About: Cizorodý genetický materiál v genomu Elymus repens a ostatních Triticeae: jeho charakteristika, původ a evoluční význam.     Goto   Sponge   NotDistinct   Permalink

An Entity of Type : http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/Projekt, within Data Space : linked.opendata.cz associated with source document(s)

AttributesValues
rdf:type
rdfs:seeAlso
Description
  • Recently, we discovered the unexpected presence of foreign genetic material in the nuclear genome of the allohexaploid grass Elymus repens (Pooideae-Triticeae) and some other Triticeae. Some ITS ribotypes as well as a small chromosomal segment corresponded to Panicum, a member of a different grass subfamily (Panicoideae-Paniceae). Their presence might be due to ancient introgression or horizontal gene transfer, or a combination of both. We plan to investigate the presence, nature, origin and evolutionary significance of the foreign genetic material in the Triticeae using various molecular and cytogenetic approaches. The foreign DNA in selected Triticeae will be separated and analysed for the presence of functional genes that will be compared with their homologs from Panicum. The different ribotypes in E. repens and other Triticeae will be quantified (Real-Time PCR) at the DNA and RNA level to study their functionality, dynamics, and expression patterns. The project will have a large impact on the understanding of processes and mechanisms occurring in plant genomes. (en)
  • Během nedávné studii jsme objevili přítomnost cizorodého genetického materiálu v genomu alohexaploidního druhu trávy Elymus repens (pýr plazivý, Pooideae-Triticeae) a některých dalších zástupců Triticeae. Některé ITS ribotypy, a také malý chromozomový segment, odpovídaly druhu Panicum (proso) z jiné podčeledi trav (Panicoideae-Paniceae). Tento fakt může být důsledkem dávné introgrese nebo horizontálního přenosu, nebo kombinace obou procesů. Cílem projektu je zjistit přítomnost, charakter, původ, a evoluční význam cizorodého genetického materiálu v rámci Triticeae za použití rozličných molekulárních a cytogenetických technik. Cizorodá DNA u vybraných zástupců Triticeae bude separována a analyzována zejména na přítomnost funkčních genů, které budou porovnány s homology u prosa. Jednotlivé ribotypy u pýru a dalších Triticeae budou kvantifikovány pomocí Real-Time PCR na úrovni jak DNA, tak RNA, za účelem zjištění jejich funkčnosti, dynamiky a úrovni exprese. Navrhovaný projekt může významnou měrou přispět k pochopení procesů a mechanismů probíhajících v rostlinných genomech.
Title
  • Cizorodý genetický materiál v genomu Elymus repens a ostatních Triticeae: jeho charakteristika, původ a evoluční význam.
  • Foreign genetic material in Elymus repens and other Triticeae grasses: its nature, origin, and evolutionary implications. (en)
skos:notation
  • GA13-04454S
http://linked.open...avai/cep/aktivita
http://linked.open...kovaStatniPodpora
http://linked.open...ep/celkoveNaklady
http://linked.open...datumDodatniDoRIV
http://linked.open...i/cep/druhSouteze
http://linked.open...ep/duvernostUdaju
http://linked.open.../cep/fazeProjektu
http://linked.open...ai/cep/hlavniObor
http://linked.open...vai/cep/kategorie
http://linked.open.../cep/klicovaSlova
  • Elymus repens, Triticeae, Panicum, introgression, ribosomal DNA, next generation sequencing, Real-Time PCR (en)
http://linked.open...ep/partnetrHlavni
http://linked.open...inujicichPrijemcu
http://linked.open...cep/pocetPrijemcu
http://linked.open...ocetSpoluPrijemcu
http://linked.open.../pocetVysledkuRIV
http://linked.open...enychVysledkuVRIV
http://linked.open...lneniVMinulemRoce
http://linked.open.../prideleniPodpory
http://linked.open...iciPoslednihoRoku
http://linked.open...atUdajeProjZameru
http://linked.open.../vavai/cep/soutez
http://linked.open...usZobrazovaneFaze
http://linked.open...ai/cep/typPojektu
http://linked.open...ep/ukonceniReseni
http://linked.open...ep/zahajeniReseni
http://linked.open...tniCyklusProjektu
http://linked.open.../cep/klicoveSlovo
  • Panicum
  • Triticeae
  • introgression
  • next generation sequencing
  • ribosomal DNA
  • Elymus repens
is http://linked.open...vavai/cep/projekt of
Faceted Search & Find service v1.16.118 as of Jun 21 2024


Alternative Linked Data Documents: ODE     Content Formats:   [cxml] [csv]     RDF   [text] [turtle] [ld+json] [rdf+json] [rdf+xml]     ODATA   [atom+xml] [odata+json]     Microdata   [microdata+json] [html]    About   
This material is Open Knowledge   W3C Semantic Web Technology [RDF Data] Valid XHTML + RDFa
OpenLink Virtuoso version 07.20.3240 as of Jun 21 2024, on Linux (x86_64-pc-linux-gnu), Single-Server Edition (126 GB total memory, 41 GB memory in use)
Data on this page belongs to its respective rights holders.
Virtuoso Faceted Browser Copyright © 2009-2024 OpenLink Software