About: Computational study of interactions of organic matter and biomolecules with mineral surfaces

Facets (new session)
Description
Metadata
Settings
- owl:sameAs
- Inference Rule:

About: Computational study of interactions of organic matter and biomolecules with mineral surfaces Goto Sponge NotDistinct Permalink

An Entity of Type : http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/Projekt, within Data Space : linked.opendata.cz associated with source document(s)

Attributes	Values
rdf:type	http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/Projekt
rdfs:seeAlso	http://www.isvav.cz/projectDetail.do?rowId=GA13-08651S
Description	The project is focused on computer modeling of interactions of organic molecules (natural organic matter, polycyclic aromatic hydrocarbons), biomolecules (DNA building blocks) and binary mixtures of solvents with mineral surfaces applied on environmentally and technologically important systems. Interactions of these molecules with quartz and rutile surfaces will be studied for a set of surface charge densities corresponding to the experimentally or naturally relevant ranges of pH values employing molecular mechanics, molecular dynamics and ab initio techniques. The simulation outputs will provide conformations of the adsorption complexes, thermodynamic properties, i.e. interaction energies, free energies and adsorption isotherms. Leading interactions and roles of participating atoms and groups will be identified in the complexes. Our simulation results will be linked with experimental results, both using existing experimental data as well as carrying out simulations related to ongoing experimental research of our partners. (en) Projekt je zaměřen na počítačové modelování interakcí organických molekul (přírodních organických hmot, polycyklických aromatických uhlovodíků), biomolekul (stavebních bloků DNA) a směsí rozpouštědel s minerálními povrchy s důrazem na ekologicky a technologicky důležité systémy. Interakce těchto molekul s povrchy tvořenými křemenem a rutilem budou studovány pomocí molekulární mechaniky, molekulární dynamiky a ab initio výpočetními metodami pro různé povrchové hustoty náboje povrchů, které odpovídají rozmezí hodnot pH za podmínek experimentu či v přírodních procesech. Ze simulací budou získány struktury adsorbovaných komplexů, termodynamické vlastnosti, tj. interakční energie, volné energie a adsorpční izotermy vzniklých komplexů a dále budou identifikovány nejvýznamnější typy interakcí v komplexech a vliv jednotlivých atomů a funkčních skupin na jejich stabilitu. Výsledky našich simulací budou porovnány s experimentálními daty, a to jak se stávajícími, tak s výsledky probíhajícího výzkumu našich spolupracovníků zabývajících se experimenty.
Title	Computational study of interactions of organic matter and biomolecules with mineral surfaces (en) Počítačové modelování interakcí organické hmoty a biomolekul s minerálními povrchy
skos:notation	GA13-08651S
http://linked.open...avai/cep/aktivita	Standard projects
http://linked.open...kovaStatniPodpora	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/projekt/GA13-08651S/celkovaStatniPodpora
http://linked.open...ep/celkoveNaklady	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/projekt/GA13-08651S/celkoveNaklady
http://linked.open...datumDodatniDoRIV	2015-04-23 (xsd:date)
http://linked.open...i/cep/druhSouteze	VS - Veřejná soutěž ve výzkumu a vývoji
http://linked.open...ep/duvernostUdaju	S - Úplné a pravdivé údaje nepodléhající ochraně podle zvláštních právních předpisů
http://linked.open.../cep/fazeProjektu	100769931
http://linked.open...ai/cep/hlavniObor	CF - Fyzikální chemie a teoretická chemie
http://linked.open...vai/cep/kategorie	ZV - Základní výzkum
http://linked.open.../cep/klicovaSlova	natural organic matter, biomolecules, amino acids, quartz, rutile, simulation, molecular dynamics, ab initio calculations (en)
http://linked.open...ep/partnetrHlavni	Přírodovědecká fakulta
http://linked.open...inujicichPrijemcu	0 (xsd:int)
http://linked.open...cep/pocetPrijemcu	1 (xsd:int)
http://linked.open...ocetSpoluPrijemcu	0 (xsd:int)
http://linked.open.../pocetVysledkuRIV	4 (xsd:int)
http://linked.open...enychVysledkuVRIV	4 (xsd:int)
http://linked.open...lneniVMinulemRoce	2014-03-31 (xsd:date)
http://linked.open.../prideleniPodpory	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/prideleniPodpory/13-08651S
http://linked.open...iciPoslednihoRoku	2015
http://linked.open...atUdajeProjZameru	2015
http://linked.open.../vavai/cep/soutez	SGA0201300005
http://linked.open...usZobrazovaneFaze	DRRVB
http://linked.open...ai/cep/typPojektu	P - Projekt výzkumu a vývoje financovaný ze státního rozpočtu
http://linked.open...ep/ukonceniReseni	2016-12-31 (xsd:date)
http://linked.open...ep/zahajeniReseni	2013-02-01 (xsd:date)
http://linked.open...tniCyklusProjektu	ZBB
http://linked.open.../cep/klicoveSlovo	amino acids biomolecules molecular dynamics quartz rutile simulation natural organic matter
is http://linked.open...vavai/cep/projekt of	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GA13-08651S/2013/orjk%3A12310 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GA13-08651S/2014/orjk%3A12310 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GA13-08651S/2015/orjk%3A12310 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GA13-08651S/2016/orjk%3A12310

Faceted Search & Find service v1.16.118 as of Jun 21 2024

Alternative Linked Data Documents: ODE Content Formats:

RDF

ODATA

Microdata

About

OpenLink Virtuoso version 07.20.3240 as of Jun 21 2024, on Linux (x86_64-pc-linux-gnu), Single-Server Edition (126 GB total memory, 41 GB memory in use)
Data on this page belongs to its respective rights holders.
Virtuoso Faceted Browser Copyright © 2009-2024 OpenLink Software