About: Integrated genome and proteome analysis of therapeutically important bacteriophages by combination of electrophoresis and mass spectrometry

Facets (new session)
Description
Metadata
Settings
- owl:sameAs
- Inference Rule:

About: Integrated genome and proteome analysis of therapeutically important bacteriophages by combination of electrophoresis and mass spectrometry Goto Sponge NotDistinct Permalink

An Entity of Type : http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/Projekt, within Data Space : linked.opendata.cz associated with source document(s)

Attributes	Values
rdf:type	http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/Projekt
rdfs:seeAlso	http://www.isvav.cz/projectDetail.do?rowId=GA203/03/0515
Description	It is expected that selected bacteriophages (bacterial viruses), or even their specific proteins and/or peptides can be used as new effective means to treat bacterial infections. For a rational development of phage therapy, without the adverse effects ofcurrent antibiotics, the relationship between desired biological properties of suitable phages and their genome/proteome structure must be found. To achieve this goal it is necessary to find new technologies for rapid analysis of the phage molecularstructure. In this project, we will develop a three-dimensional separation system for analysis and typing of the phage proteome. First, micropreparative capillary electrophoresis with laser-induced fluorescence detection (LIF) and noncovalent labelingwill be used for the separation of the phage proteins. This fingerprint will be used to trace differences in protein content of phages and to control the automated fraction collection. The resulting fractions will be digested by trypsin immobilized (en) Předpokládá se, že zástupci některých kmenů bakteriofágů (virů bakterií), případně jejich specifické proteiny a peptidy, mohou sloužit jako nové účinné prostředky v léčbě bakteriálních infekcí. Pro racionální vývoj fágové terapie, bez nežádoucích účinkůsoučasných antibiotik, je třeba nalézt vztah mezi požadovanými biologickými vlastnostmi vhodných fágů a jejich genomem a proteomem. K dosažení tohoto cíle je nutné vyvinout novou technologii pro rychlou a spolehlivou analýzu fágové molekulární struktury.V tomto projektu bude vyvinut trojrozměrný separační systém pro analýzu fágů. V první fázi použijeme pro separaci celkové směsi fágových proteinů mikropreparativní kapilární elektroforézu s vysoce citlivou detekcí na bázi laserem indukované fluorescence(LIF) s nekovalentním značením. Získaný fingerprint poslouží k odhalení diferencí proteinového obsahu fágů a k řízení automatického sběru frakcí. Frakce bodou následně štěpeny trypsinem imobilizovaným na stěnách sběrných jamek. V závěrečném kroku budou
Title	Integrated genome and proteome analysis of therapeutically important bacteriophages by combination of electrophoresis and mass spectrometry (en) Integrovaná analýza genomu a proteomu terapeuticky významných bakteriofágů kombinací elektroforézy a hmotnostní spektrometrie
skos:notation	GA203/03/0515
http://linked.open...avai/cep/aktivita	Standard projects
http://linked.open...kovaStatniPodpora	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/projekt/GA203%2F03%2F0515/celkovaStatniPodpora
http://linked.open...ep/celkoveNaklady	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/projekt/GA203%2F03%2F0515/celkoveNaklady
http://linked.open...datumDodatniDoRIV	2009-01-15 (xsd:date)
http://linked.open...i/cep/druhSouteze	VS - Veřejná soutěž ve výzkumu a vývoji
http://linked.open...ep/duvernostUdaju	S - Úplné a pravdivé údaje nepodléhající ochraně podle zvláštních právních předpisů
http://linked.open.../cep/fazeProjektu	33434054
http://linked.open...ai/cep/hlavniObor	CB - Analytická chemie, separace
http://linked.open...hodnoceniProjektu	V - Vynikající výsledky (s mezinárodním významem apod.). Zároveň byly splněny cíle a předpokládané výsledky uvedené ve smlouvě / rozhodnutí o poskytnutí podpory.
http://linked.open...vai/cep/kategorie	ZV - Základní výzkum
http://linked.open.../cep/klicovaSlova	Neuvedeno. (en)
http://linked.open...ep/partnetrHlavni	Přírodovědecká fakulta
http://linked.open...inujicichPrijemcu	0 (xsd:int)
http://linked.open...cep/pocetPrijemcu	1 (xsd:int)
http://linked.open...ocetSpoluPrijemcu	1 (xsd:int)
http://linked.open.../pocetVysledkuRIV	38 (xsd:int)
http://linked.open...enychVysledkuVRIV	38 (xsd:int)
http://linked.open...okUkonceniPodpory	2005
http://linked.open...okZahajeniPodpory	2003
http://linked.open...iciPoslednihoRoku	2006
http://linked.open...atUdajeProjZameru	2006
http://linked.open.../vavai/cep/soutez	SGA02003GA-ST
http://linked.open...usZobrazovaneFaze	DUU
http://linked.open...ai/cep/typPojektu	P - Projekt výzkumu a vývoje financovaný ze státního rozpočtu
http://linked.open.../cep/vedlejsiObor	EB - Genetika a molekulární biologie
http://linked.open...jektu+dodavatelem	Srovnání sekvencí DNA polyvalentního stafylokokového fága 812, jeho mutant a příbuzných fágů vedlo k odhalení a následně pak k podrobné charakterizaci mutačních změn fágového genomu, majících přímou souvislost s jejich rozmezím hostitelů. Významným výsle (cs) Comparison of DNA sequences of polyvalent staphylococcal phage 812, its mutants and related phages led to discovery and consequently to detail characterization of mutation changes in phage genome, which are related directly to their host range. Major res (en)
http://linked.open...tniCyklusProjektu	ZBKU
is http://linked.open...vavai/cep/projekt of	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GA203%2F03%2F0515/2003/ico%3A68081715 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GA203%2F03%2F0515/2003/orjk%3A14310 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GA203%2F03%2F0515/2004/ico%3A68081715 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GA203%2F03%2F0515/2004/orjk%3A14310 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GA203%2F03%2F0515/2005/ico%3A68081715 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GA203%2F03%2F0515/2005/orjk%3A14310 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GA203%2F03%2F0515/2006/ico%3A68081715 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GA203%2F03%2F0515/2006/orjk%3A14310 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GA203%2F03%2F0515/2007/ico%3A68081715 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GA203%2F03%2F0515/2007/orjk%3A14310

Faceted Search & Find service v1.16.118 as of Jun 21 2024

Alternative Linked Data Documents: ODE Content Formats:

RDF

ODATA

Microdata

About

OpenLink Virtuoso version 07.20.3240 as of Jun 21 2024, on Linux (x86_64-pc-linux-gnu), Single-Server Edition (126 GB total memory, 47 GB memory in use)
Data on this page belongs to its respective rights holders.
Virtuoso Faceted Browser Copyright © 2009-2024 OpenLink Software