About: Combinatorial regulation and network of transcription factors involved in the biosynthesis of medicinal prenylflavonoids in hop (Humulus lupulus L.).

Facets (new session)
Description
Metadata
Settings
- owl:sameAs
- Inference Rule:

About: Combinatorial regulation and network of transcription factors involved in the biosynthesis of medicinal prenylflavonoids in hop (Humulus lupulus L.). Goto Sponge NotDistinct Permalink

An Entity of Type : http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/Projekt, within Data Space : linked.opendata.cz associated with source document(s)

Attributes	Values
rdf:type	http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/Projekt
rdfs:seeAlso	http://www.isvav.cz/projectDetail.do?rowId=GA13-03037S
Description	Hop is source of bitter acids and medicinal prenylchalcones, including xanthohumol. During last years we have characterized lupulin-specific chalcone synthase chs_H1 and transcription factors from Myb, bHLH and WDR families that act in a transcription activating complex regulating this key enzyme of prenylchalcone biosynthesis. In addition, we identified Myb suppressor, bZIP and WRKY as pathway modulators. In the project we propose to analyze basic properties of combinatorial „network“and possible interdependence among the studied transcription factors involving their autoregulation. These functional studies will include promoter cis-elements predictions, in vitro binding assays as well as in vivo interaction analyses using transient expression systems, hop transgenotes and breeding lines with different xanthohumol levels. The proposed study is expected to provide 1. new insight into the regulation of hop prenylchalcone biosynthesis pathways, 2. novel DNA markers for marker-assisted selection and 3. biotechnology applications of hop-derived metabolome and medicinal prenylchalcones. (en) Chmel je zdrojem hořkých kyselin a ozdravných prenylovaných chalkonů, zejména xantohumolu. V předešlých letech jsme popsali chalkonsyntázu chs_H1, klíčový enzym pro lupulinově specifickou biosyntézu prenylovaných chalkonů a transkripční faktory typu Myb, bHLH a WDR, tvořící komplexy regulující expresi genu chs_H1. Rovněž jsme identifikovali supresor Myb a faktory typu bZIP a WRKY jako modulátory této biosyntetické dráhy. V projektu navrhujeme analýzu kombinačních vztahů transkripčních faktorů a jejich interakcí včetně autoregulace. Tato funkční analýza bude zahrnovat predikce cis- regulačních elementů transkripčních faktorů a studium jejich aktivity in vitro, hodnocení interakcí in vivo v systémech transientní exprese, studium jejich nadprodukce u transgenního chmelu a exprese u šlechtitelských linií s kontrastními rozdíly v obsahu xanthohumolu. Na základě projektu předpokládáme: 1) získání nových poznatků o regulaci biosyntetické dráhy prenylovaných chalkonů chmelu, 2) získání nových DNA markerů pro šlechtění a 3) vytvoření základů pro biotechnologické modifikace metabolomu chmelu.
Title	Combinatorial regulation and network of transcription factors involved in the biosynthesis of medicinal prenylflavonoids in hop (Humulus lupulus L.). (en) Kombinační regulace a regulační síť transkripčních faktorů účastnících se biosyntézy ozdravných prenylflavonoidů chmelu (Humulus lupulus L.).
skos:notation	GA13-03037S
http://linked.open...avai/cep/aktivita	Standard projects
http://linked.open...kovaStatniPodpora	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/projekt/GA13-03037S/celkovaStatniPodpora
http://linked.open...ep/celkoveNaklady	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/projekt/GA13-03037S/celkoveNaklady
http://linked.open...datumDodatniDoRIV	2015-04-23 (xsd:date)
http://linked.open...i/cep/druhSouteze	VS - Veřejná soutěž ve výzkumu a vývoji
http://linked.open...ep/duvernostUdaju	S - Úplné a pravdivé údaje nepodléhající ochraně podle zvláštních právních předpisů
http://linked.open.../cep/fazeProjektu	100769656
http://linked.open...ai/cep/hlavniObor	EB - Genetika a molekulární biologie
http://linked.open...vai/cep/kategorie	ZV - Základní výzkum
http://linked.open.../cep/klicovaSlova	regulation networks; plant promoters; plant transformation; xanthohumol; Humulus lupulus (en)
http://linked.open...ep/partnetrHlavni	Biologické centrum AV ČR, v. v. i.
http://linked.open...inujicichPrijemcu	0 (xsd:int)
http://linked.open...cep/pocetPrijemcu	1 (xsd:int)
http://linked.open...ocetSpoluPrijemcu	1 (xsd:int)
http://linked.open.../pocetVysledkuRIV	10 (xsd:int)
http://linked.open...enychVysledkuVRIV	10 (xsd:int)
http://linked.open...lneniVMinulemRoce	2014-04-18 (xsd:date)
http://linked.open.../prideleniPodpory	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/prideleniPodpory/13-03037S
http://linked.open...iciPoslednihoRoku	2015
http://linked.open...atUdajeProjZameru	2015
http://linked.open.../vavai/cep/soutez	SGA0201300005
http://linked.open...usZobrazovaneFaze	DRRVB
http://linked.open...ai/cep/typPojektu	P - Projekt výzkumu a vývoje financovaný ze státního rozpočtu
http://linked.open...ep/ukonceniReseni	2017-12-31 (xsd:date)
http://linked.open.../cep/vedlejsiObor	EI - Biotechnologie a bionika GE - Šlechtění rostlin
http://linked.open...ep/zahajeniReseni	2013-02-01 (xsd:date)
http://linked.open...tniCyklusProjektu	ZBB
http://linked.open.../cep/klicoveSlovo	plant promoters plant transformation xanthohumol regulation networks
is http://linked.open...vavai/cep/projekt of	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GA13-03037S/2013/ico%3A14864347 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GA13-03037S/2013/ico%3A60077344 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GA13-03037S/2014/ico%3A14864347 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GA13-03037S/2014/ico%3A60077344 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GA13-03037S/2015/ico%3A14864347 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GA13-03037S/2015/ico%3A60077344 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GA13-03037S/2016/ico%3A14864347 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GA13-03037S/2016/ico%3A60077344 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GA13-03037S/2017/ico%3A14864347 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GA13-03037S/2017/ico%3A60077344

Faceted Search & Find service v1.16.118 as of Jun 21 2024

Alternative Linked Data Documents: ODE Content Formats:

RDF

ODATA

Microdata

About

OpenLink Virtuoso version 07.20.3240 as of Jun 21 2024, on Linux (x86_64-pc-linux-gnu), Single-Server Edition (126 GB total memory, 58 GB memory in use)
Data on this page belongs to its respective rights holders.
Virtuoso Faceted Browser Copyright © 2009-2024 OpenLink Software