About: Analysis of microbial communities from different aquatic habitats: specific transcriptomics in relation to pollution by volatile organic compounds     Goto   Sponge   NotDistinct   Permalink

An Entity of Type : http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/Projekt, within Data Space : linked.opendata.cz associated with source document(s)

AttributesValues
rdf:type
rdfs:seeAlso
Description
  • The project aims for a deeper understanding of the relationship between pollution by volatile organic compounds (VOCs) and the activity and biodiversity of microbial genes involved in biodegradation of halogenated VOCs and epoxides. This microbial ecology project links specific environmental transcriptomics of a microbial community with the VOC concentration level of a specific habitat. Contaminated and non-contaminated microbial habitats will be investigated for the presence of selected VOCs, and these results will be correlated with the analysis of microbial gene transcripts encoding haloalkane dehalogenases (HADs) and epoxide hydrolases (EHs), which are key enzymes in the biodegradation of halogenated VOCs and epoxides. The entire microbial community of such an investigated site will be analysed by the transcription level and diversity of genes encoding HADs and EHs, and 16S rRNA sequence determination. Our study will retrieve entire specific pro- and eukaryotic genes actively involved in biodegradation of halogenated VOCs and epoxides of a total environmental microbial community. (en)
  • Cílem projektu je hlubší porozumění vztahu mezi znečištěním těkavými organickými látkami (VOCs) a aktivitou a různorodostí mikrobiálních genů souvisejících s biodegradací halogenovaných VOCs a epoxidů. Tento projekt mikrobiální ekologie spojuje specifickou environmentální transkriptomiku mikrobiálního společenství s množstvím VOCs ve vodním prostředí. Kontaminovaná a nekontaminovaná mikrobiální prostředí budou prozkoumána na výskyt vybraných VOCs, a tyto výsledky budou porovnány s analýzou mikrobiálních transkriptů genů kódujících haloalkándehalogenasy a epoxidhydrolasy, což jsou klíčové enzymy při biodegradaci halogenovaných VOCs a epoxidů. Celková mikrobiální společenství prozkoumaných míst budou analyzována určením sekvencí 16S rRNA a síly transkripce a rozmanitosti genů kódujících haloalkándehalogenasy a epoxidhydrolasy. Pomocí naši studie získáme také celkové specifické prokaryotické a eukaryotické geny aktivně zapojené do biodegradace halogenovaných VOCs a epoxidů v celkovém environmentálním mikrobiálním společenství.
Title
  • Analysis of microbial communities from different aquatic habitats: specific transcriptomics in relation to pollution by volatile organic compounds (en)
  • Analýza mikrobiálních komunit z různých vodních prostředí: specifická transkriptomika ve vztahu k znečištění způsobenému těkavými organickými látkami
skos:notation
  • GAP504/10/0137
http://linked.open...avai/cep/aktivita
http://linked.open...kovaStatniPodpora
http://linked.open...ep/celkoveNaklady
http://linked.open...datumDodatniDoRIV
http://linked.open...i/cep/druhSouteze
http://linked.open...ep/duvernostUdaju
http://linked.open.../cep/fazeProjektu
http://linked.open...ai/cep/hlavniObor
http://linked.open...hodnoceniProjektu
http://linked.open...vai/cep/kategorie
http://linked.open.../cep/klicovaSlova
  • Microbial; ecology; biodegradation; environmental; transcriptomics (en)
http://linked.open...ep/partnetrHlavni
http://linked.open...inujicichPrijemcu
http://linked.open...cep/pocetPrijemcu
http://linked.open...ocetSpoluPrijemcu
http://linked.open.../pocetVysledkuRIV
http://linked.open...enychVysledkuVRIV
http://linked.open...lneniVMinulemRoce
http://linked.open.../prideleniPodpory
http://linked.open...iciPoslednihoRoku
http://linked.open...atUdajeProjZameru
http://linked.open.../vavai/cep/soutez
http://linked.open...usZobrazovaneFaze
http://linked.open...ai/cep/typPojektu
http://linked.open...ep/ukonceniReseni
http://linked.open...ep/zahajeniReseni
http://linked.open...jektu+dodavatelem
  • The aim of the project was the analysis of structure and functioning of natural bacterial communities from polluted sites. Both contaminants and microbial communities, plus sequences of the enzymes produced, were partly analysed. The project final report is comprehensive and adequate. (en)
  • Projekt se zabýval strukturou a funkcí přírodního bakteriálního společenstva na kontaminovaných. Byly částečně analyzovány kontaminující látky, pomocí moderních molekulárně biologických metod byly analyzovány přítomné miroorganismy a sekvence produkovaných enzymů. Závěrečná zpráva je přehledná a adekvátní. (cs)
http://linked.open...tniCyklusProjektu
http://linked.open.../cep/klicoveSlovo
  • biodegradation
  • ecology
  • environmental
  • Microbial
is http://linked.open...vavai/cep/projekt of
Faceted Search & Find service v1.16.118 as of Jun 21 2024


Alternative Linked Data Documents: ODE     Content Formats:   [cxml] [csv]     RDF   [text] [turtle] [ld+json] [rdf+json] [rdf+xml]     ODATA   [atom+xml] [odata+json]     Microdata   [microdata+json] [html]    About   
This material is Open Knowledge   W3C Semantic Web Technology [RDF Data] Valid XHTML + RDFa
OpenLink Virtuoso version 07.20.3240 as of Jun 21 2024, on Linux (x86_64-pc-linux-gnu), Single-Server Edition (126 GB total memory, 58 GB memory in use)
Data on this page belongs to its respective rights holders.
Virtuoso Faceted Browser Copyright © 2009-2024 OpenLink Software