| Attributes | Values |
|---|
| rdf:type
| |
| rdfs:seeAlso
| |
| Description
| - Frequently, bacterial diversity is expressed in operational taxonomic units defined by 97, 98 or 99% of 16S rRNA sequence similarities. However, the functional and genetic diversity within such groups is largely unknown. It is thus not clear if such taxonomic groups contain strains behaving similarly or occupying completely separated ecological niches. The proposed project should focus on two important groups of freshwater bacteria and reveal the genetic and functional diversity inherent within these groups. The two investigated groups are represented by the Limnohabitans cluster and Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus cluster (both Betaproteobacteria). Both groups of bacteria represent numerically and ecologically important groups in the freshwater habitats. We aim on description of the distribution, phylogeography and genetic diversification of the two groups on the intra-specific level by means of designing specific probes targeted against different lineages and lineage groups as well as by conducting ecological niche-separation lab experiments. (en)
- Bakteriální diverzita je často vyjadřována pomocí tzv. operačních taxonomických jednotek, definovaných pomocí 97, 98 nebo 99% podobnosti sekvence bakteriální 16S rRNA. Funkční a genetická diverzita uvnitř těchto skupin je ovšem vesměs neznámá a nevíme ani, zda tyto skupiny obsahují bakteriální kmeny, které reagují podobně na faktory prostředí nebo okupují odlišné ekologické niky. Navrhovaný projekt by se měl zaměřit na dvě skupiny sladkovodních bakterií a odhalit genetické a funkční rozdíly uvnitř těchto skupin. Dvě navrhované skupiny jsou Limnohabitans klastr a Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus klastr (obě Betaproteobacteria). Obě skupiny představují numericky a ekologicky jedny z nejdůležitějších ve sladkovodních habitatech. Cílem projektu je zejména popsat distribuci, fylo-geografii a genetickou diverzitu obou skupin na vnitrodruhové úrovni pomocí navržených genetických sond určených na identifikaci jednotlivých genotypů nebo genotypových skupin a dále potvrdit či vyvrátit separaci ekologických nik uvnitř obou skupin pomocí laboratorních experimentů.
|
| Title
| - Distribution, phylogeography and within-taxon ecological differentiation of Limnohabitans cluster and Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus (en)
- Distribuce, fylo-geografie a vnitrodruhová ekologická diferenciace uvnitř klastru Limnohabitans a Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus
|
| skos:notation
| |
| http://linked.open...avai/cep/aktivita
| |
| http://linked.open...kovaStatniPodpora
| |
| http://linked.open...ep/celkoveNaklady
| |
| http://linked.open...datumDodatniDoRIV
| |
| http://linked.open...i/cep/druhSouteze
| |
| http://linked.open...ep/duvernostUdaju
| |
| http://linked.open.../cep/fazeProjektu
| |
| http://linked.open...ai/cep/hlavniObor
| |
| http://linked.open...hodnoceniProjektu
| |
| http://linked.open...vai/cep/kategorie
| |
| http://linked.open.../cep/klicovaSlova
| - distribution; phylogeography; limnohabitans; polynucleobacter; intra-specific; hybridization; protein-encoding; genes; lineage (en)
|
| http://linked.open...ep/partnetrHlavni
| |
| http://linked.open...inujicichPrijemcu
| |
| http://linked.open...cep/pocetPrijemcu
| |
| http://linked.open...ocetSpoluPrijemcu
| |
| http://linked.open.../pocetVysledkuRIV
| |
| http://linked.open...enychVysledkuVRIV
| |
| http://linked.open...lneniVMinulemRoce
| |
| http://linked.open.../prideleniPodpory
| |
| http://linked.open...iciPoslednihoRoku
| |
| http://linked.open...atUdajeProjZameru
| |
| http://linked.open.../vavai/cep/soutez
| |
| http://linked.open...usZobrazovaneFaze
| |
| http://linked.open...ai/cep/typPojektu
| |
| http://linked.open...ep/ukonceniReseni
| |
| http://linked.open.../cep/vedlejsiObor
| |
| http://linked.open...ep/zahajeniReseni
| |
| http://linked.open...jektu+dodavatelem
| - Projekt přinesl zajímavé výsledky o ekologii významných druhů bakterioplanktonu. Vzhledem k významu studovaných druhů to významně rozšiřuje poznatky o ekologii limnických systémů. Výstupem projektu jsou dvě publikace, jedna kvalitní, jedna vysoce kvalitní, obě s vícenásobnými dedikacemi. Další dva články jsou zaslány. Grant přispěl k výchově studentů. (cs)
- The project delivered interesting information on the ecology of important taxa of freshwater bacterioplancton and as such it contributed to the broader knowledge of ecology of limnic habitats. Students participated in the project. Project results were published in two papers, one in IF journal ranking among top 25% and another, ranking among top 50% in its field, both with multiple dedications. (en)
|
| http://linked.open...tniCyklusProjektu
| |
| http://linked.open.../cep/klicoveSlovo
| - distribution
- genes
- hybridization
- intra-specific
- limnohabitans
- phylogeography
- polynucleobacter
- protein-encoding
|
| is http://linked.open...vavai/cep/projekt
of | |
![[RDF Data]](/fct/images/sw-rdf-blue.png)
![[cxml]](/fct/images/cxml_doc.png)
![[csv]](/fct/images/csv_doc.png)
![[text]](/fct/images/ntriples_doc.png)
![[turtle]](/fct/images/n3turtle_doc.png)
![[ld+json]](/fct/images/jsonld_doc.png)
![[rdf+json]](/fct/images/json_doc.png)
![[rdf+xml]](/fct/images/xml_doc.png)
![[atom+xml]](/fct/images/atom_doc.png)
![[html]](/fct/images/html_doc.png)