About: The impact of genomic shock associated with interspecific hybridization and polyploidization on evolution of rDNA loci in young invasive weeds.

Facets (new session)
Description
Metadata
Settings
- owl:sameAs
- Inference Rule:

About: The impact of genomic shock associated with interspecific hybridization and polyploidization on evolution of rDNA loci in young invasive weeds. Goto Sponge NotDistinct Permalink

An Entity of Type : http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/Projekt, within Data Space : linked.opendata.cz associated with source document(s)

Attributes	Values
rdf:type	http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/Projekt
rdfs:seeAlso	http://www.isvav.cz/projectDetail.do?rowId=GA206/09/1751
Description	Both genetic and epigenetic alterations in parental rDNA accompanying interspecific hybridization, subsequent polyploidization and the origin of new species will be studied to answer following questions: (i) Are alterations in parental rDNA similar comparing natural and synthetic allotetraploids? (ii) Are DNA methylation, histone modification and chromatin packaging different in dominant and silent rDNA loci? (iii) Is nucleolar dominance influenced by copy number of parental rDNA units, structure of IGS, gene dosage, genetic background and plant differentiation/ dedifferentiation? (iv) Are methylation of histone H3 at lysine 9 as well as structure of IGS involved in the long-term maintenance of progenitor rDNA loci in plant hybrids? (v) Is there any homogenization and uniparental silencing of 5S rDNA in hybrids? For solution of these questions heterogeneous rRNA gene expression in natural populations of Tragopogon successful invasive allotetraploid weeds with recent and recurrent origin as well as in synthetic hybrids genetically equivalent to natural populations will be studied. (en) Budeme se zabývat genetickými a epigenetickými změnami rodičovských rDNA provázejících mezidruhovou hybridizaci, následnou polyploidizaci a vznik nových druhů. Naše experimenty by měly přispět k zodpovězení následujících otázek: (i) Jsou změny rodičovských rDNA u umělých allotetraploidů podobné jako u přirozených? (ii) Liší se methylace DNA, modifikace histonů a struktura chromatinu dominantních a umlčených lokusů rDNA? (iii) Je jadérková dominance ovlivněna počtem kopií rodičovských jednotek rDNA, strukturou IGS, genetickým pozadím a vývojovým stadiem rostliny? (iv) Uplatňuje se methylace lysinu 9 histonu H3 a struktura IGS při dlouhodobé stabilitě rodičovských rDNA lokusů v rostlinných hybridech? (v) Probíhá u hybridů homogenizace a specifické umlčení rodičovských 5S rDNA? Pro zodpovězení těchto otázek bude studována heterogenní exprese rRNA genů u přirozených, nedávno opakovaně vzniklých, populací invazních allotetraploidních plevelů rodu Tragopogon a rovněž u geneticky odpovídajících synthetických hybridů a allotetraploidů.
Title	The impact of genomic shock associated with interspecific hybridization and polyploidization on evolution of rDNA loci in young invasive weeds. (en) Vliv genomického šoku spojeného s mezidruhovou hybridizací a allopolyploidizací na evoluci rDNA lokusů u mladých invazivních plevelů
skos:notation	GA206/09/1751
http://linked.open...avai/cep/aktivita	Standard projects
http://linked.open...kovaStatniPodpora	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/projekt/GA206%2F09%2F1751/celkovaStatniPodpora
http://linked.open...ep/celkoveNaklady	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/projekt/GA206%2F09%2F1751/celkoveNaklady
http://linked.open...datumDodatniDoRIV	2014-07-01 (xsd:date)
http://linked.open...i/cep/druhSouteze	VS - Veřejná soutěž ve výzkumu a vývoji
http://linked.open...ep/duvernostUdaju	S - Úplné a pravdivé údaje nepodléhající ochraně podle zvláštních právních předpisů
http://linked.open.../cep/fazeProjektu	100269583
http://linked.open...ai/cep/hlavniObor	EB - Genetika a molekulární biologie
http://linked.open...hodnoceniProjektu	V - Vynikající výsledky (s mezinárodním významem apod.). Zároveň byly splněny cíle a předpokládané výsledky uvedené ve smlouvě / rozhodnutí o poskytnutí podpory.
http://linked.open...vai/cep/kategorie	ZV - Základní výzkum
http://linked.open.../cep/klicovaSlova	Tragopogon nucleolar dominance gene silencing homogenization histone modifications (en)
http://linked.open...ep/partnetrHlavni	Biofyzikální ústav AV ČR, v.v.i.
http://linked.open...inujicichPrijemcu	0 (xsd:int)
http://linked.open...cep/pocetPrijemcu	1 (xsd:int)
http://linked.open...ocetSpoluPrijemcu	0 (xsd:int)
http://linked.open.../pocetVysledkuRIV	6 (xsd:int)
http://linked.open...enychVysledkuVRIV	6 (xsd:int)
http://linked.open...lneniVMinulemRoce	2013-06-06 (xsd:date)
http://linked.open.../prideleniPodpory	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/prideleniPodpory/206-09-1751
http://linked.open...iciPoslednihoRoku	2013
http://linked.open...atUdajeProjZameru	2014
http://linked.open.../vavai/cep/soutez	SGA02009GA-ST
http://linked.open...usZobrazovaneFaze	DUU
http://linked.open...ai/cep/typPojektu	P - Projekt výzkumu a vývoje financovaný ze státního rozpočtu
http://linked.open...ep/ukonceniReseni	2013-12-31 (xsd:date)
http://linked.open.../cep/vedlejsiObor	EF - Botanika EH - Ekologie - společenstva
http://linked.open...ep/zahajeniReseni	2009-01-01 (xsd:date)
http://linked.open...jektu+dodavatelem	Grant se zabýval evolucí rDNA repetic u alopolyploidů ze 3 rodů. Výsledky jsou nové a přínosné pro obor, dokladem jsou publikace v dobrých časopisech. Výstupem je 7 publikací v časopisech s IF 2,2 - 6,7. Nedostatky v čerpání finanančních prostředků nezjištěny. (cs) The project succesfully analyzed the evolution of rDNA repeats in allotetetraploids of different age and genera. The comparison of natural and synthetic tetraploids showed that rDNA genotypes and phenotypes seen in old allopolyploids are already present in the early generations of synthetics. The rDNA evolution is influenced by amplification of orphaned rDNA units at new chromosomal locations. (en)
http://linked.open...tniCyklusProjektu	ZBBBKU
is http://linked.open...vavai/cep/projekt of	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GA206%2F09%2F1751/2009/ico%3A68081707 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GA206%2F09%2F1751/2010/ico%3A68081707 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GA206%2F09%2F1751/2011/ico%3A68081707 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GA206%2F09%2F1751/2012/ico%3A68081707 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GA206%2F09%2F1751/2013/ico%3A68081707 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GA206%2F09%2F1751/2014/ico%3A68081707

Faceted Search & Find service v1.16.118 as of Jun 21 2024

Alternative Linked Data Documents: ODE Content Formats:

RDF

ODATA

Microdata

About

OpenLink Virtuoso version 07.20.3240 as of Jun 21 2024, on Linux (x86_64-pc-linux-gnu), Single-Server Edition (126 GB total memory, 58 GB memory in use)
Data on this page belongs to its respective rights holders.
Virtuoso Faceted Browser Copyright © 2009-2024 OpenLink Software