ZV - Základní výzkum
http://linked.open.../cep/klicovaSlova	Bovidae satellite DNA microdissection phylogeny FISH evolution karyotype analysis (en)
http://linked.open...ep/partnetrHlavni	Výzkumný ústav veterinárního lékařství, v.v.i,
http://linked.open...inujicichPrijemcu	0 (xsd:int)
http://linked.open...cep/pocetPrijemcu	1 (xsd:int)
http://linked.open...ocetSpoluPrijemcu	0 (xsd:int)
http://linked.open.../pocetVysledkuRIV	9 (xsd:int)
http://linked.open...enychVysledkuVRIV	9 (xsd:int)
http://linked.open...lneniVMinulemRoce	2013-06-07 (xsd:date)
http://linked.open.../prideleniPodpory	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/prideleniPodpory/P506-10-0421
http://linked.open...iciPoslednihoRoku	2013
http://linked.open...atUdajeProjZameru	2014
http://linked.open.../vavai/cep/soutez	SGA02010GA-ST
http://linked.open...usZobrazovaneFaze	DUU
http://linked.open...ai/cep/typPojektu	P - Projekt výzkumu a vývoje financovaný ze státního rozpočtu
http://linked.open...ep/ukonceniReseni	2013-12-31 (xsd:date)
http://linked.open.../cep/vedlejsiObor	EG - Zoologie
http://linked.open...ep/zahajeniReseni	2010-01-01 (xsd:date)
http://linked.open...jektu+dodavatelem	According to proposal, karyotype evolution (incl. sex chromosome evolution) was studied in the family Bovidae using FISH and chromosomal painting. New karyological data on non-domesticated taxa of the family Bovidae were estimated. The role of interspecific hybridization in the family evolution was evaluated. Results published in 7 papers in journals indexed in WoS. (en) V souladu s návrhem byla studována evoluce karyotypu (vč. evoluce pohlavních chromosomů) v rámci čel. Bovidae s použitím technik FISH a chromosomal painting. Publikována nová karyotypová data o nedomestikovaných druzích čel. Bovidae. Zhodnocena role mezidruhové hybridizace v evoluci čeledi. Výsledky publikovány v 7 článcích v Jimp časopisech. (cs)
http://linked.open...tniCyklusProjektu	ZBBKU
is http://linked.open...vavai/cep/projekt of	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GAP506%2F10%2F0421/2010/ico%3A00027162 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GAP506%2F10%2F0421/2011/ico%3A00027162 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GAP506%2F10%2F0421/2012/ico%3A00027162 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GAP506%2F10%2F0421/2013/ico%3A00027162 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GAP506%2F10%2F0421/2014/ico%3A00027162

Faceted Search & Find service v1.16.118 as of Jun 21 2024

Alternative Linked Data Documents: ODE Content Formats:

RDF

ODATA

Microdata

About

OpenLink Virtuoso version 07.20.3240 as of Jun 21 2024, on Linux (x86_64-pc-linux-gnu), Single-Server Edition (126 GB total memory, 58 GB memory in use)
Data on this page belongs to its respective rights holders.
Virtuoso Faceted Browser Copyright © 2009-2024 OpenLink Software