About: Interactions of organometallic antitumor compounds with nucleic acids and proteins: study of sequence and substrate selectivity

Facets (new session)
Description
Metadata
Settings
- owl:sameAs
- Inference Rule:

About: Interactions of organometallic antitumor compounds with nucleic acids and proteins: study of sequence and substrate selectivity Goto Sponge NotDistinct Permalink

An Entity of Type : http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/Projekt, within Data Space : linked.opendata.cz associated with source document(s)

Attributes	Values
rdf:type	http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/Projekt
rdfs:seeAlso	http://www.isvav.cz/projectDetail.do?rowId=GAP208/12/0622
Description	At present there is a strong request for more potent and less toxic anticancer drugs than cisplatin. The mode of action of cisplatin and related drugs includes a binding to DNA as a key step of their antitumor activity. It leads to a modification of DNA structure and changes of its interactions with proteins. We will focus on the binding of the following complexes to DNA: (1) oxaliplatin, (2) RAPTA-B complex and (3) Os(II) and Rh(III) analogues of RAPTA complexes. DNA will be represented by ds(pGpG) dinucleotide in the first step, in the second step flanking bases will be also included. Using DFT and ab initio methods we will obtain information on the molecular level which are not available from experimental results, especially data on transition states' (de)stabilizations and their sequence dependence, course of local changes in the secondary structure of DNA during the drug coordination, influence of the complex binding on the base-pair interactions. The drug-binding selectivity towards proteins as the second possible targets in cells will be also evaluated. (en) V současnosti existuje silná poptávka po protinádorových léčivech, které by byly více účinné a méně toxické než cisplatina. Mechanismus účinku cisplatiny a příbuzných léčiv spočívá především v jejich vazbě na DNA. Ta vede ke změně struktury DNA a změně jejích interakcí s proteiny. Tento projekt bude zaměřen na vazbu následujících komplexů na DNA: (1) oxaliplatinu, (2) RAPTA-B komplex a (3) Os(II) a Rh(III) analogy RAPTA complexů. DNA bude v prvním kroku reprezentována pomocí ds(pGpG) dinucleotidu, v dalším kroku bude zahrnut ještě i vedlejší pár bazí. Pomocí DFT a ab initio metod získáme informace na molekulární úrovni, které nejsou k dispozici z experimentů, zvláště data o (de)stabilizaci tranzitních stavů a jejich závislosti na sekvenci, data o průběhu lokálních změn v sekundární struktuře DNA během vazby komplexů a data o vlivu navázaného komplexu na párové interakce. U uvažovaných komplexů bude také vypočítána vazebná selektivita vzhledem k proteinům.
Title	Interactions of organometallic antitumor compounds with nucleic acids and proteins: study of sequence and substrate selectivity (en) Interakce organokovových protinádorových komplexů s nukleovými kyselinami a proteiny: studium sekvenční a substrátové selektivity
skos:notation	GAP208/12/0622
http://linked.open...avai/cep/aktivita	Standard projects
http://linked.open...kovaStatniPodpora	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/projekt/GAP208%2F12%2F0622/celkovaStatniPodpora
http://linked.open...ep/celkoveNaklady	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/projekt/GAP208%2F12%2F0622/celkoveNaklady
http://linked.open...datumDodatniDoRIV	2015-04-23 (xsd:date)
http://linked.open...i/cep/druhSouteze	VS - Veřejná soutěž ve výzkumu a vývoji
http://linked.open...ep/duvernostUdaju	S - Úplné a pravdivé údaje nepodléhající ochraně podle zvláštních právních předpisů
http://linked.open.../cep/fazeProjektu	100772842
http://linked.open...ai/cep/hlavniObor	CF - Fyzikální chemie a teoretická chemie
http://linked.open...vai/cep/kategorie	ZV - Základní výzkum
http://linked.open.../cep/klicovaSlova	oxaliplatin RAPTA complexes nucleic acids proteins sequence dependance binding specificity (en)
http://linked.open...ep/partnetrHlavni	Zdravotně sociální fakulta
http://linked.open...inujicichPrijemcu	0 (xsd:int)
http://linked.open...cep/pocetPrijemcu	1 (xsd:int)
http://linked.open...ocetSpoluPrijemcu	1 (xsd:int)
http://linked.open.../pocetVysledkuRIV	6 (xsd:int)
http://linked.open...enychVysledkuVRIV	6 (xsd:int)
http://linked.open...lneniVMinulemRoce	2014-04-18 (xsd:date)
http://linked.open.../prideleniPodpory	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/prideleniPodpory/P208-12-0622
http://linked.open...iciPoslednihoRoku	2015
http://linked.open...atUdajeProjZameru	2015
http://linked.open.../vavai/cep/soutez	SGA02012GA-ST
http://linked.open...usZobrazovaneFaze	DRRVK
http://linked.open...ai/cep/typPojektu	P - Projekt výzkumu a vývoje financovaný ze státního rozpočtu
http://linked.open...ep/ukonceniReseni	2015-12-31 (xsd:date)
http://linked.open...ep/zahajeniReseni	2012-01-01 (xsd:date)
http://linked.open...tniCyklusProjektu	ZBBK
is http://linked.open...vavai/cep/projekt of	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GAP208%2F12%2F0622/2012/orjk%3A11320 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GAP208%2F12%2F0622/2012/orjk%3A12110 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GAP208%2F12%2F0622/2013/orjk%3A11320 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GAP208%2F12%2F0622/2013/orjk%3A12110 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GAP208%2F12%2F0622/2014/orjk%3A11320 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GAP208%2F12%2F0622/2014/orjk%3A12110 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GAP208%2F12%2F0622/2015/orjk%3A11320 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GAP208%2F12%2F0622/2015/orjk%3A12110

Faceted Search & Find service v1.16.118 as of Jun 21 2024

Alternative Linked Data Documents: ODE Content Formats:

RDF

ODATA

Microdata

About

OpenLink Virtuoso version 07.20.3240 as of Jun 21 2024, on Linux (x86_64-pc-linux-gnu), Single-Server Edition (126 GB total memory, 112 GB memory in use)
Data on this page belongs to its respective rights holders.
Virtuoso Faceted Browser Copyright © 2009-2024 OpenLink Software