About: a-N-Acetylgalactosaminidase and a-galactosidase-structural and functional characterisation, use in synthesis of biologically important glycoconjugates

Facets (new session)
Description
Metadata
Settings
- owl:sameAs
- Inference Rule:

About: a-N-Acetylgalactosaminidase and a-galactosidase-structural and functional characterisation, use in synthesis of biologically important glycoconjugates Goto Sponge NotDistinct Permalink

An Entity of Type : http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/Projekt, within Data Space : linked.opendata.cz associated with source document(s)

Attributes	Values
rdf:type	http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/Projekt
rdfs:seeAlso	http://www.isvav.cz/projectDetail.do?rowId=GA203/05/0172
Description	The screening in fungal strains originating from public collections will create an enzyme library of a-N-acetylgalactosaminidases and a-galactosidases. a-Galactosidase from Talaromyces flavus identified as to be suitable for synthesis of glycosides of sterically hindered alcohols will be studied in detail. Enzyme production, purification with respect to the isoenzymes will be performed. We will scale up its production and develop immobilized. Proteins will be characteri-zed for structural (proteomics)and functional properties. Based on the AA and DNA sequencing and by comparison with existing sequences and crystal structures in silico model will be created that will be used for the modeling of interactions with modified substrates. Enzyme(s) will be employed for synthesis of glycoconjugates (xenotransplantation antigen, AB aglutinogen) and for the studies with the modified substrates (glycosylazides, glycosyl-fluorides). Screening for a-N-acetylgalactosaminidase will be performed with a special (en) Bude vytvořena enzymová knihovna fungálních extracelulárních a-N-acetylgalaktosaminidas a a-galaktosidas screeningem u fungálních sbírkových kmenů. Podrobně bude studována a-galaktosidasa z houby Talaromyces flavus, která byla již dříve identifikována jako velmi vhodná pro enzymovou syntézu glykosidů stericky bráněných alkoholů. Bude optimalizována produkce enzymu, bude provedena její puri-fikace se zvláštním zřetelem k výskytu isoenzymů. Bude proveden scale-up a imobilizace enzymu . Protein(y) budou charakterizovány z funkčního a proteomického hlediska. Na základě AK a DNA sekvenování bude provedeno srovnání s existujícími sekvencemi a krystalovými strukturami a vytvořen model in silico, který bude využit pro modelování interakcí s modifikovanými substráty. Enzym(y) budou využity pro syntézu a modifikaci glykokonjugátů (xenotransplantační antigen, AB aglutinogeny) a pro studie s modifikovanými substráty (glykosylazidy, glykosylfluoridy). Dále bude proveden screening na a-N-acetylgalaktosaminidasu
Title	a-N-Acetylgalactosaminidase and a-galactosidase-structural and functional characterisation, use in synthesis of biologically important glycoconjugates (en) a-N-Acetylgalaktosaminidasa a a-galaktosidasa -strukturální a funkční charakterizace, jejich aplikace v synthese biologicky aktivních glykokonjugátů
skos:notation	GA203/05/0172
http://linked.open...avai/cep/aktivita	Standard projects
http://linked.open...kovaStatniPodpora	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/projekt/GA203%2F05%2F0172/celkovaStatniPodpora
http://linked.open...ep/celkoveNaklady	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/projekt/GA203%2F05%2F0172/celkoveNaklady
http://linked.open...datumDodatniDoRIV	2008-12-16 (xsd:date)
http://linked.open...i/cep/druhSouteze	VS - Veřejná soutěž ve výzkumu a vývoji
http://linked.open...ep/duvernostUdaju	S - Úplné a pravdivé údaje nepodléhající ochraně podle zvláštních právních předpisů
http://linked.open.../cep/fazeProjektu	71263213
http://linked.open...ai/cep/hlavniObor	CE - Biochemie
http://linked.open...hodnoceniProjektu	U - Uspěl podle zadání, tj. byly splněny cíle a jeho předpokládané výsledky uvedené ve smlouvě / rozhodnutí o poskytnutí podpory
http://linked.open...vai/cep/kategorie	ZV - Základní výzkum
http://linked.open.../cep/klicovaSlova	glycosidases; biotransformation; proteomics; glycobiology; oligosaccharides (en)
http://linked.open...ep/partnetrHlavni	Mikrobiologický ústav AV ČR, v.v.i.
http://linked.open...inujicichPrijemcu	0 (xsd:int)
http://linked.open...cep/pocetPrijemcu	1 (xsd:int)
http://linked.open...ocetSpoluPrijemcu	3 (xsd:int)
http://linked.open.../pocetVysledkuRIV	16 (xsd:int)
http://linked.open...enychVysledkuVRIV	16 (xsd:int)
http://linked.open...lneniVMinulemRoce	2007-05-02 (xsd:date)
http://linked.open.../prideleniPodpory	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/prideleniPodpory/203%2F05%2F0172
http://linked.open...iciPoslednihoRoku	2007
http://linked.open...atUdajeProjZameru	2008
http://linked.open.../vavai/cep/soutez	SGA02005GA-ST
http://linked.open...usZobrazovaneFaze	DUU
http://linked.open...ai/cep/typPojektu	P - Projekt výzkumu a vývoje financovaný ze státního rozpočtu
http://linked.open...ep/ukonceniReseni	2007-12-31 (xsd:date)
http://linked.open.../cep/vedlejsiObor	EB - Genetika a molekulární biologie EE - Mikrobiologie, virologie
http://linked.open...ep/zahajeniReseni	2005-01-01 (xsd:date)
http://linked.open...jektu+dodavatelem	Byl proveden rozsáhlý screening producenta vzácného enzymu ?-N-acetylgalaktosaminidasy a jako optimální producent nalezen kmen Aspergillus niger, bylo optimalizováno produkční medium a kultivační podmínky. Enzym byl purifikován, charakterizován a stanove (cs) Large screening of rare enzyme ?-N-acetylgalactosaminidase was performed and as the best producer Aspergillus niger was identified and the production medium and the conditions were optimized. The enzyme was purified, characterized, sequenced and recombin (en)
http://linked.open...tniCyklusProjektu	ZBKU
http://linked.open.../cep/klicoveSlovo	biotransformation glycobiology proteomics glycosidases
is http://linked.open...vavai/cep/projekt of	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GA203%2F05%2F0172/2005/ico%3A61388971 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GA203%2F05%2F0172/2005/orjk%3A11310 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GA203%2F05%2F0172/2005/orjk%3A12310 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GA203%2F05%2F0172/2005/orjk%3A22330 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GA203%2F05%2F0172/2006/ico%3A61388971 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GA203%2F05%2F0172/2006/orjk%3A11310 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GA203%2F05%2F0172/2006/orjk%3A12640 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GA203%2F05%2F0172/2006/orjk%3A22330 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GA203%2F05%2F0172/2007/ico%3A61388971 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GA203%2F05%2F0172/2007/orjk%3A11310 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GA203%2F05%2F0172/2007/orjk%3A12640 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GA203%2F05%2F0172/2007/orjk%3A22330 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GA203%2F05%2F0172/2008/ico%3A61388971 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GA203%2F05%2F0172/2008/orjk%3A11310 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GA203%2F05%2F0172/2008/orjk%3A12640 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GA203%2F05%2F0172/2008/orjk%3A22330

Faceted Search & Find service v1.16.118 as of Jun 21 2024

Alternative Linked Data Documents: ODE Content Formats:

RDF

ODATA

Microdata

About

OpenLink Virtuoso version 07.20.3240 as of Jun 21 2024, on Linux (x86_64-pc-linux-gnu), Single-Server Edition (126 GB total memory, 12 GB memory in use)
Data on this page belongs to its respective rights holders.
Virtuoso Faceted Browser Copyright © 2009-2025 OpenLink Software