| Attributes | Values |
|---|
| rdf:type
| |
| rdfs:seeAlso
| |
| Description
| - The main goal of the project is an analysis of patterns of genomic parameters: genome size, chromosome number, chromosome size, genomic AT/GC composition, retrotransposon diversity and widespread in taxa of two contrasting model genera with holokinetic chromosomes: Carex and Eleocharis. Evolutionary dynamics of these species-specific genomic parameters in the framework of the phylogeny based on molecular sequence markers will be used for the evaluation of the role of key mechanisms in genome size evolution: (i) polyploidy; (ii) agmatoploidy, (iii) symploidy, (iv-v) retrotransposon amplification or removal in the main evolutionary lineages of taxa studied. The model is therefore not a concrete species as in classical genomic studies but the group of species connected by the net of their evolutionary relationships. The models are contrasting in (i) species diversity, (ii) evolutionary centres, (iii) ecological diversification, but mainly in (iv) variation ranges of chromosome and genome sizes, which are in Eleocharis ones of the largest known among angiosperms genera. (en)
- Hlavním cílem projektu je analýza patternů genomických parametrů: (i) velikost genomu, (ii) počet chromosomů, (iii) velikost chromosomů, (iv) genomový AT/GC poměr, (v-vi) diverzita a dominance retrotransposonů u taxonů dvou kontrastních modelových rodů s holokinetickými chromosomy Carex a Eleocharis. Evoluční dynamika těchto druhově specifických genomických parametrů v rámci fylogeneze založené na molekulárních sekvenčních znacích bude využita ke zhodnocení role klíčových mechanizmů evoluce velikosti genomu: (i) polyploidie; (ii) agmatoploidie, (iii) symploidie, (iv-v) amplifikace a eliminace retrotransposonů v hlavních evolučních liniích studovaných taxonů. Modelem není tudíž konkrétní druh jako v klasických genomických studiích, ale skupina druhů spojená sítí jejich evoluční příbuznosti. Modelové rody jsou kontrastní v (i) druhové diverzitě, (ii) evolučních centrech, (iii) ekologické diverzifikaci, ale hlavně v (iv) rozsahu velikosti chromosomů a genomů, který je u Eleocharis jeden z největších v rámci krytosemenných rodů se známou velikostí genomu a počtem chromosomů.
|
| Title
| - Genome size and karyotype evolution in Cyperaceae (en)
- Evoluce karyotypu a velikosti genomu v čeledi Cyperaceae
|
| skos:notation
| |
| http://linked.open...avai/cep/aktivita
| |
| http://linked.open...kovaStatniPodpora
| |
| http://linked.open...ep/celkoveNaklady
| |
| http://linked.open...datumDodatniDoRIV
| |
| http://linked.open...i/cep/druhSouteze
| |
| http://linked.open...ep/duvernostUdaju
| |
| http://linked.open.../cep/fazeProjektu
| |
| http://linked.open...ai/cep/hlavniObor
| |
| http://linked.open...hodnoceniProjektu
| |
| http://linked.open...vai/cep/kategorie
| |
| http://linked.open.../cep/klicovaSlova
| - Genome; size; evolution; flow; cytometry; genomic; base; composition; chromosome; size; karyology; sedges; Carex; Eleocharis; polyploidy; phylogeny; retroelements (en)
|
| http://linked.open...ep/partnetrHlavni
| |
| http://linked.open...inujicichPrijemcu
| |
| http://linked.open...cep/pocetPrijemcu
| |
| http://linked.open...ocetSpoluPrijemcu
| |
| http://linked.open.../pocetVysledkuRIV
| |
| http://linked.open...enychVysledkuVRIV
| |
| http://linked.open...lneniVMinulemRoce
| |
| http://linked.open.../prideleniPodpory
| |
| http://linked.open...iciPoslednihoRoku
| |
| http://linked.open...atUdajeProjZameru
| |
| http://linked.open.../vavai/cep/soutez
| |
| http://linked.open...usZobrazovaneFaze
| |
| http://linked.open...ai/cep/typPojektu
| |
| http://linked.open...ep/ukonceniReseni
| |
| http://linked.open...ep/zahajeniReseni
| |
| http://linked.open...jektu+dodavatelem
| - The project identified key mechanisms in karyotype and genome size evolution in genera Carex and Eleocharis, improved the algorithm for inferring phylogenetic trees and revealed major phylogenetical trends distinguishing holocentric caryotypes from monocentric ones. The project yielded numerous outcomes, majority of them published in highly recognized journals. (en)
- Projekt popsal klíčové mechanismy v evoluci karyotypu a velikosti genomu v rodech Carex a Eleocharis, inovoval algoritmus pro tvorbu fylogenetických stromů a odhalil hlavní fylogenetické trendy odlišující evoluci holocentrických karyotypů od evoluce karyotypů monocentrických. Většina výstupů byla otištěna v renomovaných impaktovaných časopisech. (cs)
|
| http://linked.open...tniCyklusProjektu
| |
| http://linked.open.../cep/klicoveSlovo
| - Genome
- Carex
- Eleocharis
- base
- chromosome
- composition
- cytometry
- evolution
- flow
- genomic
- karyology
- phylogeny
- polyploidy
- sedges
- size
|
| is http://linked.open...vavai/cep/projekt
of | |
![[RDF Data]](/fct/images/sw-rdf-blue.png)
![[cxml]](/fct/images/cxml_doc.png)
![[csv]](/fct/images/csv_doc.png)
![[text]](/fct/images/ntriples_doc.png)
![[turtle]](/fct/images/n3turtle_doc.png)
![[ld+json]](/fct/images/jsonld_doc.png)
![[rdf+json]](/fct/images/json_doc.png)
![[rdf+xml]](/fct/images/xml_doc.png)
![[atom+xml]](/fct/images/atom_doc.png)
![[html]](/fct/images/html_doc.png)