| Attributes | Values |
|---|
| rdf:type
| |
| rdfs:seeAlso
| |
| Description
| - Many, perhaps all flowering plant (angiosperm) species have undergone whole chromosome set multiplication in their ancestry. Often this is associated with interspecific hybridization, a process called allopolyploidy. In the heart of the proposed project lies the central question of chromosome evolution following allopolyploidization when the diverged genomes become reunified in the nucleus. Large number of data generated by high-through put sequencing methods will enable us to determine which parts of genomes are evolving rapidly and which remain constant. We will explore the fate of the repeated DNA families, both tandems and dispersed, in allopolyploids of different ages. This will be informative since tandem repeats are involved in stabilizing chromosome structure and in homologue/heterologue recognition. Allopolyploidy provides us with a natural tool to determine how the repeats have evolved both within and between diploid and polyploid sections where it is likely that evolutionary pressures are different. We will also investigate epigenetic factors (e.g. DNA methylation) apparently involved in stabilization of repeated DNA in cell nucleus. These directions are likely to increase our knowledge of genome behavior upon the polyploidy and may be exploited in assisted breeding programs and biotechnology. (en)
- Většina vyšších rostlin včetně hospodářsky významných plodin jako jsou pšenice, káva, řepka vznikla mezidruhovou hybridizací spojenou s následnou multiplikací rodičovských chrosomálních sad, t.j. procesem allopolyploidie. Předmětem výzkumu bude studium genetických změn indukovaných allopolyploidií u modelových organismů různého stáří a typu. Strukturní polymorfismy homeologních (partnerských) chromosomů jsou důležitými parametry ovlivňujícími meiotickou stabilitu allopolyploidního jádra a tím i fenotyp. Pozornost bude zaměřena na repetitivní sekvence DNA, které tvoří podstatnou část chromosomů, a které podléhají rychlé evoluci.Velké množství dat generovaných plošným sekvenováním umožní řešit klíčové otázky, jako například které části genomu podléhají rychlým změnám (delece, konverze, rekombinace, transpozice) a které zůstávají naopak neměnné. Budou dále zkoumány epigenetické faktory (například metylace DNA), které ovlivňují stabilitu repetitivní DNA v jádře. Navrhované výzkumné směry přispějí k našim poznatkům o chování genomu v průběhu allopolyploidie a získané zkušenosti mohou být perspektivně využity ve šlechtitelských programech a biotechnologiích.
|
| Title
| - Genome reunions in plants: from DNA to chromosomes and reverse (en)
- Genomová spojení u rostlin: od DNA ke chromosomům a zpět
|
| skos:notation
| |
| http://linked.open...avai/cep/aktivita
| |
| http://linked.open...kovaStatniPodpora
| |
| http://linked.open...ep/celkoveNaklady
| |
| http://linked.open...datumDodatniDoRIV
| |
| http://linked.open...i/cep/druhSouteze
| |
| http://linked.open...ep/duvernostUdaju
| |
| http://linked.open.../cep/fazeProjektu
| |
| http://linked.open...ai/cep/hlavniObor
| |
| http://linked.open...hodnoceniProjektu
| |
| http://linked.open...vai/cep/kategorie
| |
| http://linked.open.../cep/klicovaSlova
| - polyploidy; plant; genome; evolution; repetitive; DNA (en)
|
| http://linked.open...ep/partnetrHlavni
| |
| http://linked.open...inujicichPrijemcu
| |
| http://linked.open...cep/pocetPrijemcu
| |
| http://linked.open...ocetSpoluPrijemcu
| |
| http://linked.open.../pocetVysledkuRIV
| |
| http://linked.open...enychVysledkuVRIV
| |
| http://linked.open...lneniVMinulemRoce
| |
| http://linked.open.../prideleniPodpory
| |
| http://linked.open...iciPoslednihoRoku
| |
| http://linked.open...atUdajeProjZameru
| |
| http://linked.open.../vavai/cep/soutez
| |
| http://linked.open...usZobrazovaneFaze
| |
| http://linked.open...ai/cep/typPojektu
| |
| http://linked.open...ep/ukonceniReseni
| |
| http://linked.open.../cep/vedlejsiObor
| |
| http://linked.open...ep/zahajeniReseni
| |
| http://linked.open...jektu+dodavatelem
| - Final report is carefully written and contains all required information. The project was executed at excellent level and lead to novel results on the dynamics of changes in parental genomes in allopolyploid plant species. The project supported education of PhD students (3 defended Thesis) and its results were published in 13 scientific journals with impact factor and on scientific conferences. (en)
- Závěrečná zpráva je pečlivě vypracována a obsahuje všechny náležitosti. Projekt byl řešen na vynikající úrovni a byly získány původní poznatky o dynamice změn rodičovských genomů u alopolyploidních druhů rostlin. Projekt přispěl k výchově doktorandů (3 obhájené práce) a jeho výsledky byly zveřejněny v 13 prestižních vědeckých časopisech s impakt faktorem a na řadě vědeckých konferencí. (cs)
|
| http://linked.open...tniCyklusProjektu
| |
| http://linked.open.../cep/klicoveSlovo
| - polyploidy
- evolution
- genome
- plant
- repetitive
|
| is http://linked.open...vavai/riv/projekt
of | |
| is http://linked.open...vavai/cep/projekt
of | |
![[RDF Data]](/fct/images/sw-rdf-blue.png)
![[cxml]](/fct/images/cxml_doc.png)
![[csv]](/fct/images/csv_doc.png)
![[text]](/fct/images/ntriples_doc.png)
![[turtle]](/fct/images/n3turtle_doc.png)
![[ld+json]](/fct/images/jsonld_doc.png)
![[rdf+json]](/fct/images/json_doc.png)
![[rdf+xml]](/fct/images/xml_doc.png)
![[atom+xml]](/fct/images/atom_doc.png)
![[html]](/fct/images/html_doc.png)