About: Molekulární podstata genově specifického mechanismu translační kontroly kvasinkového genu GCN4, a genu jeho savčího funkčního homologa ATF4.

Facets (new session)
Description
Metadata
Settings
- owl:sameAs
- Inference Rule:

About: Molekulární podstata genově specifického mechanismu translační kontroly kvasinkového genu GCN4, a genu jeho savčího funkčního homologa ATF4. Goto Sponge NotDistinct Permalink

An Entity of Type : http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/Projekt, within Data Space : linked.opendata.cz associated with source document(s)

Attributes	Values
rdf:type	http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/Projekt
rdfs:seeAlso	http://www.isvav.cz/projectDetail.do?rowId=GAP305/11/0172
Description	Exploration of translational control mechanisms provides important insight into regulation of cellular processes such as proliferation, differentiation and apoptosis. We are interested in one such a mechanism called reinitiation (REI) operating in a gene-specific manner. It is based on an ability of the 40S ribosome to resume scanning after translation of a short upstream open reading frame (uORF) for reinitiation at a downstream start codon. The yeast transcription factor GCN4 and its mammalian functional homologue ATF4, both of which are expressed in response to amino acid starvation, undoubtedly provide the best studied examples of REI. The 5’ leader of their mRNAs contains 4 or 2 uORFs, respectively, that together orchestrate a sophisticated regulatory system that is dependent on the availability of the eIF2•GTP•tRNAiMet ternary complex. We wish to investigate 1) a molecular mechanism by which especially uORF1 of both genes enables resumption of scanning of post-termination ribosomes and 2) whether the 3’ UTR of GCN4 also contributes to the overall regulation of its expression. (en) Výzkum regulačních mechanismů translace nám poskytuje důležitý vhled do strategií, jimiž jsou v buňce řízeny procesy proliferace, diferenciace, apoptózy apod. My se zabýváme studiem regulačního mechanismu zvaného reiniciace, který pracuje na úrovni jednotlivých genů. Spočívá ve schopnosti 40S ribozómu obnovit proces skenování po právě dokončené translaci krátkého čtecího rámce (uORF) za účelem reiniciace na downstream start tripletu. Kvasinkový transkripční faktor GCN4 a jeho lidský funkční homolog ATF4, jejichž exprese je spuštěna jako odpověď na hladovění na aminokyseliny, bezpochyby představují dva nejlépe prostudované příklady reiniciace. 5’ netranslatovaná oblast jejich mRNA v sobě nese 4 popřípadě 2 uORF, které dohromady řídí velmi komplexní regulační systém jenž je závislý na dostupnosti eIF2•GTP•tRNAiMet ternárního komplexu v buňce. Naším cílem je 1) popsat molekulární mechanismus, kterým zejména uORF1 obou genů zajišťuje znovu započetí skenování post-terminujících ribozómů, a 2) zjistit, zda se 3’ netranslatovaná oblast GCN4 rovněž podílí na celkové regulaci exprese GCN4.
Title	Molekulární podstata genově specifického mechanismu translační kontroly kvasinkového genu GCN4, a genu jeho savčího funkčního homologa ATF4. Molecular basis of the gene-specific translational control mechanism of yeast GCN4 and its mammalian functional homologue ATF4. (en)
skos:notation	GAP305/11/0172
http://linked.open...avai/cep/aktivita	Standard projects
http://linked.open...kovaStatniPodpora	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/projekt/GAP305%2F11%2F0172/celkovaStatniPodpora
http://linked.open...ep/celkoveNaklady	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/projekt/GAP305%2F11%2F0172/celkoveNaklady
http://linked.open...datumDodatniDoRIV	2015-04-23 (xsd:date)
http://linked.open...i/cep/druhSouteze	VS - Veřejná soutěž ve výzkumu a vývoji
http://linked.open...ep/duvernostUdaju	S - Úplné a pravdivé údaje nepodléhající ochraně podle zvláštních právních předpisů
http://linked.open.../cep/fazeProjektu	100774208
http://linked.open...ai/cep/hlavniObor	EB - Genetika a molekulární biologie
http://linked.open...vai/cep/kategorie	ZV - Základní výzkum
http://linked.open.../cep/klicovaSlova	gene expression translational control reinitiation ribosome GCN4 ATF4 eIF3 (en)
http://linked.open...neniPrubehuReseni	Deferred Final Report (en) Odložená závěrečná zpráva (cs)
http://linked.open...ep/partnetrHlavni	Mikrobiologický ústav AV ČR, v.v.i.
http://linked.open...inujicichPrijemcu	0 (xsd:int)
http://linked.open...cep/pocetPrijemcu	1 (xsd:int)
http://linked.open...ocetSpoluPrijemcu	0 (xsd:int)
http://linked.open.../pocetVysledkuRIV	3 (xsd:int)
http://linked.open...enychVysledkuVRIV	3 (xsd:int)
http://linked.open...lneniVMinulemRoce	2014-03-31 (xsd:date)
http://linked.open.../prideleniPodpory	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/prideleniPodpory/P305-11-0172
http://linked.open...iciPoslednihoRoku	2015
http://linked.open...atUdajeProjZameru	2015
http://linked.open.../vavai/cep/soutez	SGA02011GA-ST
http://linked.open...usZobrazovaneFaze	DRP
http://linked.open...ai/cep/typPojektu	P - Projekt výzkumu a vývoje financovaný ze státního rozpočtu
http://linked.open...ep/ukonceniReseni	2016-12-31 (xsd:date)
http://linked.open.../cep/vedlejsiObor	CE - Biochemie EE - Mikrobiologie, virologie
http://linked.open...ep/zahajeniReseni	2011-01-01 (xsd:date)
http://linked.open...tniCyklusProjektu	ZBBKP
is http://linked.open...vavai/cep/projekt of	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GAP305%2F11%2F0172/2015/ico%3A61388971 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GAP305%2F11%2F0172/2016/ico%3A61388971 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GAP305%2F11%2F0172/2011/ico%3A61388971 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GAP305%2F11%2F0172/2012/ico%3A61388971 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GAP305%2F11%2F0172/2013/ico%3A61388971 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GAP305%2F11%2F0172/2014/ico%3A61388971

Faceted Search & Find service v1.16.118 as of Jun 21 2024

Alternative Linked Data Documents: ODE Content Formats:

RDF

ODATA

Microdata

About

OpenLink Virtuoso version 07.20.3240 as of Jun 21 2024, on Linux (x86_64-pc-linux-gnu), Single-Server Edition (126 GB total memory, 58 GB memory in use)
Data on this page belongs to its respective rights holders.
Virtuoso Faceted Browser Copyright © 2009-2024 OpenLink Software