About: Studium mezimolekulových interakcí v molekulových krystalech a proteinech     Goto   Sponge   NotDistinct   Permalink

An Entity of Type : http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/Projekt, within Data Space : linked.opendata.cz associated with source document(s)

AttributesValues
rdf:type
rdfs:seeAlso
Description
  • Fyzikálně korektní popis mezimolekulových interakcí je zcela zásadní pro pochopení struktury a vlastností biologicky relevantních systémů, jako jsou např. DNA, RNA a proteiny. Interakce v těchto systémech jsou dány jemnou rovnováhou disperzních, elektrostatických a výměnných sil, kterou běžně používané kvantově chemické metody založené na lokálních funkcionálech hustot (LDA, GGA metody) nedokáží popsat. Četné příklady selhání DFT výpočtů lze najít v organických (aromatických) krystalech nebo grafitických nanomateriálech s intermolekulárními π-π interakcemi. Jedno z možných řešení výše zmíněného problému představuje DFT/CC korekční metoda vyvinutá na našem pracovišti (O. Bludský et al., J. Chem. Phys., 128, 114102 (2008)). Tato metoda umožňuje velmi přesný popis π-π interakcí v molekulových krystalech a byla již úspěšně testována na řadě teoreticky i experimentálně dobře prostudovaných systémů (grafit, benzen, C60). Projekt "Studium mezimolekulových interakcí v molekulových krystalech a proteinech" bude zaměřen na využití DFT/CC metody pro řadu modelových systémů. Výsledky těchto studií budou poté aplikovány pro charakterizaci mezimolekulových interakcí proteinů.
  • Interactions in molecular solids display an intricate balance between dispersion, electrostatic, and exchange forces. This situation is not particularly favorable for the widely used density functional theory (DFT) approaches employing the local density functionals (LDA, GGA). DFT calculations typically fail to describe dispersive (van der Waals) molecular systems. Many examples occur in organic (aromatic) crystals and graphitic nanomaterials with intermolecular π-π interactions. A proper description of the π-π stacking interactions is also essential for many biologically relevant molecules (e.g. DNA, RNA, proteins). Recently, a novel DFT/CC correction scheme has been proposed in our laboratory for precise calculations of weakly bound molecular solids (O. Bludsky et al., J. Chem. Phys., 128, 114102 (2008)). The DFT/CC method was tested for well-studied systems, both from the theoretical and experimental point of view. The main emphasis of this project is to develop theoretical methods for precise description of intermolecular interactions in molecular solids, and, in turn, from an accurate parameterization of the DFT/CC correction scheme obtain valuable information on interactions in proteins. (en)
Title
  • Studium mezimolekulových interakcí v molekulových krystalech a proteinech
  • Intermolecular Interactions in Molecular Solids and Proteins (en)
skos:notation
  • GAP208/10/0725
http://linked.open...avai/cep/aktivita
http://linked.open...kovaStatniPodpora
http://linked.open...ep/celkoveNaklady
http://linked.open...datumDodatniDoRIV
http://linked.open...i/cep/druhSouteze
http://linked.open...ep/duvernostUdaju
http://linked.open.../cep/fazeProjektu
http://linked.open...ai/cep/hlavniObor
http://linked.open...hodnoceniProjektu
http://linked.open...vai/cep/kategorie
http://linked.open.../cep/klicovaSlova
  • intermolecular interactions proteins (en)
http://linked.open...ep/partnetrHlavni
http://linked.open...inujicichPrijemcu
http://linked.open...cep/pocetPrijemcu
http://linked.open...ocetSpoluPrijemcu
http://linked.open.../pocetVysledkuRIV
http://linked.open...enychVysledkuVRIV
http://linked.open...lneniVMinulemRoce
http://linked.open.../prideleniPodpory
http://linked.open...iciPoslednihoRoku
http://linked.open...atUdajeProjZameru
http://linked.open.../vavai/cep/soutez
http://linked.open...usZobrazovaneFaze
http://linked.open...ai/cep/typPojektu
http://linked.open...ep/ukonceniReseni
http://linked.open...ep/zahajeniReseni
http://linked.open...jektu+dodavatelem
  • Project devoted to the design of theoretical models and methods of intermolecular interactions in complex molecular systems was completed according to the plan. It provided significant results in methodology and applications, particularly description of weakly bound molecular systems and biomolecular interactions. The results were published in 10 papers in impacted journals and one book chapter. (en)
  • Projekt zabývající se vývojem teoretických modelů a metod mezimolekulových interakcí v komplexních molekulových systémech byl řešen v souladu s plánem. Byly dosaženy významné výsledky v oblasti metodologické i aplikační, zejména v popisu slabě vázaných molekulových systémů a biomolekulárních interakcí. Výsledky byly shrnuty v 10 publikacích v impaktovaných časopisech a v jedné kapitole v knize. (cs)
http://linked.open...tniCyklusProjektu
is http://linked.open...vavai/cep/projekt of
Faceted Search & Find service v1.16.118 as of Jun 21 2024


Alternative Linked Data Documents: ODE     Content Formats:   [cxml] [csv]     RDF   [text] [turtle] [ld+json] [rdf+json] [rdf+xml]     ODATA   [atom+xml] [odata+json]     Microdata   [microdata+json] [html]    About   
This material is Open Knowledge   W3C Semantic Web Technology [RDF Data] Valid XHTML + RDFa
OpenLink Virtuoso version 07.20.3240 as of Jun 21 2024, on Linux (x86_64-pc-linux-gnu), Single-Server Edition (126 GB total memory, 49 GB memory in use)
Data on this page belongs to its respective rights holders.
Virtuoso Faceted Browser Copyright © 2009-2024 OpenLink Software