About: Contributing potential of MALDI-TOF spectrometry and HRMA in identification and typing of bacterial pathogens – evaluation on the model of COPD, bronchiectasis and cystic fibrosis

Facets (new session)
Description
Metadata
Settings
- owl:sameAs
- Inference Rule:

About: Contributing potential of MALDI-TOF spectrometry and HRMA in identification and typing of bacterial pathogens – evaluation on the model of COPD, bronchiectasis and cystic fibrosis Goto Sponge NotDistinct Permalink

An Entity of Type : http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/Projekt, within Data Space : linked.opendata.cz associated with source document(s)

Attributes	Values
rdf:type	http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/Projekt
rdfs:seeAlso	http://www.isvav.cz/projectDetail.do?rowId=NT13560
Description	The project consists in a conclusive prospective study of performance of MALDI-TOF spectrometry and High Resolution Melting Analysis of PCR-products (PCR-HRMA) in species identification, and MALDI-TOF and McRAPD in strain typing, compared to reference techniques (16S rDNA sequencing and MLST). For species identification purposes, a commercial MALDI-TOF approach and a published PCR-HRMA approach will be tested. For typing, MALDI-TOF and McRAPD will be tested in Haemophilus influenzae strains. This testing will be performed on bacterial isolates recovered from sputum samples of patients suffering Chronic Obstructive Pulmonary Disease (COPD), Bronchiectasis (BE), and Cystic Fibrosis (CF). Accuracy and reproducibility will be determined for identification techniques and power of resolution for typing techniques. Based on evaluation of clinical data, the true contributing potential of the techniques to improve clinical management will also be estimated. (en) Předmětem projektu je průkazná prospektivní studie výkonnosti MALDI-TOF spektrometrie a analýzy tání produktů PCR-amplifikace s vysokým rozlišením (PCR-HRMA) resp. analýzy tání produktů RAPD (McRAPD) v identifikaci resp. typizaci patogenů ve srovnání s referenčními technikami (16S rDNA sekvenování, resp. MLST). Pro druhovou identifikaci bude otestován komerční MALDI-TOF přístup a již zavedený PCR-HRMA přístup. Pro typizaci bude otestován MALDI-TOF přístup a McRAPD přístup u kmenů Haemophilus influenzae. Testování bude prováděno na izolátech ze sputa pacientů trpících chronickou obstrukční plicní nemocí (CHOPN), bronchiektáziemi (BE) a cystickou fibrózou (CF). Pro identifikační techniky bude vypočtena přesnost a reprodukovatelnost a pro typizační techniky rozlišovací schopnost. Na základě klinických dat bude odhadnut potenciál skutečného přínosu testovaných technik pro klinickou péči o pacienty.
Title	Contributing potential of MALDI-TOF spectrometry and HRMA in identification and typing of bacterial pathogens – evaluation on the model of COPD, bronchiectasis and cystic fibrosis (en) Potenciál přínosu PCR-HRMA a MALDI-TOF spektrometrie v identifikaci a typizaci bakteriálních patogenů – posouzení na modelu CHOPN, bronchiektázií a cystické fibrózy
skos:notation	NT13560
http://linked.open...avai/cep/aktivita	Ministry of Health’s Departmental Research and Development Programme III
http://linked.open...kovaStatniPodpora	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/projekt/NT13560/celkovaStatniPodpora
http://linked.open...ep/celkoveNaklady	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/projekt/NT13560/celkoveNaklady
http://linked.open...datumDodatniDoRIV	2015-01-22 (xsd:date)
http://linked.open...i/cep/druhSouteze	VS - Veřejná soutěž ve výzkumu a vývoji
http://linked.open...ep/duvernostUdaju	S - Úplné a pravdivé údaje nepodléhající ochraně podle zvláštních právních předpisů
http://linked.open.../cep/fazeProjektu	100908615
http://linked.open...ai/cep/hlavniObor	FN - Epidemiologie, infekční nemoci a klinická imunologie
http://linked.open...vai/cep/kategorie	NV - Aplikovaný výzkum s výjimkou průmyslového výzkumu (tzv. %22neprůmyslový výzkum%22)
http://linked.open.../cep/klicovaSlova	MALDI-TOF spectrometry; High Resolution Melting Analys; HRMA; McRAPD; MLST; species identification; COPD; Bronchiectasis; Cystic fibrosis (en)
http://linked.open...ep/partnetrHlavni	Lékařská fakulta
http://linked.open...inujicichPrijemcu	0 (xsd:int)
http://linked.open...cep/pocetPrijemcu	1 (xsd:int)
http://linked.open...ocetSpoluPrijemcu	1 (xsd:int)
http://linked.open.../pocetVysledkuRIV	0 (xsd:int)
http://linked.open...enychVysledkuVRIV	0 (xsd:int)
http://linked.open...lneniVMinulemRoce	2014-03-21 (xsd:date)
http://linked.open.../prideleniPodpory	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/prideleniPodpory/NT13560-4%2F2012
http://linked.open...iciPoslednihoRoku	2015
http://linked.open...atUdajeProjZameru	2015
http://linked.open.../vavai/cep/soutez	SMZ0201201
http://linked.open...usZobrazovaneFaze	DRRVK
http://linked.open...ai/cep/typPojektu	P - Projekt výzkumu a vývoje financovaný ze státního rozpočtu
http://linked.open...ep/ukonceniReseni	2015-12-31 (xsd:date)
http://linked.open...ep/zahajeniReseni	2012-04-01 (xsd:date)
http://linked.open...tniCyklusProjektu	ZBBK
http://linked.open.../cep/klicoveSlovo	MLST Bronchiectasis COPD HRMA High Resolution Melting Analys McRAPD species identification MALDI-TOF spectrometry
is http://linked.open...vavai/cep/projekt of	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/NT13560/2012/ico%3A00098892 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/NT13560/2012/orjk%3A15110 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/NT13560/2013/ico%3A00098892 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/NT13560/2013/orjk%3A15110 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/NT13560/2014/ico%3A00098892 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/NT13560/2014/orjk%3A15110 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/NT13560/2015/ico%3A00098892 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/NT13560/2015/orjk%3A15110

Faceted Search & Find service v1.16.118 as of Jun 21 2024

Alternative Linked Data Documents: ODE Content Formats:

RDF

ODATA

Microdata

About

OpenLink Virtuoso version 07.20.3240 as of Jun 21 2024, on Linux (x86_64-pc-linux-gnu), Single-Server Edition (126 GB total memory, 58 GB memory in use)
Data on this page belongs to its respective rights holders.
Virtuoso Faceted Browser Copyright © 2009-2024 OpenLink Software