About: Taxonomic revision of the genera Anabaena and Aphanizomenon (cyanobacteria) based on complex phenotypic and molecular approach

Facets (new session)
Description
Metadata
Settings
- owl:sameAs
- Inference Rule:

About: Taxonomic revision of the genera Anabaena and Aphanizomenon (cyanobacteria) based on complex phenotypic and molecular approach Goto Sponge NotDistinct Permalink

An Entity of Type : http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/Projekt, within Data Space : linked.opendata.cz associated with source document(s)

Attributes	Values
rdf:type	http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/Projekt
rdfs:seeAlso	http://www.isvav.cz/projectDetail.do?rowId=GAP504/10/1501
Description	The proposed project is focused on the taxonomy and phylogenetic relationships of freshwater (planktonic and benthic) representatives of the genera Anabaena and Aphanizomenon using the polyphasic approach – i.e. combination of morphological, genetic and biochemical data. We want to stress detailed morphological description and documentation as the first step of work with the cyanobacterial strains. Besides 16S rRNA gene that has been already sequenced in most strains, we will sequence 23S rRNA gene, cpcBA, rpoB, rpoC1, rbcLX, and tufA regions and perform multi-locus analyses. Secondary metabolite production and fatty acid content will be also analyzed in the strains. The project is unique by extremely wide variety of cyanobacterial morphospecies, which will be used for the study. The unique fusion of the above-mentioned data will result in clarification of so far confused taxonomic situation within the important freshwater genera Anabaena and Aphanizomenon. (en) Navrhovaný projekt se zaměřuje na taxonomii a fylogenetické vztahy mezi sladkovodními (planktonními a bentickými) zástupci rodů Anabaena a Aphanizomenon studované polyfázickým přístupem – tj. kombinací morfologických, genetických a biochemických dat. Budeme klást důraz na detailní morfologický popis a dokumentaci jako první krok při práci s kmeny sinic. Kromě 16S rRNA genu, který už byl u většiny kmenů sekvenován, budeme sekvenovat 23S rRNA gen, cpcBA, rpoB, rpoC1, rbcLX, and tufA geny a provedeme tzv. multi-locus analýzu. U studovaných kmenů bude rovněž stanovena produkce sekundárních metabolitů a obsah mastných kyselin. Projekt je výjimečný širokou škálou morfotypů sinic, které budou použity pro tuto studii. Jedinečné propojení výše zmíněných dat umožní vyjasnit dosud nepřehlednou taxonomickou situaci u důležitých sladkovodních rodů Anabaena a Aphanizomenon.
Title	Taxonomic revision of the genera Anabaena and Aphanizomenon (cyanobacteria) based on complex phenotypic and molecular approach (en) Taxonomická revize rodů Anabaena a Aphanizomenon (sinice) založená na komplexním fenotypovém a molekulárním přístupu
skos:notation	GAP504/10/1501
http://linked.open...avai/cep/aktivita	Standard projects
http://linked.open...kovaStatniPodpora	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/projekt/GAP504%2F10%2F1501/celkovaStatniPodpora
http://linked.open...ep/celkoveNaklady	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/projekt/GAP504%2F10%2F1501/celkoveNaklady
http://linked.open...datumDodatniDoRIV	2014-01-30 (xsd:date)
http://linked.open...i/cep/druhSouteze	VS - Veřejná soutěž ve výzkumu a vývoji
http://linked.open...ep/duvernostUdaju	S - Úplné a pravdivé údaje nepodléhající ochraně podle zvláštních právních předpisů
http://linked.open.../cep/fazeProjektu	92542870
http://linked.open...ai/cep/hlavniObor	EH - Ekologie - společenstva
http://linked.open...hodnoceniProjektu	U - Uspěl podle zadání, tj. byly splněny cíle a jeho předpokládané výsledky uvedené ve smlouvě / rozhodnutí o poskytnutí podpory
http://linked.open...vai/cep/kategorie	ZV - Základní výzkum
http://linked.open.../cep/klicovaSlova	Anabaena; Aphanizomenon; cyanobacteria; taxonomy; classification; morphology; phylogeny; 16S; rRNA; gene; 23S; rRNA; gene; cpcBA-IGS; rpoB; rpoC1; rbcLX; secondary; metabolites; fatty; acids; polyphasic; approach (en)
http://linked.open...ep/partnetrHlavni	Biologické centrum AV ČR, v. v. i.
http://linked.open...inujicichPrijemcu	0 (xsd:int)
http://linked.open...cep/pocetPrijemcu	1 (xsd:int)
http://linked.open...ocetSpoluPrijemcu	0 (xsd:int)
http://linked.open.../pocetVysledkuRIV	5 (xsd:int)
http://linked.open...enychVysledkuVRIV	5 (xsd:int)
http://linked.open...lneniVMinulemRoce	2012-03-30 (xsd:date)
http://linked.open.../prideleniPodpory	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/prideleniPodpory/P504%2F10%2F1501
http://linked.open...iciPoslednihoRoku	2012
http://linked.open...atUdajeProjZameru	2013
http://linked.open.../vavai/cep/soutez	SGA02010GA-ST
http://linked.open...usZobrazovaneFaze	DUU
http://linked.open...ai/cep/typPojektu	P - Projekt výzkumu a vývoje financovaný ze státního rozpočtu
http://linked.open...ep/ukonceniReseni	2012-12-31 (xsd:date)
http://linked.open.../cep/vedlejsiObor	EB - Genetika a molekulární biologie EE - Mikrobiologie, virologie
http://linked.open...ep/zahajeniReseni	2010-01-01 (xsd:date)
http://linked.open...jektu+dodavatelem	Project was oriented on the ecology and taxonomy of selected cyanobacteria and by fulfilling its goals it contributed to the understanding of their diversity and ecology. There were five publications in total, out of which 4 were in IF journals, three of them in papers belonging to top 50% in their field. All publications have multiple dedications. (en) Projekt se zabýval ekologií a diverzitou sinic a přispěl k lepšímu vymezení jejich taxonomie i k porozumění jejich ekologické roli. Výstupem projektu jsou celkem čtyři publikace v časopisech s IF, z nichž tři patří mezi kvalitní (IF 2.5, 2.0, 1.8), dále byly výsledky publikovány v českém recenzovaném časopise. Všechny výsledky mají vícenásobné dedikace. (cs)
http://linked.open...tniCyklusProjektu	ZBKU
http://linked.open.../cep/klicoveSlovo	Anabaena 16S 23S Aphanizomenon acids classification cpcBA-IGS cyanobacteria fatty gene metabolites morphology phylogeny polyphasic rRNA rbcLX rpoB rpoC1 secondary taxonomy
is http://linked.open...vavai/cep/projekt of	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GAP504%2F10%2F1501/2010/ico%3A60077344 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GAP504%2F10%2F1501/2011/ico%3A60077344 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GAP504%2F10%2F1501/2012/ico%3A60077344 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GAP504%2F10%2F1501/2013/ico%3A60077344

Faceted Search & Find service v1.16.118 as of Jun 21 2024

Alternative Linked Data Documents: ODE Content Formats:

RDF

ODATA

Microdata

About

OpenLink Virtuoso version 07.20.3240 as of Jun 21 2024, on Linux (x86_64-pc-linux-gnu), Single-Server Edition (126 GB total memory, 58 GB memory in use)
Data on this page belongs to its respective rights holders.
Virtuoso Faceted Browser Copyright © 2009-2024 OpenLink Software