About: Creation of resources for wheat genomics and map-based cloning of resistance genes from chromosome 7D

Facets (new session)
Description
Metadata
Settings
- owl:sameAs
- Inference Rule:

About: Creation of resources for wheat genomics and map-based cloning of resistance genes from chromosome 7D Goto Sponge NotDistinct Permalink

An Entity of Type : http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/Projekt, within Data Space : linked.opendata.cz associated with source document(s)

Attributes	Values
rdf:type	http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/Projekt
rdfs:seeAlso	http://www.isvav.cz/projectDetail.do?rowId=GA521/07/1573
Description	Positional cloning in a huge allopolyploid genome of bread wheat was considered infeasible, mainly due to presence of three homoeologous genomes and large amounts of repetitive sequences. One of strategies enabling to reach this target is based on the use of genomic resources derived from parts of the hexaploid genome. Here we propose construction of two subgenomic BAC libraries specific for short and long arm of chromosome 7D. They will be invaluable resource for creation of physical maps of chromosome 7D and map-based cloning of several agronomically important genes from chromosome 7D of wheat, including genes conferring resistance to green bug, powdery mildew, stem rust, leaf rust, stripe rust, Septoria tritici blotch and Russian wheat aphid. The project will focus on positional cloning of gene Dnx for resistance to Russian wheat aphid (RWA) by creating high-density genetic map for the Dnx region and BAC contig spanning this region. Further, a pooled genomic BAC library will be (en) Poziční klonování v obrovském allopolyploidním genomu pšenice seté bylo donedávna považováno za nemožné kvůli přítomnosti tří homeologních genomů a značnému množství repetitivních sekvencí. Jedna ze strategií vedoucích k dosažení tohoto cíle je založena na využití genomických materiálů vytvořených pouze z menších částí genomu. Navrhujeme připravit dvě subgenomové knihovny klonované ve vektoru BAC, specifické pro krátké a dlouhé rameno chromozómu 7D pšenice. Tyto knihovny budou neocenitelným zdrojem při tvorbě fyzických map chromozómu 7D a pozičním klonování několika agronomicky významných genů z tohoto chromozómu, mimo jiné genů pro rezistence ke škůdcům Schizaphis graminum a Diuraphis noxia a patogenům Blumeria graminis, Puccinia triticina, P. striiformis, P. graminis f. sp. tritici nebo Mycosphaerella graminicola. Projekt bude zaměřen na poziční klonování genu Dnx pro rezistenci k mšici D. noxia. Součástí bude vytvoření husté genetické mapy pro oblast genu Dnx a sestavení kontigu BAC klonů
Title	Creation of resources for wheat genomics and map-based cloning of resistance genes from chromosome 7D (en) Příprava materiálů pro genomiku pšenice a poziční klonování genů pro rezistence na chromozómu 7D
skos:notation	GA521/07/1573
http://linked.open...avai/cep/aktivita	Standard projects
http://linked.open...kovaStatniPodpora	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/projekt/GA521%2F07%2F1573/celkovaStatniPodpora
http://linked.open...ep/celkoveNaklady	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/projekt/GA521%2F07%2F1573/celkoveNaklady
http://linked.open...datumDodatniDoRIV	2015-01-22 (xsd:date)
http://linked.open...i/cep/druhSouteze	VS - Veřejná soutěž ve výzkumu a vývoji
http://linked.open...ep/duvernostUdaju	S - Úplné a pravdivé údaje nepodléhající ochraně podle zvláštních právních předpisů
http://linked.open.../cep/fazeProjektu	65679359
http://linked.open...ai/cep/hlavniObor	GE - Šlechtění rostlin
http://linked.open...hodnoceniProjektu	U - Uspěl podle zadání, tj. byly splněny cíle a jeho předpokládané výsledky uvedené ve smlouvě / rozhodnutí o poskytnutí podpory
http://linked.open...vai/cep/kategorie	ZV - Základní výzkum
http://linked.open.../cep/klicovaSlova	Triticum aestivum; BAC; chromosome-specific libraries; positional cloning; Dnx (en)
http://linked.open...ep/partnetrHlavni	Ústav experimentální botaniky AV ČR, v.v.i.
http://linked.open...inujicichPrijemcu	0 (xsd:int)
http://linked.open...cep/pocetPrijemcu	1 (xsd:int)
http://linked.open...ocetSpoluPrijemcu	0 (xsd:int)
http://linked.open.../pocetVysledkuRIV	6 (xsd:int)
http://linked.open...enychVysledkuVRIV	6 (xsd:int)
http://linked.open...lneniVMinulemRoce	2009-04-22 (xsd:date)
http://linked.open.../prideleniPodpory	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/prideleniPodpory/521%2F07%2F1573
http://linked.open...iciPoslednihoRoku	2009
http://linked.open...atUdajeProjZameru	2010
http://linked.open.../vavai/cep/soutez	SGA02007GA-ST
http://linked.open...usZobrazovaneFaze	DUU
http://linked.open...ai/cep/typPojektu	P - Projekt výzkumu a vývoje financovaný ze státního rozpočtu
http://linked.open...ep/ukonceniReseni	2009-12-31 (xsd:date)
http://linked.open.../cep/vedlejsiObor	GF - Choroby, škůdci, plevely a ochrana rostlin EB - Genetika a molekulární biologie
http://linked.open...ep/zahajeniReseni	2007-01-01 (xsd:date)
http://linked.open...jektu+dodavatelem	. (en) Výsledky uvedené v závěrečné zprávě ukazují na splnění cílů projektu. Výstupem je jedna kapitola v knize a jeden článek v tisku a 3 rukopisy. (cs)
http://linked.open...tniCyklusProjektu	ZBKU
http://linked.open.../cep/klicoveSlovo	Triticum aestivum BAC chromosome-specific libraries positional cloning
is http://linked.open...vavai/cep/projekt of	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GA521%2F07%2F1573/2007/ico%3A61389030 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GA521%2F07%2F1573/2007/ocs%3AUS%3AKansas+State+University http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GA521%2F07%2F1573/2008/ico%3A61389030 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GA521%2F07%2F1573/2009/ico%3A61389030 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GA521%2F07%2F1573/2010/ico%3A61389030

Faceted Search & Find service v1.16.118 as of Jun 21 2024

Alternative Linked Data Documents: ODE Content Formats:

RDF

ODATA

Microdata

About

OpenLink Virtuoso version 07.20.3240 as of Jun 21 2024, on Linux (x86_64-pc-linux-gnu), Single-Server Edition (126 GB total memory, 58 GB memory in use)
Data on this page belongs to its respective rights holders.
Virtuoso Faceted Browser Copyright © 2009-2024 OpenLink Software