About: Interactions of mutant forms of cryptogein with a membrane binding site: biosensors-based characterisation

Facets (new session)
Description
Metadata
Settings
- owl:sameAs
- Inference Rule:

About: Interactions of mutant forms of cryptogein with a membrane binding site: biosensors-based characterisation Goto Sponge NotDistinct Permalink

An Entity of Type : http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/Projekt, within Data Space : linked.opendata.cz associated with source document(s)

Attributes	Values
rdf:type	http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/Projekt
rdfs:seeAlso	http://www.isvav.cz/projectDetail.do?rowId=GAP501/11/1003
Description	Elicitins, a family of low molecular weight proteins secreted by many species of the oomycete Phytophthora that are devastating for agriculture and natural ecosystems, induce a defence response in tobacco. Cryptogein is a 98-amino acid proteinaceous 10 kDa elicitor produced by the phytoparasite Phytophthora cryptogea. Processes involved in defence reaction triggered by cryptogein were quite well characterised; however one of the most important events during the interaction, recognition of elicitins by high affinity binding site on plasma membrane has not been fully described up to now. The proposed project is focused on elucidation of interactions of elicitins in plant model organisms on the molecular level. A special acidic variant of elicitin cryptogein B20 will be used to allow specific orientated immobilisation of proteins to biosensor chips used for real time monitoring of interactions. Two measuring platforms, Biacore 3000 system and piezoelectric sensor will be used. An attempt to isolate the high affinity binding site will be done as well. (en) Elicitiny patří do rodiny nízkomolekulárních proteinů sekretovaných celou řadou druhů oomycety Phytophtora, která vykazuje devastující účinky v zemědělství a přírodních ekosystémech. U tabáku vyvolávají obranou reakci. Kryptogein je 10 kDa elicitor uvolňovaný fytoparazitem Phytophtora cryptogea. Byly již velmi dobře popsány procesy v rámci obranné reakce vyvolané aplikací kryptogeinu, avšak vlastní interakce elicitinů s vysokoafinitním místem v plasmatické membráně nebyla ještě zcela popsána. Navrhovaný projekt je zaměřen právě na objasnění interakce mezi elicitinem a vysokoafinitním místem na molekulární úrovni. Pro specificky orientovanou imobilizaci na čip bude použita speciální kyselá varianta kryptogeinu B20. Ke sledování interakce v reálném čase budou využity pokrokové měřící techniky na bázi biosensorů, SPR systém Biacore 3000 a piezoelektrický biosensor. Rovněž bude proveden pokus o izolaci tohoto vysokoafinitního místa.
Title	Interactions of mutant forms of cryptogein with a membrane binding site: biosensors-based characterisation (en) Interakce mutantních forem cryptogeinu s membránovým vazebným místem: charakterizace pomocí biosensorů
skos:notation	GAP501/11/1003
http://linked.open...avai/cep/aktivita	Standard projects
http://linked.open...kovaStatniPodpora	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/projekt/GAP501%2F11%2F1003/celkovaStatniPodpora
http://linked.open...ep/celkoveNaklady	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/projekt/GAP501%2F11%2F1003/celkoveNaklady
http://linked.open...datumDodatniDoRIV	2015-04-23 (xsd:date)
http://linked.open...i/cep/druhSouteze	VS - Veřejná soutěž ve výzkumu a vývoji
http://linked.open...ep/duvernostUdaju	S - Úplné a pravdivé údaje nepodléhající ochraně podle zvláštních právních předpisů
http://linked.open.../cep/fazeProjektu	100779241
http://linked.open...ai/cep/hlavniObor	CE - Biochemie
http://linked.open...vai/cep/kategorie	ZV - Základní výzkum
http://linked.open.../cep/klicovaSlova	elicitin affinity interaction piezoelectric biosensor surface plasmon resonance (en)
http://linked.open...neniPrubehuReseni	Deferred Final Report (en) Odložená závěrečná zpráva (cs)
http://linked.open...ep/partnetrHlavni	Přírodovědecká fakulta
http://linked.open...inujicichPrijemcu	0 (xsd:int)
http://linked.open...cep/pocetPrijemcu	1 (xsd:int)
http://linked.open...ocetSpoluPrijemcu	0 (xsd:int)
http://linked.open.../pocetVysledkuRIV	2 (xsd:int)
http://linked.open...enychVysledkuVRIV	2 (xsd:int)
http://linked.open...lneniVMinulemRoce	2014-03-19 (xsd:date)
http://linked.open.../prideleniPodpory	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/prideleniPodpory/P501-11-1003
http://linked.open...iciPoslednihoRoku	2015
http://linked.open...atUdajeProjZameru	2015
http://linked.open.../vavai/cep/soutez	SGA02011GA-ST
http://linked.open...usZobrazovaneFaze	DRP
http://linked.open...ai/cep/typPojektu	P - Projekt výzkumu a vývoje financovaný ze státního rozpočtu
http://linked.open...ep/ukonceniReseni	2016-12-31 (xsd:date)
http://linked.open.../cep/vedlejsiObor	GF - Choroby, škůdci, plevely a ochrana rostlin EB - Genetika a molekulární biologie
http://linked.open...ep/zahajeniReseni	2011-01-01 (xsd:date)
http://linked.open...tniCyklusProjektu	ZBBKP
is http://linked.open...vavai/cep/projekt of	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GAP501%2F11%2F1003/2015/orjk%3A14310 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GAP501%2F11%2F1003/2016/orjk%3A14310 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GAP501%2F11%2F1003/2011/orjk%3A14310 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GAP501%2F11%2F1003/2012/orjk%3A14310 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GAP501%2F11%2F1003/2013/orjk%3A14310 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GAP501%2F11%2F1003/2014/orjk%3A14310

Faceted Search & Find service v1.16.118 as of Jun 21 2024

Alternative Linked Data Documents: ODE Content Formats:

RDF

ODATA

Microdata

About

OpenLink Virtuoso version 07.20.3240 as of Jun 21 2024, on Linux (x86_64-pc-linux-gnu), Single-Server Edition (126 GB total memory, 58 GB memory in use)
Data on this page belongs to its respective rights holders.
Virtuoso Faceted Browser Copyright © 2009-2024 OpenLink Software