About: Mechanisms and impact of polyploidisation in evolution of animals

Facets (new session)
Description
Metadata
Settings
- owl:sameAs
- Inference Rule:

About: Mechanisms and impact of polyploidisation in evolution of animals – lessons from the fish family Botiidae Goto Sponge NotDistinct Permalink

An Entity of Type : http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/Projekt, within Data Space : linked.opendata.cz associated with source document(s)

Attributes	Values
rdf:type	http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/Projekt
rdfs:seeAlso	http://www.isvav.cz/projectDetail.do?rowId=GA13-37277S
Description	The present project addresses the origin and impact of polyploidisation in the freshwater fish family Botiidae, which is widespread across geologically active parts of Asia and contains two diploid and six tetraploid genera. We plan to 1) resolve the origin of polyploidy (autopolyploidisation or allopolyploidisation) using cytogenetics (whole chromosome staining, meiotic division analysis, paint probes) as well as molecular genetics (gene tree analysis of allels within tetraploid individuals), 2) test the monophyly of polyploid taxa (single or multiple polyploidisation events) by phylogenetic analyses of several nuclear and mitochondrial genes, 3) check for recent gene flow between genera of different ploidy by comparing mitochondrial and nuclear phylogenies,, 4) calculate the age of important genealogic events and compare with the geological history of the area. The data should allow drawing general conclusions on the mechanisms and impact of polyploidisation in evolution of animals. (en) Tento projekt je zaměřen na mechanismus, jakým proces polyploidizace může působit jako hlavní hnací síla evoluce společně s vikariancí a adaptivní speciací. V projektu uvádíme vhodný model - sladkovodní ryby čeledi Botiidae, které se vyskytují v geologicky aktivní oblasti Asie a zahrnují dva diploidní a šest tetraploidních rodů. Chtěli bychom 1) rozřešit původ polyploidie (auto- vs. alopolyploidizace) pomocí metod cytogenetiky (barvení celých chromosomů, analýza meiotického dělení, malovací sondy) a molekulární genetiky (analýzou alel v genových stromech u tetraploidních druhů); 2) prověřit monofylii polyploidních taxonů (jedna polyploidizace nebo více nezávislých) fylogenetickou analýzou vybraných jaderných a mitochondriálních genů; 3) prověřit případný tok genů mezi rody různé ploidní úrovně srovnáním mitochondriální a jaderné fylogenie; 4) spočítat stáří významných genealogických událostí a porovnat jej se známou geologickou historií oblasti. Výsledky by měly pomoci při nástinu obecných závěrů o mechanismu a vlivu polyploidizace na evoluci živočichů.
Title	Mechanisms and impact of polyploidisation in evolution of animals – lessons from the fish family Botiidae (en) Mechanismy a role polyploidizace v evoluci živočichů – příklad ryb čeledi Botiidae
skos:notation	GA13-37277S
http://linked.open...avai/cep/aktivita	Standard projects
http://linked.open...kovaStatniPodpora	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/projekt/GA13-37277S/celkovaStatniPodpora
http://linked.open...ep/celkoveNaklady	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/projekt/GA13-37277S/celkoveNaklady
http://linked.open...datumDodatniDoRIV	2015-04-23 (xsd:date)
http://linked.open...i/cep/druhSouteze	VS - Veřejná soutěž ve výzkumu a vývoji
http://linked.open...ep/duvernostUdaju	S - Úplné a pravdivé údaje nepodléhající ochraně podle zvláštních právních předpisů
http://linked.open.../cep/fazeProjektu	100771373
http://linked.open...ai/cep/hlavniObor	EB - Genetika a molekulární biologie
http://linked.open...vai/cep/kategorie	ZV - Základní výzkum
http://linked.open.../cep/klicovaSlova	Evolutionary biology, vicariance, adaptive speciation, cytogenetics, DNA sequences, hybridisation, allopolyploidisation, autopolyploidisation (en)
http://linked.open...ep/partnetrHlavni	Ústav živočišné fyziologie a genetiky AV ČR, v.v.i.
http://linked.open...inujicichPrijemcu	0 (xsd:int)
http://linked.open...cep/pocetPrijemcu	1 (xsd:int)
http://linked.open...ocetSpoluPrijemcu	0 (xsd:int)
http://linked.open.../pocetVysledkuRIV	1 (xsd:int)
http://linked.open...enychVysledkuVRIV	1 (xsd:int)
http://linked.open...lneniVMinulemRoce	2014-03-19 (xsd:date)
http://linked.open.../prideleniPodpory	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/prideleniPodpory/13-37277S
http://linked.open...iciPoslednihoRoku	2015
http://linked.open...atUdajeProjZameru	2015
http://linked.open.../vavai/cep/soutez	SGA0201300005
http://linked.open...usZobrazovaneFaze	DRRVB
http://linked.open...ai/cep/typPojektu	P - Projekt výzkumu a vývoje financovaný ze státního rozpočtu
http://linked.open...ep/ukonceniReseni	2016-12-31 (xsd:date)
http://linked.open.../cep/vedlejsiObor	EG - Zoologie
http://linked.open...ep/zahajeniReseni	2013-02-01 (xsd:date)
http://linked.open...tniCyklusProjektu	ZBB
http://linked.open.../cep/klicoveSlovo	DNA sequences adaptive speciation allopolyploidisation cytogenetics hybridisation vicariance Evolutionary biology
is http://linked.open...vavai/cep/projekt of	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GA13-37277S/2013/ico%3A67985904 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GA13-37277S/2014/ico%3A67985904 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GA13-37277S/2015/ico%3A67985904 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GA13-37277S/2016/ico%3A67985904

Faceted Search & Find service v1.16.118 as of Jun 21 2024

Alternative Linked Data Documents: ODE Content Formats:

RDF

ODATA

Microdata

About

OpenLink Virtuoso version 07.20.3240 as of Jun 21 2024, on Linux (x86_64-pc-linux-gnu), Single-Server Edition (126 GB total memory, 11 GB memory in use)
Data on this page belongs to its respective rights holders.
Virtuoso Faceted Browser Copyright © 2009-2025 OpenLink Software