Cílem předloženého projektu je prokázat existenci topologických vzorů 3D organizace genomu v interefázových jádrech lidských a myších fibroblastů. Pomocí 3D FISH a 3D ZOO-FISH s lidskými a myšími centromerními a chromosom-specifickými painting probami, 3konfokální mikroskopie a matematických metod analýzy prostorového rozložení bodových a 3D náhodných procesů chceme analyzovat jadernou topologii vybraného souboru ortologních a chromosomálních úseků lidského a myšího genomu v jádrech lidských a myších fibroblastů s cílem ověřit hypothesu o nenáhodné 3D organizaci chromosomů v interfázovém jádře jako projevu evolučně konzervovaného algoritmů 3D organizace genomu v interfázovém jádře.
The aim of the project proposal is to prove the existence of topological patterns of 3D genome organization in the interphase nuclei of human and mouse fibroplasts. By means of 3D FISH and 3D ZOO-FISH with human and mouse centromere and chromosomespecifi%22painting%22 probes, 3D confocal microscopy, and methods of mathematical analysis of the spatial distribution of point and 3D stochastic processes, the nuclear topology of a sample of orthologous chromosomal segments of human and mouse genome will be analyzed in the nuclei of human and mouse fibroplasts, aiming to prove the hypothesis on non random 3D organization of chromosomes in the interphase nucleus as a manifestationof the evolutionary conserved algorithm of 3D genome organization in the interphase nucleus. Beside the basic relevance for the fundamental research, the understanding of principles of 3D nuclear organization of chromosomes is inevitable for understanding the formation of tumour-specific translocations and chromosomal (en)
Projekt si klade za cíl prokázat nenáhodné 3D uspořádání genomu v interfázovém jádře v lidských a myších buňkách, s využitím experimentálních přístupů (FISH, kontakt. mikroskopie) i matematických metod analýzy. Pomocí anti-aktinové protilátky byl prokáz (cs)