About: Gene expression and posttranslational modification during germination of aerial spores of streptomycetes

Facets (new session)
Description
Metadata
Settings
- owl:sameAs
- Inference Rule:

About: Gene expression and posttranslational modification during germination of aerial spores of streptomycetes Goto Sponge NotDistinct Permalink

An Entity of Type : http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/Projekt, within Data Space : linked.opendata.cz associated with source document(s)

Attributes	Values
rdf:type	http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/Projekt
rdfs:seeAlso	http://www.isvav.cz/projectDetail.do?rowId=GA203/02/1421
Description	Aim of the proposal is to clarify gene expression during germination of aerial spores of streptomycetes. Synchronous germination of spores makes it possible to examine expression and posttranslational modification of proteins before and after the first DNA replication. Quantitative changes in gene expression will be examined using 15N-incorporation and tryptic peptides of model proteins from 2-D gels will be analyzed using MALDI-TOF. MS analysis will be used both to identify the proteins in the gel spots and to determine their relative abundance from shifts in mass due to incorporation of 15N. Pulse radioactive labeling together with phosphor-imaging permits to determine amounts of all individual proteins separated on the 2-D gel. Statistical analysis alowe to identify protein spots exhibiting significant changes during germination and their posttranslational modification. Small RNAs (riboregulators, sRNA) modulate the translation of many cellular mRNAs. Expression and structure of sRNA from (en) Navrhovaný projekt má přispět k objasnění genové exprese v průběhu germinace vzdušných spor streptomycet. Synchronní germinace spor umožní sledovat expresi a posttranslační modifikace proteinů před a po prvé replikaci DNA. Kvantitativní změny v genové expresi modelových proteinů v průběhu germinace budou sledovány pomocí inkorporace 15N do bílkovin. Tryptické peptidy modelových proteinů z 2-D gelů budou identifikovány MALDI-TOF hmotnostní spektrometrií. Relativní obsah proteinů lze odvodit z posunu hmotností. Pulzní značení proteinů a vyhodnocování 2-D gelů fosfor-imagerem umožní sledovat množství radioaktivity inkorporované do všech proteinů v daném čase i posttranslační modifikace. Statistickou analýzou lze určit změny v expresi a detekovat proteiny, které vykazují signifikantní změny. Nízkomolekulární RNA (riboregulátory, sRNA) modulují translaci mnoha mRNA. Budou charakterizovány sRNA u streptomycet a jejich exprese. Hybridizace značené sRNA s restrikčními fragmenty chromosomální DNA
Title	Gene expression and posttranslational modification during germination of aerial spores of streptomycetes (en) Genová exprese a posttranslační modifikace v průběhu germinace vzdušných spor streptomycet
skos:notation	GA203/02/1421
http://linked.open...avai/cep/aktivita	Standard projects
http://linked.open...kovaStatniPodpora	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/projekt/GA203%2F02%2F1421/celkovaStatniPodpora
http://linked.open...ep/celkoveNaklady	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/projekt/GA203%2F02%2F1421/celkoveNaklady
http://linked.open...datumDodatniDoRIV	2008-06-02 (xsd:date)
http://linked.open...i/cep/druhSouteze	VS - Veřejná soutěž ve výzkumu a vývoji
http://linked.open...ep/duvernostUdaju	S - Úplné a pravdivé údaje nepodléhající ochraně podle zvláštních právních předpisů
http://linked.open.../cep/fazeProjektu	1564715
http://linked.open...ai/cep/hlavniObor	EB - Genetika a molekulární biologie
http://linked.open...hodnoceniProjektu	U - Uspěl podle zadání, tj. byly splněny cíle a jeho předpokládané výsledky uvedené ve smlouvě / rozhodnutí o poskytnutí podpory
http://linked.open...vai/cep/kategorie	ZV - Základní výzkum
http://linked.open.../cep/klicovaSlova	Neuvedeno. (en)
http://linked.open...ep/partnetrHlavni	Mikrobiologický ústav AV ČR, v.v.i.
http://linked.open...inujicichPrijemcu	0 (xsd:int)
http://linked.open...cep/pocetPrijemcu	1 (xsd:int)
http://linked.open...ocetSpoluPrijemcu	0 (xsd:int)
http://linked.open.../pocetVysledkuRIV	3 (xsd:int)
http://linked.open...enychVysledkuVRIV	3 (xsd:int)
http://linked.open...okUkonceniPodpory	2004
http://linked.open...okZahajeniPodpory	2002
http://linked.open...iciPoslednihoRoku	2005
http://linked.open...atUdajeProjZameru	2005
http://linked.open.../vavai/cep/soutez	SGA02002GA-ST
http://linked.open...usZobrazovaneFaze	DUU
http://linked.open...ai/cep/typPojektu	P - Projekt výzkumu a vývoje financovaný ze státního rozpočtu
http://linked.open.../cep/vedlejsiObor	CE - Biochemie EE - Mikrobiologie, virologie
http://linked.open...jektu+dodavatelem	Získali jsme původní poznatky o aktivaci a expresi proteinů v průběhu synchronní germinace vzdušných spor streptomycet. V první fázi aktivace jsou proteiny spor rychle hydratovány.Vzdušné spory obsahují tři hlavní chaperony GroEL/ES, Trigger faktor(TF) a (cs) Our data provide the first evidence on activation and expression of proteins during synchronous germination of aerial spores.The first phase of protein activation is associated with the solubility of proteins. The data shows that aerial spores contain th (en)
http://linked.open...tniCyklusProjektu	ZBKU
is http://linked.open...vavai/cep/projekt of	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GA203%2F02%2F1421/2002/ico%3A61388971 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GA203%2F02%2F1421/2003/ico%3A61388971 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GA203%2F02%2F1421/2004/ico%3A61388971 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GA203%2F02%2F1421/2005/ico%3A61388971

Faceted Search & Find service v1.16.118 as of Jun 21 2024

Alternative Linked Data Documents: ODE Content Formats:

RDF

ODATA

Microdata

About

OpenLink Virtuoso version 07.20.3240 as of Jun 21 2024, on Linux (x86_64-pc-linux-gnu), Single-Server Edition (126 GB total memory, 85 GB memory in use)
Data on this page belongs to its respective rights holders.
Virtuoso Faceted Browser Copyright © 2009-2024 OpenLink Software