About: New mechanisms of oncoprotein action in genesis of promyelocytic leukemia

Facets (new session)
Description
Metadata
Settings
- owl:sameAs
- Inference Rule:

About: New mechanisms of oncoprotein action in genesis of promyelocytic leukemia Goto Sponge NotDistinct Permalink

An Entity of Type : http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/Projekt, within Data Space : linked.opendata.cz associated with source document(s)

Attributes	Values
rdf:type	http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/Projekt
rdfs:seeAlso	http://www.isvav.cz/projectDetail.do?rowId=IAA500040802
Description	The scope of project is to contribute to our understanding to mechanisms of gene deregulation in acute promyelocytic leukemia (APL), which would help to identify new targets for specific therapy. Our existing results (Dellino et al., submitted to Nature) indicate that not only direct binding of the PML/RARa oncoprotein to RARE elements in promoters of down-regulated genes is responsible for gene silencing in APL. Instead, a significant proportion of genes is silenced by an indirect mechanism, involving changes in higher-order chromatin structure provoked by PML/RARa. This behavior is atypical and was not described for any other oncoprotein. Employing the microchip technology, RT-PCR, 3D-FISH, ImmunoFISH, Chromatin Capture Conformation Assay (3C) and ImmunoChip in combination with high-resolution confocal microscopy, we would like to further study %22indirect%22 mechanisms of carcinogenesis induced by PML/RARa and characterize effects of the most efficient anti-PML drugs to this process. (en) Cílem projektu je přispět k porozumění mechanismům deregulace genové exprese u akutní promyelocytární leukémie (APL), což by mělo napomoci identafikaci nových %22terčů%22 pro cílenou a efektivní terapii. Naše dosavadní výsledky (Dellino et al., 2007, postoupeno do časopisu Nature)ukazují, že na deregulaci genů u APL se, kromě přímé vazby fúzního onkoproteinu PML/RARa na RARE elementy v promotorech postižených genů, podílí také mechanismy nepřímé, zahrnující změny struktury chromatinu vyššího řádu vyvolané proteinem PML/RARa. Toto námi odhalené chování PML/RARa je velmi netypické, a nebylo doposud popsáno ani pro žádný jiný onkoprotein. S využitím metod mikročipové technologie, RT-PCR, 3D-FISH, Immuno-FISH, Chromatin Conformation Capture assay (3C) a ImmunoChip v kombinaci s konfokální mikroskopií o vysokém rozlišení bychom proto chtěli dále studovat nepřímé mechanismy karcinogeneze vyvolané proteinem PML/RAR a charakterizovat efekt v dnešní době nejúčinnějších anti-APL léků na tento proces
Title	New mechanisms of oncoprotein action in genesis of promyelocytic leukemia (en) Nové mechanismy aktivit onkoproteinů ve vzniku promyelocytické leukémie
skos:notation	IAA500040802
http://linked.open...avai/cep/aktivita	Grants of distinctly investigative character focused on the sphere of research pursued at present particularly in the Academy of Sciences of the Czech Republic
http://linked.open...kovaStatniPodpora	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/projekt/IAA500040802/celkovaStatniPodpora
http://linked.open...ep/celkoveNaklady	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/projekt/IAA500040802/celkoveNaklady
http://linked.open...datumDodatniDoRIV	2013-06-28 (xsd:date)
http://linked.open...i/cep/druhSouteze	VS - Veřejná soutěž ve výzkumu a vývoji
http://linked.open...ep/duvernostUdaju	S - Úplné a pravdivé údaje nepodléhající ochraně podle zvláštních právních předpisů
http://linked.open.../cep/fazeProjektu	91839718
http://linked.open...ai/cep/hlavniObor	EB - Genetika a molekulární biologie
http://linked.open...hodnoceniProjektu	U - Uspěl podle zadání, tj. byly splněny cíle a jeho předpokládané výsledky uvedené ve smlouvě / rozhodnutí o poskytnutí podpory
http://linked.open...vai/cep/kategorie	ZV - Základní výzkum
http://linked.open.../cep/klicovaSlova	Acute promyelocytic leukemia; PML/RARa fusion oncoprotein; higher-order chromatin structure, carcinogenesis; gene silencing (en)
http://linked.open...ep/partnetrHlavni	Biofyzikální ústav AV ČR, v.v.i.
http://linked.open...inujicichPrijemcu	0 (xsd:int)
http://linked.open...cep/pocetPrijemcu	1 (xsd:int)
http://linked.open...ocetSpoluPrijemcu	0 (xsd:int)
http://linked.open.../pocetVysledkuRIV	6 (xsd:int)
http://linked.open...enychVysledkuVRIV	6 (xsd:int)
http://linked.open...lneniVMinulemRoce	2011-03-18 (xsd:date)
http://linked.open.../prideleniPodpory	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/prideleniPodpory/IAA500040802
http://linked.open...iciPoslednihoRoku	2011
http://linked.open...atUdajeProjZameru	2012
http://linked.open.../vavai/cep/soutez	SAV02008-A
http://linked.open...usZobrazovaneFaze	DUU
http://linked.open...ai/cep/typPojektu	P - Projekt výzkumu a vývoje financovaný ze státního rozpočtu
http://linked.open...ep/ukonceniReseni	2011-12-31 (xsd:date)
http://linked.open...ep/zahajeniReseni	2008-01-01 (xsd:date)
http://linked.open...jektu+dodavatelem	Byl odhalen nový mechanismus patogeneze akutní promyelocytární leukémie. Vazba onkoproteinu PMLR/RARa na RARE elementy klastrů repetic Alu vyvolává tvorbu chromatin. smyček, které odtud „dopravují“ PML/RARa na specifické klastry genů a tím je utlumují. (cs) A new mechanism of acute promyelocytic leukemia pathogenesis was identified. Onkoprotein PML/RARa binds to RARE elements in Alu repeat clusters and induces formation of chromatin loops that deliver PML/RARa to specif. gene clusters and thus silence them. (en)
http://linked.open...tniCyklusProjektu	ZBBKU
http://linked.open.../cep/klicoveSlovo	Acute promyelocytic leukemia PML/RARa fusion oncoprotein carcinogenesis higher-order chromatin structure
is http://linked.open...vavai/riv/projekt of	Chromatin structure influences the sensitivity of DNA to gamma-radiation Higher-order chromatin structure in DSB induction, repair and misrepair The BRCA1 alternative splicing variant delta14-15 with an in-frame deletion of part of the regulatory serine-containing domain (SCD) impairs the DNA repair capacity in MCF-7 cells Local changes of higher-order chromatin structure during DSB-repair Sequestration of MBNL1 in tissues of patients with myotonic dystrophy type 2 Molecular Genetic Analysis of Fetal Tissues from a Family Affected by Myotonic Dystrophy
is http://linked.open...vavai/cep/projekt of	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/IAA500040802/2008/ico%3A68081707 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/IAA500040802/2009/ico%3A68081707 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/IAA500040802/2010/ico%3A68081707 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/IAA500040802/2011/ico%3A68081707 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/IAA500040802/2012/ico%3A68081707

Faceted Search & Find service v1.16.118 as of Jun 21 2024

Alternative Linked Data Documents: ODE Content Formats:

RDF

ODATA

Microdata

About

OpenLink Virtuoso version 07.20.3240 as of Jun 21 2024, on Linux (x86_64-pc-linux-gnu), Single-Server Edition (126 GB total memory, 58 GB memory in use)
Data on this page belongs to its respective rights holders.
Virtuoso Faceted Browser Copyright © 2009-2024 OpenLink Software