About: Ultrafast genome mapping and DNA sequence analysis by pulsed field electrophoresis in short capillaries

Facets (new session)
Description
Metadata
Settings
- owl:sameAs
- Inference Rule:

About: Ultrafast genome mapping and DNA sequence analysis by pulsed field electrophoresis in short capillaries Goto Sponge NotDistinct Permalink

An Entity of Type : http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/Projekt, within Data Space : linked.opendata.cz associated with source document(s)

Attributes	Values
rdf:type	http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/Projekt
rdfs:seeAlso	http://www.isvav.cz/projectDetail.do?rowId=GA203/97/0347
Description	The overall goal of the project is to develop the method of pulsed-field electrophoresis in short capillaries as a routine technology for ultrafast diagnostic DNA sequencing and for analysis of megabase-size restriction fragments of a genomic DNA. We were inspired to the introduction of short capillaries by our previous observation of high separation power at the free electrolyte - polymer solution interface. Our project involves also an attempt to realize a separation of biopolymers on a solid and/or liquid polymer membrane. It follows from our preliminary separations in short capilaries held at an elevated temperature that a sequence up to 300 bases (reasonable for diagnostic sequencing) can be determined in three minutes. Further improvement in the length of sequence reading in capillaries is expected as a result of an application of pulsing field. Pulsed-field capillary electrophoresis will also be used in the genetic research of bateriophages and pathogenic bacteria. This technique enable us to e (en) Cílem tohoto projektu je vyvinout metodu pulzní elektroforézy v krátkých kapilárách jako rutinní technologii pro superrychlé diagnostické sekvencování DNA a pro analýzu restrikčních fragmentů genomové DNA o megabázových velikostech. K zavedení krátkých kapilár jsme byli inspirováni na základě našich dřívějších pozorování vysoké separační schopnosti na rozhraní volný elektrolyt-roztok polymeru. Náš projekt také zahrnuje pokus uskutečnit separaci biopolymerů na pevné nebo kapalné polymerní membráně. Jak vyplývá z našich předběžných modelových separací v krátkých kapilárách při vyšších teplotách, může být stanovena sekvence až 300 bází, což je dostačující délka pro diagnostické sekvencování, za 3 minuty. Další zlepšení délky čtení sekvence v kapilárách jemožné očekávat při použití pulzního pole. Kapilární elektroforéza v pulzním poli bude použita také v genetickém výzkumu bakteriofágů a patogenních bakterií. Tato technika nám umožní zvýšit horní délkový limit kapilární elektroforézy pro mapování genomu
Title	Ultrafast genome mapping and DNA sequence analysis by pulsed field electrophoresis in short capillaries (en) Superrychlé mapování genomu a analýza sekvencí DNA pulzní elektroforézou v krátkých kapilárách
skos:notation	GA203/97/0347
http://linked.open...avai/cep/aktivita	Standard projects
http://linked.open...kovaStatniPodpora	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/projekt/GA203%2F97%2F0347/celkovaStatniPodpora
http://linked.open...ep/celkoveNaklady	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/projekt/GA203%2F97%2F0347/celkoveNaklady
http://linked.open...ep/duvernostUdaju	S - Úplné a pravdivé údaje nepodléhající ochraně podle zvláštních právních předpisů
http://linked.open.../cep/fazeProjektu	505127
http://linked.open...ai/cep/hlavniObor	CB - Analytická chemie, separace
http://linked.open...hodnoceniProjektu	V - Vynikající výsledky (s mezinárodním významem apod.). Zároveň byly splněny cíle a předpokládané výsledky uvedené ve smlouvě / rozhodnutí o poskytnutí podpory.
http://linked.open...ep/partnetrHlavni	Ústav analytické chemie AV ČR, v. v. i.
http://linked.open...inujicichPrijemcu	0 (xsd:int)
http://linked.open...cep/pocetPrijemcu	1 (xsd:int)
http://linked.open...ocetSpoluPrijemcu	0 (xsd:int)
http://linked.open.../pocetVysledkuRIV	4 (xsd:int)
http://linked.open...enychVysledkuVRIV	4 (xsd:int)
http://linked.open...iciPoslednihoRoku	2000
http://linked.open...atUdajeProjZameru	2000
http://linked.open...usZobrazovaneFaze	DUU
http://linked.open...ai/cep/typPojektu	P - Projekt výzkumu a vývoje financovaný ze státního rozpočtu
http://linked.open.../cep/vedlejsiObor	EB - Genetika a molekulární biologie
http://linked.open...jektu+dodavatelem	Kapilární elektroforéza v pulzním poli představuje v současné době jednu z nejvyužívanějších metodik i ve srovnání se světem. Mapování genomu rovněž je předmětem zájmu všech vyspělých zemí, a proto je možno hodnotit výsledky tohoto projektu za velmi dobr (cs)
http://linked.open...tniCyklusProjektu	ZBKU
is http://linked.open...vavai/cep/projekt of	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GA203%2F97%2F0347/1997/ico%3A68081715 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GA203%2F97%2F0347/1998/ico%3A68081715 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GA203%2F97%2F0347/1999/ico%3A68081715 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GA203%2F97%2F0347/2000/ico%3A68081715

Faceted Search & Find service v1.16.118 as of Jun 21 2024

Alternative Linked Data Documents: ODE Content Formats:

RDF

ODATA

Microdata

About

OpenLink Virtuoso version 07.20.3240 as of Jun 21 2024, on Linux (x86_64-pc-linux-gnu), Single-Server Edition (126 GB total memory, 39 GB memory in use)
Data on this page belongs to its respective rights holders.
Virtuoso Faceted Browser Copyright © 2009-2024 OpenLink Software