About: Intramembránové proteasy rodiny rhomboidů – specifita, mechanismus a identifikace substrátů jako klíč k jejich biologickým rolím.

Facets (new session)
Description
Metadata
Settings
- owl:sameAs
- Inference Rule:

About: Intramembránové proteasy rodiny rhomboidů – specifita, mechanismus a identifikace substrátů jako klíč k jejich biologickým rolím. Goto Sponge NotDistinct Permalink

An Entity of Type : http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/Projekt, within Data Space : linked.opendata.cz associated with source document(s)

Attributes	Values
rdf:type	http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/Projekt
rdfs:seeAlso	http://www.isvav.cz/projectDetail.do?rowId=GAP305/11/1886
Description	Rhomboids are intramembrane proteases that are known to control developmental signalling, mitochondrial dynamics and pathogenicity of the malaria parasite. Although widely conserved in evolution, their functions in most organisms including mammals and bacteria are unknown, and their substrate specificity and mechanism are poorly understood. Substrates are the keys to their biological roles. As an approach to substrate identification we will use mutagenesis of model substrates, enzymatic analysis and X-ray crystallography to decipher specificity of representative bacterial rhomboids chosen based on phylogenetic and genomic analysis. This will enable genome-wide prediction of their candidate substrates. Subsequent biochemical and genetic analysis of these substrates in model bacteria will reveal the biology of the respective rhomboids. This approach will elucidate substrate specificity and mechanism of rhomboids and their diversity, and provide a platform for rhomboid substrate discovery extendable to other bacterial species including pathogens. (en) Rhomboidy jsou intramembránové proteasy, které kontrolují vývojovou signalizaci, dynamiku mitochondrií a pathogenicitu parazita způsobujícího malárii. Jsou silně konservovány v evoluci, ale jejich funkce ve většině organismů včetně savců a bakterií jsou neznámé a jejich substrátová specifita a mechanismus nejasné. Substráty jsou klíčem k jejich biologickým rolím. Abychom je nalezli, nejprve pomocí mutageneze modelových substrátů, enzymologické a rentgenostrukturní analysy prostudujeme specifitu representativních bakteriálních rhomboidů vybraných na základě fylogenetického a genomického rozboru. To nám umožní predikovat jejich kandidátní substráty na úrovni celých genomů. Následná biochemická a genetická analysa těchto substrátů ve dvou modelových bakteriálních druzích odhalí biologii příslušných bakteriálních rhomboidů. Tento přístup objasní specifitu a mechanismus rhomboidů a jeho diversitu a poskytne platformu pro identifikaci jejich substrátů u ostatních bakteriálních druhů včetně pathogenů.
Title	Intramembránové proteasy rodiny rhomboidů – specifita, mechanismus a identifikace substrátů jako klíč k jejich biologickým rolím. Intramembrane proteases of rhomboid family – specificity, mechanism, and substrate identification as a key to their biological roles. (en)
skos:notation	GAP305/11/1886
http://linked.open...avai/cep/aktivita	Standard projects
http://linked.open...kovaStatniPodpora	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/projekt/GAP305%2F11%2F1886/celkovaStatniPodpora
http://linked.open...ep/celkoveNaklady	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/projekt/GAP305%2F11%2F1886/celkoveNaklady
http://linked.open...datumDodatniDoRIV	2015-04-23 (xsd:date)
http://linked.open...i/cep/druhSouteze	VS - Veřejná soutěž ve výzkumu a vývoji
http://linked.open...ep/duvernostUdaju	S - Úplné a pravdivé údaje nepodléhající ochraně podle zvláštních právních předpisů
http://linked.open.../cep/fazeProjektu	100775177
http://linked.open...ai/cep/hlavniObor	CE - Biochemie
http://linked.open...vai/cep/kategorie	ZV - Základní výzkum
http://linked.open.../cep/klicovaSlova	intramembrane proteolysis membrane protein substrate specificity Bacillus subtilis (en)
http://linked.open...ep/partnetrHlavni	Ústav organické chemie a biochemie AV ČR, v. v. i.
http://linked.open...inujicichPrijemcu	0 (xsd:int)
http://linked.open...cep/pocetPrijemcu	1 (xsd:int)
http://linked.open...ocetSpoluPrijemcu	0 (xsd:int)
http://linked.open.../pocetVysledkuRIV	3 (xsd:int)
http://linked.open...enychVysledkuVRIV	3 (xsd:int)
http://linked.open.../prideleniPodpory	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/prideleniPodpory/P305-11-1886
http://linked.open...iciPoslednihoRoku	2015
http://linked.open...atUdajeProjZameru	2015
http://linked.open.../vavai/cep/soutez	SGA02011GA-ST
http://linked.open...usZobrazovaneFaze	DRRVK
http://linked.open...ai/cep/typPojektu	P - Projekt výzkumu a vývoje financovaný ze státního rozpočtu
http://linked.open...ep/ukonceniReseni	2015-12-31 (xsd:date)
http://linked.open.../cep/vedlejsiObor	EB - Genetika a molekulární biologie EE - Mikrobiologie, virologie
http://linked.open...ep/zahajeniReseni	2011-01-01 (xsd:date)
http://linked.open...tniCyklusProjektu	ZBKPK
is http://linked.open...vavai/cep/projekt of	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GAP305%2F11%2F1886/2011/ico%3A61388963 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GAP305%2F11%2F1886/2012/ico%3A61388963 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GAP305%2F11%2F1886/2013/ico%3A61388963 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GAP305%2F11%2F1886/2014/ico%3A61388963 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GAP305%2F11%2F1886/2015/ico%3A61388963

Faceted Search & Find service v1.16.118 as of Jun 21 2024

Alternative Linked Data Documents: ODE Content Formats:

RDF

ODATA

Microdata

About

OpenLink Virtuoso version 07.20.3240 as of Jun 21 2024, on Linux (x86_64-pc-linux-gnu), Single-Server Edition (126 GB total memory, 58 GB memory in use)
Data on this page belongs to its respective rights holders.
Virtuoso Faceted Browser Copyright © 2009-2024 OpenLink Software