About: Fine Mapping and Candidate Gene Analysis of the Flowering Time Gene on Wheat     Goto   Sponge   NotDistinct   Permalink

An Entity of Type : http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/Projekt, within Data Space : linked.opendata.cz associated with source document(s)

AttributesValues
rdf:type
rdfs:seeAlso
Description
  • Genes controlling flowering time in wheat (Vrn, Ppd, Eps) are of essential importance for optimizing adaptation and hence yield. A new flowering time gene QFt.cri-3B.1 was genetically mapped on the long arm of wheat chromosome 3B near the SSR marker Xbarc164 on Crop Research Institute. The present project proposal, targeted at more detailed analysis of this gene, includes fine mapping of the gene both genetically and physically and the identification of possible candidate genes, as a preliminary to cloning the gene and the study its function, as well as a more detailed phenotyping to study effects of the gene on wheat growth and development. Chromosome deletion lines will be used for chromosome 3B bin mapping; F2 populations developed from near-isogenic lines will be analysed for fine mapping; comparative mapping of the wheat genomic region containing the gene will be done with Brachypodium and rice. A local contig will be developed for the region of interest in cv. Chinese Spring using available physical map of chromosome 3B  and specific BAC resources. A BAC library specific for 3B of cv. Česká Přesívka will be developed and clones containing candidate genes will be identified and sequenced. The long-term goal of this project is the identification of a candidate gene for QFt.cri-3B.1. (en)
  • Geny ovlivňující dobu kvetení u pšenice (Vrn, Ppd, Eps) hrají důležitou roli při adaptaci a ovlivňují výnos. Na pracovišti VÚRV byl geneticky mapován nový gen kvetení QFt.cri-3B.1 na dlouhém rameni chromosomu 3B v blízkosti SSR markeru Xbarc164. Navrhovaný projekt je zaměřen na podrobnější analýzu tohoto genu a zahrnuje přesné mapování jako předpoklad pro jeho klonování a studium jeho funkce a rovněž analýzu fenotypu s cílem charakterizovat vliv genu na růst a vývoj pšenice. Pro tzv. bin mapování budou použity chromosomové deleční linie; pro genetické mapování budou použity F2 populace odvozené z tzv. NIL linií; srovnávací analýzy budou prováděny s geonomy Brachypodia a rýže. Lokální kontig bude sestaven v oblasti genu s použitím fyzické mapy a BAC knihovny specifické pro chromosom 3B kultivaru Chinese Spring. Dále bude připravena nová BAC knihovna specifická pro chromosom 3B kultivaru Česká Přesívka a klony s kandidátními geny budou identifikovány a sekvenovány. Dlouhodobým cílem projektu je identifikace kandidátního genu pro QFt.cri-3B.1.
Title
  • Fine Mapping and Candidate Gene Analysis of the Flowering Time Gene on Wheat (en)
  • Přesné mapování a identifikace kandidátního genu ovlivňujícího dobu kvetení pšenice
skos:notation
  • GAP501/10/1778
http://linked.open...avai/cep/aktivita
http://linked.open...kovaStatniPodpora
http://linked.open...ep/celkoveNaklady
http://linked.open...datumDodatniDoRIV
http://linked.open...i/cep/druhSouteze
http://linked.open...ep/duvernostUdaju
http://linked.open.../cep/fazeProjektu
http://linked.open...ai/cep/hlavniObor
http://linked.open...hodnoceniProjektu
http://linked.open...vai/cep/kategorie
http://linked.open.../cep/klicovaSlova
  • wheat flowering time fine mapping chromosom 3B (en)
http://linked.open...ep/partnetrHlavni
http://linked.open...inujicichPrijemcu
http://linked.open...cep/pocetPrijemcu
http://linked.open...ocetSpoluPrijemcu
http://linked.open.../pocetVysledkuRIV
http://linked.open...enychVysledkuVRIV
http://linked.open...lneniVMinulemRoce
http://linked.open.../prideleniPodpory
http://linked.open...iciPoslednihoRoku
http://linked.open...atUdajeProjZameru
http://linked.open.../vavai/cep/soutez
http://linked.open...usZobrazovaneFaze
http://linked.open...ai/cep/typPojektu
http://linked.open...ep/ukonceniReseni
http://linked.open.../cep/vedlejsiObor
http://linked.open...ep/zahajeniReseni
http://linked.open...jektu+dodavatelem
  • Exact mapping of QFt.cri-3B.1 gene using mainly SNP markers was performed. It enables future cloning of this gene modulating flowering in wheat. Using generated wheat genotypes plant microphenology and fuction of this gene was studied. Work was published in two impact publications, review and book chapter. The goals were fullfilled, budget changes were substantiated. (en)
  • Byl podrobně mapován zejména pomocí SNP márkerů lokus genu malého účinku QFt.cri-3B.1, který moduluje kvetení u pšenice, což umožní jeho následné klonování. S použitím získaných genotypů byly studovány mikrofenotypické charakteristiky působení uvedeného lokusu. Cíle byly splněny, práce byla publikována ve dvou impaktových článcích, review a kapitole v knize. Rozpočtové změny byly odůvodněny. (cs)
http://linked.open...tniCyklusProjektu
is http://linked.open...vavai/cep/projekt of
Faceted Search & Find service v1.16.118 as of Jun 21 2024


Alternative Linked Data Documents: ODE     Content Formats:   [cxml] [csv]     RDF   [text] [turtle] [ld+json] [rdf+json] [rdf+xml]     ODATA   [atom+xml] [odata+json]     Microdata   [microdata+json] [html]    About   
This material is Open Knowledge   W3C Semantic Web Technology [RDF Data] Valid XHTML + RDFa
OpenLink Virtuoso version 07.20.3240 as of Jun 21 2024, on Linux (x86_64-pc-linux-gnu), Single-Server Edition (126 GB total memory, 94 GB memory in use)
Data on this page belongs to its respective rights holders.
Virtuoso Faceted Browser Copyright © 2009-2024 OpenLink Software