About: Chiroptical properties, conformation and dynamical behaviour of the middle sized oligopeptide having structural domains with different flexibility

Facets (new session)
Description
Metadata
Settings
- owl:sameAs
- Inference Rule:

About: Chiroptical properties, conformation and dynamical behaviour of the middle sized oligopeptide having structural domains with different flexibility Goto Sponge NotDistinct Permalink

An Entity of Type : http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/Projekt, within Data Space : linked.opendata.cz associated with source document(s)

Attributes	Values
rdf:type	http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/Projekt
rdfs:seeAlso	http://www.isvav.cz/projectDetail.do?rowId=GA203/02/0328
Description	Vibrational circular dichroism (VCD) spectroscopy is potentially capable to provide rather detailed information about three dimensional structure and dynamics of the difficult-to-investigate class of middle sized molecules, e.g. oligopeptides. We intend to investigate this possibility in depth using several classes of oligopeptides in the molecules of which there are either distinct domains differring in flexibility and conformation or where rigid domains are connected with flexible links. Such molecules provide a good possibility to apply ab initio techniques to interpretation of vibrational optical activity data via the technique of transferring molecular property tensors. We have selected as the main goal the so-called hinge peptide (fragment of human igG1) in which two rigid octapeptide chains rich in proline are connected via flexible disulfide links. As model systems we will also investigate dioxopiperazine molecules containing basic amino acid residues embedded in a peptide (en) Vibrační cirkulární dichroismus (VCD) je s největší pravděpodobností schopen poskytovat detailní informace o trojrozměrné struktuře a dynamickém chování středně velkých molekul (např. oligopeptidů), které je zpravidla obtížné jinými technikami studovat. Máme v úmyslu prozkoumat tuto možnost užitím několika typů oligopeptidů, jejichž společným rysem je buď přítomnost oddělených oblastí, které se liší konformací nebo dynamikou, případně takových molekul, v nichž oblasti s rigidním uspořádáním jsou propojeny flexibilní spojkou. Takové molekuly poskytují možnost aplikace ab initio technik k interpretaci dat vibrační optické aktivity technikou přenosu tenzorů molekulárních vlastností. Jako hlavní cíl jsme zvolili tak zvaný %22hinge pepti%22 (fragment lidského imunoglobulinu igGl), v jehož molekule jsou dva rigidní řetězce oktapeptidu (bohaté na prolin) propojeny pohyblivými disulfidickými můstky. Jako modelové systémy budeme rovněž zkoumat molekuly dioxopiperazinů obsahující bazické aminokyseliny,
Title	Chiroptical properties, conformation and dynamical behaviour of the middle sized oligopeptide having structural domains with different flexibility (en) Chiroptické vlastnosti, konformace a dynamické chování středně velkého oligopeptidu se strukturními doménami o výrazně odlišné flexibilitě
skos:notation	GA203/02/0328
http://linked.open...avai/cep/aktivita	Standard projects
http://linked.open...kovaStatniPodpora	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/projekt/GA203%2F02%2F0328/celkovaStatniPodpora
http://linked.open...ep/celkoveNaklady	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/projekt/GA203%2F02%2F0328/celkoveNaklady
http://linked.open...datumDodatniDoRIV	2008-06-02 (xsd:date)
http://linked.open...i/cep/druhSouteze	VS - Veřejná soutěž ve výzkumu a vývoji
http://linked.open...ep/duvernostUdaju	S - Úplné a pravdivé údaje nepodléhající ochraně podle zvláštních právních předpisů
http://linked.open.../cep/fazeProjektu	1564585
http://linked.open...ai/cep/hlavniObor	CF - Fyzikální chemie a teoretická chemie
http://linked.open...hodnoceniProjektu	U - Uspěl podle zadání, tj. byly splněny cíle a jeho předpokládané výsledky uvedené ve smlouvě / rozhodnutí o poskytnutí podpory
http://linked.open...vai/cep/kategorie	ZV - Základní výzkum
http://linked.open.../cep/klicovaSlova	Neuvedeno. (en)
http://linked.open...ep/partnetrHlavni	Vysoká škola chemicko-technologická v Praze
http://linked.open...inujicichPrijemcu	0 (xsd:int)
http://linked.open...cep/pocetPrijemcu	1 (xsd:int)
http://linked.open...ocetSpoluPrijemcu	1 (xsd:int)
http://linked.open.../pocetVysledkuRIV	14 (xsd:int)
http://linked.open...enychVysledkuVRIV	14 (xsd:int)
http://linked.open...okUkonceniPodpory	2004
http://linked.open...okZahajeniPodpory	2002
http://linked.open...iciPoslednihoRoku	2005
http://linked.open...atUdajeProjZameru	2005
http://linked.open.../vavai/cep/soutez	SGA02002GA-ST
http://linked.open...usZobrazovaneFaze	DUU
http://linked.open...ai/cep/typPojektu	P - Projekt výzkumu a vývoje financovaný ze státního rozpočtu
http://linked.open.../cep/vedlejsiObor	CC - Organická chemie CE - Biochemie
http://linked.open...jektu+dodavatelem	Spectroscopic analysis of the hinge peptide conformation and flexibility resulted in a consistent and reasonably complete picture. The peptide stays in a left handed helical conformation of the Polyproline II type and rather drastic intervention have to (en) Spektroskopická analýza konformace a flexibility hinge peptidu poskytla konsistentní a ucelený obraz. Peptid si zachovává konformaci typu levotočivé šroubovice polyprolin II a k jejímu přechodu na jiný konformační typ jsou potřebné poměrně drastické zás (cs)
http://linked.open...tniCyklusProjektu	ZBKU
is http://linked.open...vavai/cep/projekt of	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GA203%2F02%2F0328/2002/ico%3A60461373 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GA203%2F02%2F0328/2002/ico%3A61388963 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GA203%2F02%2F0328/2003/ico%3A60461373 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GA203%2F02%2F0328/2003/ico%3A61388963 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GA203%2F02%2F0328/2004/ico%3A60461373 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GA203%2F02%2F0328/2004/ico%3A61388963 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GA203%2F02%2F0328/2005/ico%3A60461373 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GA203%2F02%2F0328/2005/ico%3A61388963 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GA203%2F02%2F0328/2007/ico%3A60461373 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GA203%2F02%2F0328/2007/ico%3A61388963

Faceted Search & Find service v1.16.118 as of Jun 21 2024

Alternative Linked Data Documents: ODE Content Formats:

RDF

ODATA

Microdata

About

OpenLink Virtuoso version 07.20.3240 as of Jun 21 2024, on Linux (x86_64-pc-linux-gnu), Single-Server Edition (126 GB total memory, 112 GB memory in use)
Data on this page belongs to its respective rights holders.
Virtuoso Faceted Browser Copyright © 2009-2024 OpenLink Software