| Attributes | Values |
|---|
| rdf:type
| |
| rdfs:seeAlso
| |
| Description
| - In contrast to animals with mostly separated two sexes, a number of reproductive strategies coexist in higher plants. Surprisingly, the presence of well-established sex chromosomes in dioecious plants is rare. We intend to investigate structure and evolution of sex chromosomes in dioecious plant Silene latifolia. Since only limited sequence information on sex chromosomes is available in this species we focus on characterization of X chromosome as the fundamental step towards understanding the evolution of sex chromosomes. Our first goal is to construct X chromosome-specific BAC library using flow sorting approach. Subsequently, X chromosome specific physical map will be assembled and individual BACs will be sequenced. In parallel, massive sequencing using sorted X and Y chromosomes and sex chromosome-corresponding BAC clones in gynodioecious S. vulgaris will be carried out. Expression data for individual tissues, sexes and species will be generated based on RNA-seq approach. Comparative analyses of the data obtained will improve our understanding of processes forming sex chromosomes. (en)
- Na rozdíl od živočichů, kteří mají většinou oddělená pohlaví, existuje u rostlin mnoho reprodukčních strategií. Překvapivě u dvoudomých druhů je vzácná přítomnost heteromorfních pohlavních chromozomů. Naším cílem je objasnit strukturu a evoluci pohlavních chromozomů u dvoudomé rostliny Silene latifolia. Protože je u tohoto druhu dostupné jen omezené množství informací o pohlavních chromozomech, zaměříme se na charakterizaci chromozomu X jako zásadního kroku vedoucího k pochopení evoluce pohlavních chromozomů. Prvním cílem je konstrukce BAC knihovny specifické pro X chromozom pomocí průtokového třídění. Následně bude vytvořena fyzická mapa a jednotlivé BAC klony budou sekvenovány. Paralelně budou masivně sekvenovány separované chromozomy X a Y společně s BAC klony gynodioecického druhu S. vulgaris (nemá pohlavní chromozomy), které korespondují k oblastem pohlavních chromozomů. Expresní data pro jednotlivé tkáně, pohlaví a druhy budou získána pomocí RNA sekvenování. Srovnávací analýza získaných dat rozšíří naše znalosti o procesech, které formují pohlavní chromozomy.
|
| Title
| - Sex chromosome evolution - chromosome-specific genomics in genus Silene (en)
- Evoluce pohlavních chromozomů - chromozomálně specifická genomika u rodu Silene
|
| skos:notation
| |
| http://linked.open...avai/cep/aktivita
| |
| http://linked.open...kovaStatniPodpora
| |
| http://linked.open...ep/celkoveNaklady
| |
| http://linked.open...datumDodatniDoRIV
| |
| http://linked.open...i/cep/druhSouteze
| |
| http://linked.open...ep/duvernostUdaju
| |
| http://linked.open.../cep/fazeProjektu
| |
| http://linked.open...ai/cep/hlavniObor
| |
| http://linked.open...vai/cep/kategorie
| |
| http://linked.open.../cep/klicovaSlova
| - sex chromosomes genes comparative genomics (en)
|
| http://linked.open...ep/partnetrHlavni
| |
| http://linked.open...inujicichPrijemcu
| |
| http://linked.open...cep/pocetPrijemcu
| |
| http://linked.open...ocetSpoluPrijemcu
| |
| http://linked.open.../pocetVysledkuRIV
| |
| http://linked.open...enychVysledkuVRIV
| |
| http://linked.open...lneniVMinulemRoce
| |
| http://linked.open.../prideleniPodpory
| |
| http://linked.open...iciPoslednihoRoku
| |
| http://linked.open...atUdajeProjZameru
| |
| http://linked.open.../vavai/cep/soutez
| |
| http://linked.open...usZobrazovaneFaze
| |
| http://linked.open...ai/cep/typPojektu
| |
| http://linked.open...ep/ukonceniReseni
| |
| http://linked.open.../cep/vedlejsiObor
| |
| http://linked.open...ep/zahajeniReseni
| |
| http://linked.open...tniCyklusProjektu
| |
| is http://linked.open...vavai/riv/projekt
of | |
| is http://linked.open...vavai/cep/projekt
of | |
![[RDF Data]](/fct/images/sw-rdf-blue.png)
![[cxml]](/fct/images/cxml_doc.png)
![[csv]](/fct/images/csv_doc.png)
![[text]](/fct/images/ntriples_doc.png)
![[turtle]](/fct/images/n3turtle_doc.png)
![[ld+json]](/fct/images/jsonld_doc.png)
![[rdf+json]](/fct/images/json_doc.png)
![[rdf+xml]](/fct/images/xml_doc.png)
![[atom+xml]](/fct/images/atom_doc.png)
![[html]](/fct/images/html_doc.png)