Annotation 1: The aim of the project is determination of SNP and DNA methylation profiles in MDS patients. Annotation 2: We will use Illumina microarrays, %22Cancer SNP Panel%22 for detection of 1421 SNPs located in 408 genes and %22Methylation Cancer Panel%22 for detection of 1505 CpG loci in 807 genes. (en)
Anotace I. Předmětem předkládaného projektu je vytvoření SNP a DNA methylačního profilu pacientů s myelodysplastickým syndromem. Anotace II. K vytvoření profilů bude použita mikročipová technologie firmy Illumina, konkrétně %22Cancer SNP Panel%22 pro detekci 1421 jednonukleotidových polymorfismů nacházejících se v 408 genech a %22Methylation Cancer Panel%22 pro detekci 1505 CpG lokusů vybraných z 807 genů.
MDS is a hematologic disease at which we monitored methylation profiles and single nucleotide polymorphisms within the association study. We found an association with DNA repair genes and hypermethylation of promoters of several transcription factors. (en)
Při sledování methylačních profilů a v rámci asociační studie jednonukleotidových polymorfismů byla zjištěna asociace s geny s funkcí oprav DNA a hypermethylaci promotorové oblasti několika transkripčních faktorů. (cs)