About: Comparative Analysis of Plant Sex Chromosomes     Goto   Sponge   NotDistinct   Permalink

An Entity of Type : http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/Projekt, within Data Space : linked.opendata.cz associated with source document(s)

AttributesValues
rdf:type
rdfs:seeAlso
Description
  • Plant sex chromosomes are rarely heteromorphic and they seem to be evolutionary younger compared to most animal species. So when studying the structure and evolution of plant sex chromosomes we can analyse the first steps in evolution of human sex chromosomes. We have already characterised the sex chromosomes of Silene latifolia and well documented that the Y accumulates many types of repetitive sequences. There are two Y chromosomes in males of Rumex acetosa and appear to be heterochromatic and probably of an older evolutionary age. In this project we want to globally characterise the sorrel genome using the 454-sequencing strategy, and using BAC library and laser microdissection we will isolate some X-linked genes and look for their Y-alleles. The aim of this work is to functionally analyse  X- and Y-linked genes in both experimental plant models (campion and sorrel) in order to demonstrate (a) a different extent of degeneration of the Y chromosome(s), (b) to compare gene expression in different sexes, and (c) to indicate a hypothetical dosage compensation system. (en)
  • Studium evolučně mladých pohlavních chromozomů rostlin představuje objasňování časných stádií vývoje chromozomů člověka. Tento projekt navazuje na dosavadní výsledky naší laboratoře, kdy jsme provedli strukturní a cytogenetickou analýzu pohlavních chromozomů Silene latifolia. Pohlavní chromozomy Rumex acetosa jsou zjevně fylogeneticky starší a mají heterochromatický charakter. Metodou 454-sekvenování provedeme základní charakteristiku samčího a samičího genomu R. acetosa a pomocí laserového mikromanipulátoru připravíme DNA-knihovny pohlavních chromozomů. Analýzou X-knihovny připravíme genové sekvence a budeme hledat jejich alely na chromozomech Y. Předpokládáme, že u R. acetosa došlo k rozsáhlejším degenerativním změnám než u S. latifolia. Kvantitativní RT-PCR analýza genové exprese u obou modelů by měla odhalit (a) rozdíly v expresi X- a Y-vázaných alel, (b) rozdíly v expresi těchto genů u odlišných pohlaví a (c) rozdíly v různě starých fylogenetických systémech pohlavních chromozomů.
Title
  • Comparative Analysis of Plant Sex Chromosomes (en)
  • Srovnávací analýza pohlavních chromozomů rostlin
skos:notation
  • GAP501/10/0102
http://linked.open...avai/cep/aktivita
http://linked.open...kovaStatniPodpora
http://linked.open...ep/celkoveNaklady
http://linked.open...datumDodatniDoRIV
http://linked.open...i/cep/druhSouteze
http://linked.open...ep/duvernostUdaju
http://linked.open.../cep/fazeProjektu
http://linked.open...ai/cep/hlavniObor
http://linked.open...hodnoceniProjektu
http://linked.open...vai/cep/kategorie
http://linked.open.../cep/klicovaSlova
  • sex chromosomes dioecious plants,structure physical mapping gene expression (en)
http://linked.open...ep/partnetrHlavni
http://linked.open...inujicichPrijemcu
http://linked.open...cep/pocetPrijemcu
http://linked.open...ocetSpoluPrijemcu
http://linked.open.../pocetVysledkuRIV
http://linked.open...enychVysledkuVRIV
http://linked.open...lneniVMinulemRoce
http://linked.open.../prideleniPodpory
http://linked.open...iciPoslednihoRoku
http://linked.open...atUdajeProjZameru
http://linked.open.../vavai/cep/soutez
http://linked.open...usZobrazovaneFaze
http://linked.open...ai/cep/typPojektu
http://linked.open...ep/ukonceniReseni
http://linked.open.../cep/vedlejsiObor
http://linked.open...ep/zahajeniReseni
http://linked.open...jektu+dodavatelem
  • Projekt mimořádně přispěl k základnímu výzkumu rostlin studiem komplexních aspektů organizace sex chromozómů u S. lativolia a R. acetosa jako dimofismus, zjištění plastidové DNA v chromozómu Y, absence retroelementů na Y chromozómu jako epigenetická adaptace, distribuce repetetivních sekvencí. Cíle projektu byl zcela splněny. Bylo publikováno celekm 14 impaktových prací a jedna knižní publikace. (cs)
  • The project successfully studied several complex aspects on S. latifolia and R. acetosa sex chromosomes like dimophism, repetitive sequences, distribution of plastid DNA in Y chromosome, absence of retroelements in Y chromosome as epigenetic mechanism. The taks of the project was fully accomplished. Based on this project, 14 impact papers and one book publication were published. (en)
http://linked.open...tniCyklusProjektu
http://linked.open.../cep/klicoveSlovo
  • sex chromosomes dioecious plants
is http://linked.open...vavai/cep/projekt of
Faceted Search & Find service v1.16.118 as of Jun 21 2024


Alternative Linked Data Documents: ODE     Content Formats:   [cxml] [csv]     RDF   [text] [turtle] [ld+json] [rdf+json] [rdf+xml]     ODATA   [atom+xml] [odata+json]     Microdata   [microdata+json] [html]    About   
This material is Open Knowledge   W3C Semantic Web Technology [RDF Data] Valid XHTML + RDFa
OpenLink Virtuoso version 07.20.3240 as of Jun 21 2024, on Linux (x86_64-pc-linux-gnu), Single-Server Edition (126 GB total memory, 25 GB memory in use)
Data on this page belongs to its respective rights holders.
Virtuoso Faceted Browser Copyright © 2009-2024 OpenLink Software