About: The role of p53 DNA structure-selective binding in brain cancer

Facets (new session)
Description
Metadata
Settings
- owl:sameAs
- Inference Rule:

About: The role of p53 DNA structure-selective binding in brain cancer Goto Sponge NotDistinct Permalink

An Entity of Type : http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/Projekt, within Data Space : linked.opendata.cz associated with source document(s)

Attributes	Values
rdf:type	http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/Projekt
rdfs:seeAlso	http://www.isvav.cz/projectDetail.do?rowId=GAP301/10/2370
Description	Brain tumors are highly invasive types of cancer. The inactivation of specific genes together with point mutation in tumor suppressor Tp53 gene portends poor prognosis and dismal survival. Mutant p53 proteins acquire a -gain of function- activity that mainly contributes to tumor aggressiveness by regulation of a specific set of growth and metastasis promoting genes. In this project we propose to combine molecular biology, bioinformatics and tumor biology to understand, predict and map the role of mutant p53 binding to non-B DNA structures (DNA triplexes) in regulatory regions of mutant p53 target genes (e.g. PPARGC1A, JAK2 and FRMD5). Motivated by our previous research, we will identify new glioma markers on the basis of specific mutant p53-DNA interactions in glioblastoma cell lines using chromatin immunoprecipitation and gene expression analysis. Attention will be aimed to molecular mechanism of how mutant p53 regulates invasive character of gliomas and its possible utilization in tumor treatment by specific drugs. (en) Nádory mozku patří mezi vysoce invazivní. Inaktivace specifických genů spolu s bodovou mutací nádorového supresorového genu TP53 je spojena s nepříznivou prognózou a možností na přežití. Mutantní proteiny p53 disponují specifickými aktivitami spojenými s agresivním charakterem nádorů, např. schopností regulovat řadu genů podporujících buněčný růst a tvorbu metastáz. V tomto projektu plánujeme spojit molekulární a nádorovou biologii s bioinformatikou ve snaze pochopit, předpovídat a mapovat úlohu vazby mutantního proteinu p53 na nekanonické struktury DNA (DNA triplexy) v regulačních oblastech cílových genů mutantních proteinů p53 (např. PPARGC1A, JAK2 a FRMD5). V návaznosti na náš předchozí výzkum budeme identifikovat nové nádorové markery pro gliomy na základě specifických interakcí mutantního proteinu p53 s DNA v těchto buňkách s využitím chromatinové imunoprecipitace a analýzy genové exprese. Dále se zaměříme na molekulární mechanismus invazivního charakteru glioblastom závislého na expresi mutantního p53 a na jeho možné využití při terapii především při výběru účinné látky.
Title	The role of p53 DNA structure-selective binding in brain cancer (en) Úloha strukturně selektivní vazby proteinu p53 k DNA u nádorů mozku
skos:notation	GAP301/10/2370
http://linked.open...avai/cep/aktivita	Standard projects
http://linked.open...kovaStatniPodpora	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/projekt/GAP301%2F10%2F2370/celkovaStatniPodpora
http://linked.open...ep/celkoveNaklady	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/projekt/GAP301%2F10%2F2370/celkoveNaklady
http://linked.open...datumDodatniDoRIV	2014-01-30 (xsd:date)
http://linked.open...i/cep/druhSouteze	VS - Veřejná soutěž ve výzkumu a vývoji
http://linked.open...ep/duvernostUdaju	S - Úplné a pravdivé údaje nepodléhající ochraně podle zvláštních právních předpisů
http://linked.open.../cep/fazeProjektu	92536179
http://linked.open...ai/cep/hlavniObor	EB - Genetika a molekulární biologie
http://linked.open...hodnoceniProjektu	V - Vynikající výsledky (s mezinárodním významem apod.). Zároveň byly splněny cíle a předpokládané výsledky uvedené ve smlouvě / rozhodnutí o poskytnutí podpory.
http://linked.open...vai/cep/kategorie	ZV - Základní výzkum
http://linked.open.../cep/klicovaSlova	oncogenic; mutant; p53; p53-DNA; interaction; malignant; glioma; glioma; marker (en)
http://linked.open...ep/partnetrHlavni	Biofyzikální ústav AV ČR, v.v.i.
http://linked.open...inujicichPrijemcu	0 (xsd:int)
http://linked.open...cep/pocetPrijemcu	1 (xsd:int)
http://linked.open...ocetSpoluPrijemcu	0 (xsd:int)
http://linked.open.../pocetVysledkuRIV	3 (xsd:int)
http://linked.open...enychVysledkuVRIV	3 (xsd:int)
http://linked.open...lneniVMinulemRoce	2012-03-30 (xsd:date)
http://linked.open.../prideleniPodpory	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/prideleniPodpory/P301%2F10%2F2370
http://linked.open...iciPoslednihoRoku	2012
http://linked.open...atUdajeProjZameru	2013
http://linked.open.../vavai/cep/soutez	SGA02010GA-ST
http://linked.open...usZobrazovaneFaze	DUU
http://linked.open...ai/cep/typPojektu	P - Projekt výzkumu a vývoje financovaný ze státního rozpočtu
http://linked.open...ep/ukonceniReseni	2012-12-31 (xsd:date)
http://linked.open.../cep/vedlejsiObor	CE - Biochemie
http://linked.open...ep/zahajeniReseni	2010-01-01 (xsd:date)
http://linked.open...jektu+dodavatelem	In the project, mutant p53 proteins associated with oncogenic character of glioblastoma cell lines and its binding to DNA were investigated. Analyses of gene expression in these cells and its classification might contribute to targeted therapy for glioblastomas. The results were published in four papers in impacted journals (a total value of IF equals to 17.4). Solving of the project is excellent. (en) Projekt přispěl k rozvoji základního výzkumu a výchově studentů. Studované mutantní proteiny p53 spojené s onkogenním charakterem glioblastomů se vážou na DNA. Analysa genové exprese a jejich klasifikace přispívají k cílené terapii glioblastomů. Výsledky byly publikovány v 4 pracích v časopisech s IF (z toho 2 jsou v tisku). Celková hodnota IF publikovaných prací činí 17.4. Řešení bylo vynikající. (cs)
http://linked.open...tniCyklusProjektu	ZBKU
http://linked.open.../cep/klicoveSlovo	glioma interaction malignant mutant p53 p53-DNA oncogenic
is http://linked.open...vavai/cep/projekt of	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GAP301%2F10%2F2370/2010/ico%3A68081707 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GAP301%2F10%2F2370/2011/ico%3A68081707 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GAP301%2F10%2F2370/2012/ico%3A68081707 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GAP301%2F10%2F2370/2013/ico%3A68081707

Faceted Search & Find service v1.16.118 as of Jun 21 2024

Alternative Linked Data Documents: ODE Content Formats:

RDF

ODATA

Microdata

About

OpenLink Virtuoso version 07.20.3240 as of Jun 21 2024, on Linux (x86_64-pc-linux-gnu), Single-Server Edition (126 GB total memory, 25 GB memory in use)
Data on this page belongs to its respective rights holders.
Virtuoso Faceted Browser Copyright © 2009-2024 OpenLink Software