About: Construction of a synthetic metabolic pathway for degradation of important environmental pollutant using protein and metabolic engineering

Facets (new session)
Description
Metadata
Settings
- owl:sameAs
- Inference Rule:

About: Construction of a synthetic metabolic pathway for degradation of important environmental pollutant using protein and metabolic engineering Goto Sponge NotDistinct Permalink

An Entity of Type : http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/Projekt, within Data Space : linked.opendata.cz associated with source document(s)

Attributes	Values
rdf:type	http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/Projekt
rdfs:seeAlso	http://www.isvav.cz/projectDetail.do?rowId=GAP503/12/0572
Description	Anthropogenic compound 1,2,3-trichloropropane (TCP) is released into the environment as a result of its manufacture and use as a solvent. Since its half-life under groundwater conditions is estimated to be up to 100 years, TCP is likely to persist for long period of time in the groundwater environment. TCP is very resistant to biodegradation, which can be attributed to a single biochemical step, lacking dehalogenase efficiently converting TCP to dichloropropanol. We have recently constructed dehalogenase with improved catalysis of this biochemical step (Pavlová et al. 2009, Nat. Chem. Biol. 5: 727-733). The objective of this project is to assemble entire biochemical pathway by cloning the genes optimized by protein engineering to native bacteria, leading to construction of TCP-degrading bacterium. This bacterium will grow on TCP as a sole carbon and energy source. To best of our knowledge, this bacterium will be the first example of a microorganism constructed by protein and matabolic engineering, applicable for the cleanup of contaminated water in the closed flow systems. (en) Antropogenní sloučenina 1,2,3-trichlorpropan (TCP) je uvolňována do životního prostředí v důsledku výroby a použití jako rozpouštědlo a extrakční činidlo. Poločas rozpadu může v podzemních podmínkách dosahovat až 100 let a TCP přetrvává v prostředí podzemních vod dlouhou dobu. TCP je velmi odolný vůči biodegradaci v důsledku absence dehalogenázy efektivně přeměňující TCP na dichlorpropanol. Proteinovým inženýrstvím a řízenou evolucí jsme nedávno zkonstruovali dehalogenázu s významně lepší katalýzou tohoto biochemického kroku (Pavlová et al. 2009, Nat. Chem. Biol. 5: 727-733). Cílem tohoto projektu je sestavit kompletní biochemickou dráhu klonováním genů enzymů optimalizovaných proteinovým inženýrstvím do přírodních bakterií, vedoucí ke konstrukci bakterie degradující TCP. Tato bakterie bude růst na TCP jako jediném zdroji uhlíku a energie. Podle našich informací bude tato bakterie prvním mikroorganismem zkonstruovaným proteinovým a matabolickým inženýrstvím, použitelným k čištění vod kontaminovaných antropogenní sloučeninou v uzavřených průtočných systémech.
Title	Construction of a synthetic metabolic pathway for degradation of important environmental pollutant using protein and metabolic engineering (en) Konstrukce syntetické metabolické dráhy pro degradaci důležitého environmentálního polutantu proteinovým a metabolickým inženýrstvím
skos:notation	GAP503/12/0572
http://linked.open...avai/cep/aktivita	Standard projects
http://linked.open...kovaStatniPodpora	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/projekt/GAP503%2F12%2F0572/celkovaStatniPodpora
http://linked.open...ep/celkoveNaklady	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/projekt/GAP503%2F12%2F0572/celkoveNaklady
http://linked.open...datumDodatniDoRIV	2015-04-23 (xsd:date)
http://linked.open...i/cep/druhSouteze	VS - Veřejná soutěž ve výzkumu a vývoji
http://linked.open...ep/duvernostUdaju	S - Úplné a pravdivé údaje nepodléhající ochraně podle zvláštních právních předpisů
http://linked.open.../cep/fazeProjektu	100781873
http://linked.open...ai/cep/hlavniObor	DJ - Znečištění a kontrola vody
http://linked.open...vai/cep/kategorie	ZV - Základní výzkum
http://linked.open.../cep/klicovaSlova	biodegradation environmental pollutant protein engineering synthetic biology 1,2,3-trichloropropane (en)
http://linked.open...ep/partnetrHlavni	Přírodovědecká fakulta
http://linked.open...inujicichPrijemcu	0 (xsd:int)
http://linked.open...cep/pocetPrijemcu	1 (xsd:int)
http://linked.open...ocetSpoluPrijemcu	0 (xsd:int)
http://linked.open.../pocetVysledkuRIV	17 (xsd:int)
http://linked.open...enychVysledkuVRIV	17 (xsd:int)
http://linked.open...lneniVMinulemRoce	2014-03-19 (xsd:date)
http://linked.open.../prideleniPodpory	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/prideleniPodpory/P503-12-0572
http://linked.open...iciPoslednihoRoku	2015
http://linked.open...atUdajeProjZameru	2015
http://linked.open.../vavai/cep/soutez	SGA02012GA-ST
http://linked.open...usZobrazovaneFaze	DRRVB
http://linked.open...ai/cep/typPojektu	P - Projekt výzkumu a vývoje financovaný ze státního rozpočtu
http://linked.open...ep/ukonceniReseni	2016-12-31 (xsd:date)
http://linked.open.../cep/vedlejsiObor	EI - Biotechnologie a bionika CE - Biochemie
http://linked.open...ep/zahajeniReseni	2012-01-01 (xsd:date)
http://linked.open...tniCyklusProjektu	ZBBB
http://linked.open.../cep/klicoveSlovo	2 biodegradation environmental pollutant protein engineering synthetic biology 1
is http://linked.open...vavai/cep/projekt of	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GAP503%2F12%2F0572/2012/orjk%3A14310 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GAP503%2F12%2F0572/2013/orjk%3A14310 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GAP503%2F12%2F0572/2014/orjk%3A14310 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GAP503%2F12%2F0572/2015/orjk%3A14310 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GAP503%2F12%2F0572/2016/orjk%3A14310

Faceted Search & Find service v1.16.118 as of Jun 21 2024

Alternative Linked Data Documents: ODE Content Formats:

RDF

ODATA

Microdata

About

OpenLink Virtuoso version 07.20.3240 as of Jun 21 2024, on Linux (x86_64-pc-linux-gnu), Single-Server Edition (126 GB total memory, 38 GB memory in use)
Data on this page belongs to its respective rights holders.
Virtuoso Faceted Browser Copyright © 2009-2024 OpenLink Software