About: Deciphering molecular details of the stringent decoding of the AUG start codon during eukaryotic translation initiation.

Facets (new session)
Description
Metadata
Settings
- owl:sameAs
- Inference Rule:

About: Deciphering molecular details of the stringent decoding of the AUG start codon during eukaryotic translation initiation. Goto Sponge NotDistinct Permalink

An Entity of Type : http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/Projekt, within Data Space : linked.opendata.cz associated with source document(s)

Attributes	Values
rdf:type	http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/Projekt
rdfs:seeAlso	http://www.isvav.cz/projectDetail.do?rowId=GAP305/10/0335
Description	Start codon selection is a key step in translation as it sets the reading frame for decoding. The 40S ribosome has to scan the mRNA’s 5' UTR in its search for the AUG start codon and respond to a set of not well-understood signals that orchestrate its recognition. These signals originate from mutual interactions between mRNA, the 40S ribosome and initiation factors (eIFs). This proposal aims to reveal how the multisubunit eIF3 contributes to this intricate process on the molecular level using the well-established model of budding yeast and human cell lines. Our previous work has revealed that specific mutations in the three mutually interacting eIF3 subunits (a, b, and j) either relax or further tighten the otherwise well-balanced AUG selection process. Hence, we wish to demonstrate genetically, biochemically and structurally that the latter subunits comprise a self-operating eIF3 module that in cooperation with eIFs 1A and 1 regulates conformational transitions of the 40S ribosome that are required for the processivity of scanning and its efficient arrest upon AUG recognition. (en) Přesné rozpoznání iniciačního kodónu je klíčovým krokem translace, neboť určuje správné nastavení čtecího rámce. Pro tento účel musí 40S ribozóm nejprve postupně pročítat/skenovat 5' nepřekládanou oblast mRNA a reagovat na celou řadu ne zcela známých signálů vycházejících ze vzájemných interakcí mezi ribozómem, mRNA a iniciačními faktory, které celý proces řídí. Tato aplikace si klade za cíl objasnit, za pomoci kvasinkového modelu v kombinaci s lidskými buněčnými liniemi, jak je tento proces ovlivňován více-podjednotkovým faktorem eIF3. Naše předchozí práce ukázala, že specifické mutace ve třech vzájemně se vážících podjednotkách eIF3 (a, b, j) buď oslabují nebo naopak posilují míru přesnosti celého jinak perfektně vyladěného procesu. Rádi bychom tedy s pomocí genetických, biochemických a strukturálně-biologických přístupů prokázali, že tyto tři podjednotky představují samostatně činný eIF3 modul, který ve spolupráci s eIF1 a eIF1A reguluje konformační změny 40S ribozómu, jichž je zapotřebí jak pro hladký průběh skenování, tak pro jeho okamžité zastavení po rozpoznání iniciačního AUG.
Title	Deciphering molecular details of the stringent decoding of the AUG start codon during eukaryotic translation initiation. (en) Studium molekulárních detailů klíčového procesu rozpoznání počátečního AUG kodónu během inciace translace u eukaryot.
skos:notation	GAP305/10/0335
http://linked.open...avai/cep/aktivita	Standard projects
http://linked.open...kovaStatniPodpora	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/projekt/GAP305%2F10%2F0335/celkovaStatniPodpora
http://linked.open...ep/celkoveNaklady	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/projekt/GAP305%2F10%2F0335/celkoveNaklady
http://linked.open...datumDodatniDoRIV	2014-09-08 (xsd:date)
http://linked.open...i/cep/druhSouteze	VS - Veřejná soutěž ve výzkumu a vývoji
http://linked.open...ep/duvernostUdaju	S - Úplné a pravdivé údaje nepodléhající ochraně podle zvláštních právních předpisů
http://linked.open.../cep/fazeProjektu	99753717
http://linked.open...ai/cep/hlavniObor	EB - Genetika a molekulární biologie
http://linked.open...vai/cep/kategorie	ZV - Základní výzkum
http://linked.open.../cep/klicovaSlova	gene expression translational control AUG start codon recognition ribosome eIF (en)
http://linked.open...ep/partnetrHlavni	Mikrobiologický ústav AV ČR, v.v.i.
http://linked.open...inujicichPrijemcu	0 (xsd:int)
http://linked.open...cep/pocetPrijemcu	1 (xsd:int)
http://linked.open...ocetSpoluPrijemcu	0 (xsd:int)
http://linked.open.../pocetVysledkuRIV	4 (xsd:int)
http://linked.open...enychVysledkuVRIV	4 (xsd:int)
http://linked.open...lneniVMinulemRoce	2013-06-12 (xsd:date)
http://linked.open.../prideleniPodpory	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/prideleniPodpory/P305-10-0335
http://linked.open...iciPoslednihoRoku	2014
http://linked.open...atUdajeProjZameru	2014
http://linked.open.../vavai/cep/soutez	SGA02010GA-ST
http://linked.open...usZobrazovaneFaze	DRRVK
http://linked.open...ai/cep/typPojektu	P - Projekt výzkumu a vývoje financovaný ze státního rozpočtu
http://linked.open...ep/ukonceniReseni	2014-12-31 (xsd:date)
http://linked.open.../cep/vedlejsiObor	CE - Biochemie EA - Morfologické obory a cytologie
http://linked.open...ep/zahajeniReseni	2010-01-01 (xsd:date)
http://linked.open...tniCyklusProjektu	ZBBKK
is http://linked.open...vavai/cep/projekt of	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GAP305%2F10%2F0335/2010/ico%3A61388971 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GAP305%2F10%2F0335/2011/ico%3A61388971 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GAP305%2F10%2F0335/2012/ico%3A61388971 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GAP305%2F10%2F0335/2013/ico%3A61388971 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GAP305%2F10%2F0335/2014/ico%3A61388971

Faceted Search & Find service v1.16.118 as of Jun 21 2024

Alternative Linked Data Documents: ODE Content Formats:

RDF

ODATA

Microdata

About

OpenLink Virtuoso version 07.20.3240 as of Jun 21 2024, on Linux (x86_64-pc-linux-gnu), Single-Server Edition (126 GB total memory, 29 GB memory in use)
Data on this page belongs to its respective rights holders.
Virtuoso Faceted Browser Copyright © 2009-2025 OpenLink Software