About: Identification of genes involved in nitrate transport in P. denitrificans and basic biochemical characterisation on their products

Facets (new session)
Description
Metadata
Settings
- owl:sameAs
- Inference Rule:

About: Identification of genes involved in nitrate transport in P. denitrificans and basic biochemical characterisation on their products Goto Sponge NotDistinct Permalink

An Entity of Type : http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/Projekt, within Data Space : linked.opendata.cz associated with source document(s)

Attributes	Values
rdf:type	http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/Projekt
rdfs:seeAlso	http://www.isvav.cz/projectDetail.do?rowId=GA203/00/P097
Description	The project is supposed to be a part of long time research of bacterial denitrification at the mentioned department, where the kinetics of denitritication and its regulation is studied in Paracoccus denitrifîcams. This project should focus on one of the denitrification limiting factors, e.g. The availability of nitrate to the enzymes of denitrification pathway. The transport system involved in nitrate uptake will be studied using techniques of molecular biology. First, degenerate primers will be designeon the basis of sequence homology with nitrate transporters from other sources. The primers will be then used to isolate the genes involved in P. denitrificans nitrate transport. Further regulation factors will be searched for by comparison of expressionpatterns of the bacterium under both the aerobic and anaerobic conditions on the level of mRNA. An alternative way would be transposon Tn5 mutagenesis, followed by screening for inability to utilize low concentrations of nitrate. Isolated genes will be s (en) Projekt navazuje na dlouhodobou tradici studia denitrifikačních procesů u bakterií na daném pracovišti, kde je studována regulace a kinetika denitrifikace na organizmu Paracoccus denitrificans. Tento projekt by se měl zabývat studiem jednoho z limitních faktorů denitrifikace, totiž dostupnosti dusičnanů enzymům denitritikační kaskády. Transportní systém bude studován s pomocí molekulárně biologických přístupů. Jednak budou na základě sekvenčních podobností transportních systémů dusičnanů z jiných zdrojůvytvořeny degenerované primery, kterých bude použito k izolaci genii zodpovědných za transport dusičnanu u P. denitrifîcans. Dále budou hledány faktory regulace bakteriální denitrifikace porovnáním profilu exprimovaných proteinů buněk při růstu na NO3- aNH4+, a za aerobních a anaerobních podmínek na úrovni mRNA. Alternativní cestou by bylo použití transpozonové mutageneze s pomocí transpozonu TnS. V takovém případě budou hledány mutanty P. denitrifîcans neschopné využívat nízkých koncentrací dusičnanů.
Title	Identification of genes involved in nitrate transport in P. denitrificans and basic biochemical characterisation on their products (en) Identifikace genů pro transport dusičnanů u P. denitrificans a základní biochemická charakterizace jejich produktů
skos:notation	GA203/00/P097
http://linked.open...avai/cep/aktivita	Standard projects
http://linked.open...kovaStatniPodpora	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/projekt/GA203%2F00%2FP097/celkovaStatniPodpora
http://linked.open...ep/celkoveNaklady	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/projekt/GA203%2F00%2FP097/celkoveNaklady
http://linked.open...datumDodatniDoRIV	2003-04-01 (xsd:date)
http://linked.open...i/cep/druhSouteze	VS - Veřejná soutěž ve výzkumu a vývoji
http://linked.open...ep/duvernostUdaju	S - Úplné a pravdivé údaje nepodléhající ochraně podle zvláštních právních předpisů
http://linked.open.../cep/fazeProjektu	749022
http://linked.open...ai/cep/hlavniObor	CE - Biochemie
http://linked.open...hodnoceniProjektu	U - Uspěl podle zadání, tj. byly splněny cíle a jeho předpokládané výsledky uvedené ve smlouvě / rozhodnutí o poskytnutí podpory
http://linked.open.../cep/klicovaSlova	Neuvedeno. (en)
http://linked.open...ep/partnetrHlavni	Přírodovědecká fakulta
http://linked.open...inujicichPrijemcu	0 (xsd:int)
http://linked.open...cep/pocetPrijemcu	1 (xsd:int)
http://linked.open...ocetSpoluPrijemcu	0 (xsd:int)
http://linked.open.../pocetVysledkuRIV	1 (xsd:int)
http://linked.open...enychVysledkuVRIV	1 (xsd:int)
http://linked.open...iciPoslednihoRoku	2002
http://linked.open...atUdajeProjZameru	2002
http://linked.open.../vavai/cep/soutez	SGA02002GA-ST
http://linked.open...usZobrazovaneFaze	DUS
http://linked.open...ai/cep/typPojektu	P - Projekt výzkumu a vývoje financovaný ze státního rozpočtu
http://linked.open...jektu+dodavatelem	Nezhodnoceno. (cs)
http://linked.open...tniCyklusProjektu	ZBS
is http://linked.open...vavai/cep/projekt of	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GA203%2F00%2FP097/2000/orjk%3A14310 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GA203%2F00%2FP097/2001/orjk%3A14310 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GA203%2F00%2FP097/2002/orjk%3A14310

Faceted Search & Find service v1.16.118 as of Jun 21 2024

Alternative Linked Data Documents: ODE Content Formats:

RDF

ODATA

Microdata

About

OpenLink Virtuoso version 07.20.3240 as of Jun 21 2024, on Linux (x86_64-pc-linux-gnu), Single-Server Edition (126 GB total memory, 58 GB memory in use)
Data on this page belongs to its respective rights holders.
Virtuoso Faceted Browser Copyright © 2009-2024 OpenLink Software