About: Strukturně-funkční vztahy haloalkan dehalogenas

Facets (new session)
Description
Metadata
Settings
- owl:sameAs
- Inference Rule:

About: Strukturně-funkční vztahy haloalkan dehalogenas Goto Sponge NotDistinct Permalink

An Entity of Type : http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/Projekt, within Data Space : linked.opendata.cz associated with source document(s)

Attributes	Values
rdf:type	http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/Projekt
rdfs:seeAlso	http://www.isvav.cz/projectDetail.do?rowId=GAP207/12/0775
Description	Haloalkane dehalogenases (EC 3.8.1.5) are microbial enzymes with catalytic activity for hydrolytic conversion of xenobiotic and toxic halogenated aliphatic compounds to corresponding alcohols. Until now, only four tertiary structures of these enzymes have been solved by X-ray analysis. Structures of several novel enzymes crystallized by us will be solved and deposited to Protein Data Bank within the framework of this project. Additionally, recently cloned and biochemically characterized enzymes will be crystallized and structuraly characterized. Although the molecular structure of three haloalkane dehalogenases is known, some details of the reaction mechanism are not understood yet. Therefore, neutron diffraction will be used in parallel to X-ray diffraction to describe the role of hydrogens in water and protonated residues in the active site and access tunnels connecting the active site cavity. Structural data will be linked to the functional biochemical data leading to better understanding of structure-function relationships of haloalkane dehalogenases and related a/b-hydrolases. (en) Halogenalkan dehalogenasy (EC 3.8.1.5) jsou mikrobiální enzymy vykazující katalytickou aktivitu pro hydrolytickou konverzi xenobiotik a toxických halogenovaných alifatických sloučenin na příslušné alkoholy. Do dnešní doby byly vyřešeny pouze čtyři terciární struktury těchto enzymů pomocí X-ray difrakční analýzy. V rámci předkládaného projektu budou struktury několika nových námi úspěšně vykrystalizovaných enzymů vyřešeny a deponovány v Proteinové databázi. Dále budou krystalizovány a strukturně charakterizovány nově klonované a biochemicky charakterizované enzymy. I když je molekulární struktura publikovaných enzymů známá, některé důležité detaily v reakčním mechanizmu nejsou doposud objasněny. Proto paralelně k X-ray difrakci bude použita metoda neutronové difrakce s cílem popsat úlohu vodíků z vody a protonovaných aminokyselinových zbytků v aktivním místě a přístupnost tunelů v okolí aktivního místa. Strukturní data budou provázána s biochemickými a povedou k detailnějšímu objasnění strukturně-funkčních vztahů halogenalkan dehalogenas a enzymů ze super-rodiny alfa/beta-hydrolas.
Title	Strukturně-funkční vztahy haloalkan dehalogenas Structure-functional Relationships of Haloalkane Dehalogenases (en)
skos:notation	GAP207/12/0775
http://linked.open...avai/cep/aktivita	Standard projects
http://linked.open...kovaStatniPodpora	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/projekt/GAP207%2F12%2F0775/celkovaStatniPodpora
http://linked.open...ep/celkoveNaklady	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/projekt/GAP207%2F12%2F0775/celkoveNaklady
http://linked.open...datumDodatniDoRIV	2015-04-23 (xsd:date)
http://linked.open...i/cep/druhSouteze	VS - Veřejná soutěž ve výzkumu a vývoji
http://linked.open...ep/duvernostUdaju	S - Úplné a pravdivé údaje nepodléhající ochraně podle zvláštních právních předpisů
http://linked.open.../cep/fazeProjektu	100780159
http://linked.open...ai/cep/hlavniObor	CD - Makromolekulární chemie
http://linked.open...vai/cep/kategorie	ZV - Základní výzkum
http://linked.open.../cep/klicovaSlova	haloalkane dehalogenases structure function (en)
http://linked.open...ep/partnetrHlavni	Přírodovědecká fakulta
http://linked.open...inujicichPrijemcu	0 (xsd:int)
http://linked.open...cep/pocetPrijemcu	1 (xsd:int)
http://linked.open...ocetSpoluPrijemcu	1 (xsd:int)
http://linked.open.../pocetVysledkuRIV	20 (xsd:int)
http://linked.open...enychVysledkuVRIV	20 (xsd:int)
http://linked.open...lneniVMinulemRoce	2014-04-18 (xsd:date)
http://linked.open.../prideleniPodpory	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/prideleniPodpory/P207-12-0775
http://linked.open...iciPoslednihoRoku	2015
http://linked.open...atUdajeProjZameru	2015
http://linked.open.../vavai/cep/soutez	SGA02012GA-ST
http://linked.open...usZobrazovaneFaze	DRRVB
http://linked.open...ai/cep/typPojektu	P - Projekt výzkumu a vývoje financovaný ze státního rozpočtu
http://linked.open...ep/ukonceniReseni	2016-12-31 (xsd:date)
http://linked.open.../cep/vedlejsiObor	BO - Biofyzika CE - Biochemie
http://linked.open...ep/zahajeniReseni	2012-01-01 (xsd:date)
http://linked.open...tniCyklusProjektu	ZBBB
is http://linked.open...vavai/cep/projekt of	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GAP207%2F12%2F0775/2012/orjk%3A12520 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GAP207%2F12%2F0775/2012/orjk%3A14310 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GAP207%2F12%2F0775/2013/orjk%3A12310 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GAP207%2F12%2F0775/2013/orjk%3A12520 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GAP207%2F12%2F0775/2013/orjk%3A14310 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GAP207%2F12%2F0775/2014/orjk%3A12310 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GAP207%2F12%2F0775/2014/orjk%3A14310 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GAP207%2F12%2F0775/2015/orjk%3A12310 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GAP207%2F12%2F0775/2015/orjk%3A14310 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GAP207%2F12%2F0775/2016/orjk%3A12310 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GAP207%2F12%2F0775/2016/orjk%3A14310

Faceted Search & Find service v1.16.118 as of Jun 21 2024

Alternative Linked Data Documents: ODE Content Formats:

RDF

ODATA

Microdata

About

OpenLink Virtuoso version 07.20.3240 as of Jun 21 2024, on Linux (x86_64-pc-linux-gnu), Single-Server Edition (126 GB total memory, 58 GB memory in use)
Data on this page belongs to its respective rights holders.
Virtuoso Faceted Browser Copyright © 2009-2024 OpenLink Software