About: Identification and localization of protein complexes involved in the regulation of chlorophyll biosynthesis     Goto   Sponge   NotDistinct   Permalink

An Entity of Type : http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/Projekt, within Data Space : linked.opendata.cz associated with source document(s)

AttributesValues
rdf:type
rdfs:seeAlso
Description
  • Chlorophyll (Chl) and heme are produced via a common branched pathway that has to be tightly regulated as many tetrapyrroles are phototoxic and the demand for heme or Chl varies according to development or light conditions. To understand how the cell controls the Chl metabolism we need to proceed from a simple scheme of the Chl biosynthesis with arrows and chemical formulae to a more realistic picture with enzymes assembled into protein complexes and located in subcellular compartments. Using a strain library of cyanobacterium Synechocystis 6803 with each particular enzyme of the Chl biosynthesis fused with the 3xFLAG tag we will systematically map protein-protein interactions involved in this metabolic pathway. This approach enables a) to purify all enzymes under native conditions and identify their partners in putative protein complexes; b) to localize enzymes including identification of subcellular-specific complexes. In the latter stage of the project, promising identified proteins will be characterized in detail using biochemical and genetics methods with regard of its regulatory role in Chl biosynthesis. (en)
  • Chlorofyl (Chl) je spolu s hemem syntetizován v jediné větvené dráze, která musí být přesně regulovaná s ohledem na fototoxicitu metabolitů a velmi odlišnou potřebu hemu a Chl za různých růstových podmínek. K pochopení regulace takto komplexní metabolické dráhy bude nutné postoupit od statického modelu (šipkami propojené enzymatické přeměny) ke skutečné lokalizaci jednotlivých enzymů v buňce, identifikaci interagujících proteinů a proteinových komplexů. V tomto projektu budeme systematicky mapovat proteinové interakce enzymů syntézy Chl. Využijeme knihovnu kmenů sinice Synechocystis 6803, kde jsou jednotlivé enzymy této dráhy exprimovány s 3xFLAG kotvou. Tento přístup umožní a) purifikaci enzymů za nativních podmínek a identifikaci interagujících proteinů b) lokalizaci enzymů v rámci buňky a případnou identifikaci kompartment-specifických komplexů. V pozdější fázi projektu budou identifikované proteiny  detailně charakterizovány pomocí biochemických a genetických metod s cílem objasnit jejich regulační funkci v syntéze Chl .
Title
  • Identification and localization of protein complexes involved in the regulation of chlorophyll biosynthesis (en)
  • Identifikace a lokalizace proteinových komplexů, které se podílejí na regulaci biosyntézy chlorofylu
skos:notation
  • GAP501/10/1000
http://linked.open...avai/cep/aktivita
http://linked.open...kovaStatniPodpora
http://linked.open...ep/celkoveNaklady
http://linked.open...datumDodatniDoRIV
http://linked.open...i/cep/druhSouteze
http://linked.open...ep/duvernostUdaju
http://linked.open.../cep/fazeProjektu
http://linked.open...ai/cep/hlavniObor
http://linked.open...hodnoceniProjektu
http://linked.open...vai/cep/kategorie
http://linked.open.../cep/klicovaSlova
  • Chlorophyll Tetrapyrrole biosynthesis Synechocystis 6803 Protein purification (en)
http://linked.open...ep/partnetrHlavni
http://linked.open...inujicichPrijemcu
http://linked.open...cep/pocetPrijemcu
http://linked.open...ocetSpoluPrijemcu
http://linked.open.../pocetVysledkuRIV
http://linked.open...enychVysledkuVRIV
http://linked.open...lneniVMinulemRoce
http://linked.open.../prideleniPodpory
http://linked.open...iciPoslednihoRoku
http://linked.open...atUdajeProjZameru
http://linked.open.../vavai/cep/soutez
http://linked.open...usZobrazovaneFaze
http://linked.open...ai/cep/typPojektu
http://linked.open...ep/ukonceniReseni
http://linked.open.../cep/vedlejsiObor
http://linked.open...ep/zahajeniReseni
http://linked.open...jektu+dodavatelem
  • Řešení projektu bylo zaměřeno na analýzu protein-proteinových interakcí v biosyntetické dráze chlorofylu u modelové sinice Synechocystis a byly získány nové výsledky, které přispěly k objasnění mechanismů regulace metabolismu chlorofylu. Výsledky byly publikovány v 7 příspěvcích v kvalitních vědeckých časopisech (4 z nich ve špičkových časopisech s IF>5, 3x Plant Physiol, 1x Curr Opin Plant Biol). (cs)
  • Project solution was focused on the analysis of protein-protein interactions in the chlorophyll biosynthetic pathway in model cyanobacterium Synechocystis and a progress in unravelling the mechanisms of chlorophyll metabolism regulation has been achieved. Results were published in 7 papers in high standard journals (4 in the top journals with IF > 5, 3x Plant Physiol, 1x Curr Opin Plant Biol). (en)
http://linked.open...tniCyklusProjektu
is http://linked.open...vavai/cep/projekt of
Faceted Search & Find service v1.16.118 as of Jun 21 2024


Alternative Linked Data Documents: ODE     Content Formats:   [cxml] [csv]     RDF   [text] [turtle] [ld+json] [rdf+json] [rdf+xml]     ODATA   [atom+xml] [odata+json]     Microdata   [microdata+json] [html]    About   
This material is Open Knowledge   W3C Semantic Web Technology [RDF Data] Valid XHTML + RDFa
OpenLink Virtuoso version 07.20.3240 as of Jun 21 2024, on Linux (x86_64-pc-linux-gnu), Single-Server Edition (126 GB total memory, 41 GB memory in use)
Data on this page belongs to its respective rights holders.
Virtuoso Faceted Browser Copyright © 2009-2025 OpenLink Software