About: Understanding of HMGB1 protein involvement in maintaining genome stability

Facets (new session)
Description
Metadata
Settings
- owl:sameAs
- Inference Rule:

About: Understanding of HMGB1 protein involvement in maintaining genome stability Goto Sponge NotDistinct Permalink

An Entity of Type : http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/Projekt, within Data Space : linked.opendata.cz associated with source document(s)

Attributes	Values
rdf:type	http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/Projekt
rdfs:seeAlso	http://www.isvav.cz/projectDetail.do?rowId=GA204/08/1530
Description	HMGB1 is a relatively abundant chromatin-associated protein and recent data indicated striking chromosomal instability in HMGB1 knock-outed primary mouse embryonic fibroblasts. One mechanism for chromosome instability is through the dysfunction of telomeres, the specific nucleoprotein structures forming chromosome ends and protecting them from recombination and degradation. Recently we have discovered that deficiency of HMGB1 in mouse cells resulted in lower telomerase activity, general telomere shortening or loss, and occasional telomere expansions. We have also identified HMGB1 as a telomerase-associated protein in vitro. As most, if not all, tumor cells over-express HMGB1, deregulated expression of HMGB1 could have catastrophic consequences for the structure of telomeres. In this project we intend to study the impact of aberrant HMGB1 expression (silencing or over-expression) in human cells with different status of tumor suppressor protein p53 on: (i) the activity of telomerase; (ii) the (en) HMGB1 je protein asociovaný s chromatinem a nedávné nálezy prokázaly souvislost mezi delecí HMGB1 genu a extrémní chromozómovou nestabilitou pozorovanou u myších fibroblastů. Jeden z mechanismů objasňujících chromozómovou nestabilitu zahrnuje poruchu funkce telomer, specifických nukleoproteinových struktur chránících konce chromozómů před rekombinací a degradací. Nedávno jsme objevili, že inaktivace HMGB1 genu vede u myších buněk k poklesu aktivity telomerázy (prodlužuje telomery), zkrácení nebo ztrátu telomer, a v ojedinělých případech i jejich prodloužení (nezávislé na telomeráze). Podařilo se nám rovněž identifikovat HMGB1 jako protein vážící se s telomerázou in vitro. Jelikož exprese HMGB1 je vysoká u většiny nádorů, lze se domnívat, že jejíderegulace může mít katastrofální důsledky i pro strukturu telomer. V předkládaném projektu budeme sledovat vliv exprese HMGB1 (snížení nebo zvýšení) v lidských buňkách s definovaným statutem p53 na: (i) aktivitu telomerázy, (ii) expresi proteinové
Title	Understanding of HMGB1 protein involvement in maintaining genome stability (en) Objasnění úlohy proteinu HMGB1 v udržování genomové stability
skos:notation	GA204/08/1530
http://linked.open...avai/cep/aktivita	Standard projects
http://linked.open...kovaStatniPodpora	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/projekt/GA204%2F08%2F1530/celkovaStatniPodpora
http://linked.open...ep/celkoveNaklady	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/projekt/GA204%2F08%2F1530/celkoveNaklady
http://linked.open...datumDodatniDoRIV	2015-02-09 (xsd:date)
http://linked.open...i/cep/druhSouteze	VS - Veřejná soutěž ve výzkumu a vývoji
http://linked.open...ep/duvernostUdaju	S - Úplné a pravdivé údaje nepodléhající ochraně podle zvláštních právních předpisů
http://linked.open.../cep/fazeProjektu	82299451
http://linked.open...ai/cep/hlavniObor	CE - Biochemie
http://linked.open...hodnoceniProjektu	V - Vynikající výsledky (s mezinárodním významem apod.). Zároveň byly splněny cíle a předpokládané výsledky uvedené ve smlouvě / rozhodnutí o poskytnutí podpory.
http://linked.open...vai/cep/kategorie	ZV - Základní výzkum
http://linked.open.../cep/klicovaSlova	HMGB1; p53; transactivation of genes; genomic integrity; telomeres (en)
http://linked.open...ep/partnetrHlavni	Biofyzikální ústav AV ČR, v.v.i.
http://linked.open...inujicichPrijemcu	0 (xsd:int)
http://linked.open...cep/pocetPrijemcu	1 (xsd:int)
http://linked.open...ocetSpoluPrijemcu	1 (xsd:int)
http://linked.open.../pocetVysledkuRIV	13 (xsd:int)
http://linked.open...enychVysledkuVRIV	13 (xsd:int)
http://linked.open...lneniVMinulemRoce	2010-04-16 (xsd:date)
http://linked.open.../prideleniPodpory	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/prideleniPodpory/204%2F08%2F1530
http://linked.open...iciPoslednihoRoku	2010
http://linked.open...atUdajeProjZameru	2011
http://linked.open.../vavai/cep/soutez	SGA02008GA-ST
http://linked.open...usZobrazovaneFaze	DUU
http://linked.open...ai/cep/typPojektu	P - Projekt výzkumu a vývoje financovaný ze státního rozpočtu
http://linked.open...ep/ukonceniReseni	2010-12-31 (xsd:date)
http://linked.open.../cep/vedlejsiObor	BO - Biofyzika EB - Genetika a molekulární biologie
http://linked.open...ep/zahajeniReseni	2008-01-01 (xsd:date)
http://linked.open...jektu+dodavatelem	Podařilo se nám prokázat, že knockout HMGB1 genu v imortalizovaných myšších embryonálních fibroblastech (MEF) vede k signifikantnímu poklesu (>5-krát) telomerázové aktivity.V souladu s timto nálezem jsme prokázali zvýšenou telomerázovou aktivitu v MEF buňkách exprimujících protein HMGB1 (kódovaný plazmidem). MEF buňky postrádající HMGB1 vykazují značné chromozomální abnormality a zkrácení déle (cs) We have shown that knockout of the HMGB1 gene (HMGB1-/-) resulted in immortalized mouse embryonic fibroblasts (MEFs) in significant (>5-fold) decrease in telomerase activity. Correspondingly, enhanced telomerase activity was detected in MEFs with (plasmid-directed) over-expression of HMGB1 protein.  MEFs lacking HMGB1 protein exhibited striking chromosomal abnormalities, a moderate shorte (en)
http://linked.open...tniCyklusProjektu	ZBKU
http://linked.open.../cep/klicoveSlovo	HMGB1 genomic integrity p53 transactivation of genes
is http://linked.open...vavai/cep/projekt of	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GA204%2F08%2F1530/2008/ico%3A68081707 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GA204%2F08%2F1530/2008/orjk%3A14310 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GA204%2F08%2F1530/2009/ico%3A68081707 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GA204%2F08%2F1530/2009/orjk%3A14310 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GA204%2F08%2F1530/2010/ico%3A68081707 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GA204%2F08%2F1530/2010/orjk%3A14310 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GA204%2F08%2F1530/2011/ico%3A68081707

Faceted Search & Find service v1.16.118 as of Jun 21 2024

Alternative Linked Data Documents: ODE Content Formats:

RDF

ODATA

Microdata

About

OpenLink Virtuoso version 07.20.3240 as of Jun 21 2024, on Linux (x86_64-pc-linux-gnu), Single-Server Edition (126 GB total memory, 25 GB memory in use)
Data on this page belongs to its respective rights holders.
Virtuoso Faceted Browser Copyright © 2009-2025 OpenLink Software