About: Functional and structural study of mutants of matrix protein from Mason-Pfizer monkey virus which affects budding

Facets (new session)
Description
Metadata
Settings
- owl:sameAs
- Inference Rule:

About: Functional and structural study of mutants of matrix protein from Mason-Pfizer monkey virus which affects budding Goto Sponge NotDistinct Permalink

An Entity of Type : http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/Projekt, within Data Space : linked.opendata.cz associated with source document(s)

Attributes	Values
rdf:type	http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/Projekt
rdfs:seeAlso	http://www.isvav.cz/projectDetail.do?rowId=GA203/07/0872
Description	Matrix protein (MA) forms an outer shell of mature viral particles and because it is the N-terminal domain of the polyprotein Gag it is also exposed on the surface of immature capsids. It was demonstrated that a tiny modification like a mutation of one or two amino acid residues in MA domain results in dramatic changes in the behavior of the whole virus. We will focus our attention on structural and biochemical study of two mutants of MA protein of Mason-Pfizer monkey virus, i.e. T41I/T78I and Y28F/Y67F, respectively. These mutants have been shown that being incorporated in Gag the viruses assemble immature capsids with a normal kinetics, they are transport competent however, they are not capable of being released from the infected cells. It was hypothesized that the mutants have more hydrophobic protein cores and therefore, they sequester the N-terminal myristic acid in their interiors which can not be properly released for the interaction with the plasma memebrane. We will search for (en) Matrixový protein (MA) tvoří vnější slupku zralých virových částic, a jelikož se jedná o N terminální doménu polyproteinu Gag, je exponován i na povrchu nezralých virových částic. Bylo prokázáno, že tak napatrná modifikace jakou je mutace jednoho nebo dvou aminokyselinových zbytků MA domény má za následek dramatické změny v chování celého viru. Soustředíme se na strukturní a biochemické studie dvou mutantů MA proteinu Mason-Pfizerova opičího viru, totiž T41I/T78I a Y28F/Y67F. Bylo prokázáno, že pokud jsou tyto mutanty součástí Gagu, virus skládá nezralé částice běžnou kinetikou, tyto jsou transportovány k buněčné membráně, avšak nejsou schopny vypučet. Byla vznesena hypotéza, že tyto mutanty mají hydrofobnější jádro a tudíž vážou zbytek kyseliny myristoylové, která je připojená na N-terminální glycin, uvnitř molekuly a tento zbytek nemůže být uvolněn pro správnou interakci s buněčnou membránou. Budeme proto hledat strukturní změny u výše zmíněných mutantů, které by výše zmíněnou hypotézu
Title	Functional and structural study of mutants of matrix protein from Mason-Pfizer monkey virus which affects budding (en) Funkční a strukturní studie mutantů matrixového proteinu Mason-Pfizerova opičího viru ovlivňující jeho uvolnění z buňky
skos:notation	GA203/07/0872
http://linked.open...avai/cep/aktivita	Standard projects
http://linked.open...kovaStatniPodpora	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/projekt/GA203%2F07%2F0872/celkovaStatniPodpora
http://linked.open...ep/celkoveNaklady	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/projekt/GA203%2F07%2F0872/celkoveNaklady
http://linked.open...datumDodatniDoRIV	2015-01-22 (xsd:date)
http://linked.open...i/cep/druhSouteze	VS - Veřejná soutěž ve výzkumu a vývoji
http://linked.open...ep/duvernostUdaju	S - Úplné a pravdivé údaje nepodléhající ochraně podle zvláštních právních předpisů
http://linked.open.../cep/fazeProjektu	65674726
http://linked.open...ai/cep/hlavniObor	CE - Biochemie
http://linked.open...hodnoceniProjektu	U - Uspěl podle zadání, tj. byly splněny cíle a jeho předpokládané výsledky uvedené ve smlouvě / rozhodnutí o poskytnutí podpory
http://linked.open...vai/cep/kategorie	ZV - Základní výzkum
http://linked.open.../cep/klicovaSlova	M-PMV; matrix protein; Gag; NMR; mutant; protein structure (en)
http://linked.open...ep/partnetrHlavni	Fakulta chemicko-inženýrská
http://linked.open...inujicichPrijemcu	0 (xsd:int)
http://linked.open...cep/pocetPrijemcu	1 (xsd:int)
http://linked.open...ocetSpoluPrijemcu	0 (xsd:int)
http://linked.open.../pocetVysledkuRIV	2 (xsd:int)
http://linked.open...enychVysledkuVRIV	2 (xsd:int)
http://linked.open...lneniVMinulemRoce	2009-04-22 (xsd:date)
http://linked.open.../prideleniPodpory	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/prideleniPodpory/203%2F07%2F0872
http://linked.open...iciPoslednihoRoku	2009
http://linked.open...atUdajeProjZameru	2010
http://linked.open.../vavai/cep/soutez	SGA02007GA-ST
http://linked.open...usZobrazovaneFaze	DUU
http://linked.open...ai/cep/typPojektu	P - Projekt výzkumu a vývoje financovaný ze státního rozpočtu
http://linked.open...ep/ukonceniReseni	2009-12-31 (xsd:date)
http://linked.open...ep/zahajeniReseni	2007-01-01 (xsd:date)
http://linked.open...jektu+dodavatelem	. (en) Projekt byl splněn výborně. Byla vyřešena struktura tří mutantů matrixového proteinu Mason-Pfizerova opičího viru pomocí NMR spektroskopie a homologního počítačového modelování. Byla navržena struktura dimeru a trimeru tohoto proteinu. Bylo zjištěno, že j (cs)
http://linked.open...tniCyklusProjektu	ZBKU
http://linked.open.../cep/klicoveSlovo	M-PMV Gag NMR matrix protein mutant
is http://linked.open...vavai/cep/projekt of	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GA203%2F07%2F0872/2007/orjk%3A22340 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GA203%2F07%2F0872/2008/orjk%3A22340 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GA203%2F07%2F0872/2009/orjk%3A22340 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GA203%2F07%2F0872/2010/orjk%3A22340

Faceted Search & Find service v1.16.118 as of Jun 21 2024

Alternative Linked Data Documents: ODE Content Formats:

RDF

ODATA

Microdata

About

OpenLink Virtuoso version 07.20.3240 as of Jun 21 2024, on Linux (x86_64-pc-linux-gnu), Single-Server Edition (126 GB total memory, 32 GB memory in use)
Data on this page belongs to its respective rights holders.
Virtuoso Faceted Browser Copyright © 2009-2024 OpenLink Software