About: Linking microbial meta-omics with ecosystem functioning: populations and pathways involved in chloroethenes degradation

Facets (new session)
Description
Metadata
Settings
- owl:sameAs
- Inference Rule:

About: Linking microbial meta-omics with ecosystem functioning: populations and pathways involved in chloroethenes degradation Goto Sponge NotDistinct Permalink

An Entity of Type : http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/Projekt, within Data Space : linked.opendata.cz associated with source document(s)

Attributes	Values
rdf:type	http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/Projekt
rdfs:seeAlso	http://www.isvav.cz/projectDetail.do?rowId=GA14-32432S
Description	Chlorinated ethenes (CE) have been used as effective non-flammable solvents. Therefore, they are widespread persistent pollutants of soils and waters. Degradation of CE often results in the formation of more toxic compounds. Mechanism of their formation and degradation still remains rather unclear. This study aims to link specific microorganisms, genes, and metabolites to in situ CE degradation activities. Modern high throughput sequencing methods along with techniques of functional microbial ecology (e.g., stable isotope probing, SIP) enable new insights into the complexity of such mechanisms. SIP will select the populations directly involved in the assimilation of CE, microbial meta-omics will clarify the functionality of the communities, including phylogenetic diversity (metagenomics) and metabolic diversity (metatranscriptomics, metaproteomics). The outputs of the project will include metabolic pathways mapping and identification of genes involved in the degradation of CE in real environmental conditions. (en) Chlorované etyleny (CE) byly v 20. století hojně využívány jako účinná nehořlavá rozpouštědla, a proto nyní patří mezi nejčastější persistentní polutanty v půdách a podzemních vodách. Při degradaci CE dochází často k akumulaci toxičtějších meziproduktů, přičemž mechanismus jejich vzniku i odbourávání není stále uspokojivě objasněn. Naše studie propojuje informace o indigenních mikrobiálních populacích a jejich funkčních genech s metabolickou aktivitou během degradace CE. Moderní vysokokapacitní sekvenační metody v kombinaci s metodami funkční mikrobiální ekologie (např. stable isotope probing, SIP) umožní nový náhled do těchto dosud málo prozkoumaných mechanismů a vztahů. SIP selektuje tu část mikrobiálního společenstva, která se přímo podílí na asimilaci CE, meta–omika umožní detailní vhled do fungování společenstva s možností sledování nejen fylogenetické diversity (metagenomika), ale i funkčního rozlišení (metatranskriptomika, metaproteomika). Výsledkem projektu bude zmapování metabolických drah a aktivních genů zapojených do degradace CE v reálných podmínkách životního prostředí.
Title	Linking microbial meta-omics with ecosystem functioning: populations and pathways involved in chloroethenes degradation (en) Mikrobiální meta-omika v souvislosti s fungováním ekosystémů: role populací a jejich metabolických drah v degradaci chlorethenů
skos:notation	GA14-32432S
http://linked.open...avai/cep/aktivita	Standard projects
http://linked.open...kovaStatniPodpora	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/projekt/GA14-32432S/celkovaStatniPodpora
http://linked.open...ep/celkoveNaklady	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/projekt/GA14-32432S/celkoveNaklady
http://linked.open...datumDodatniDoRIV	2015-04-23 (xsd:date)
http://linked.open...i/cep/druhSouteze	VS - Veřejná soutěž ve výzkumu a vývoji
http://linked.open...ep/duvernostUdaju	S - Úplné a pravdivé údaje nepodléhající ochraně podle zvláštních právních předpisů
http://linked.open.../cep/fazeProjektu	100799081
http://linked.open...ai/cep/hlavniObor	EE - Mikrobiologie, virologie
http://linked.open...vai/cep/kategorie	ZV - Základní výzkum
http://linked.open.../cep/klicovaSlova	chloroethenes, biodegradation, biotransformation, metagenomics, metatranscriptomics (en)
http://linked.open...ep/partnetrHlavni	Ústav pro nanomateriály, pokročilé technologie a inovace
http://linked.open...inujicichPrijemcu	0 (xsd:int)
http://linked.open...cep/pocetPrijemcu	1 (xsd:int)
http://linked.open...ocetSpoluPrijemcu	1 (xsd:int)
http://linked.open.../pocetVysledkuRIV	0 (xsd:int)
http://linked.open...enychVysledkuVRIV	0 (xsd:int)
http://linked.open...lneniVMinulemRoce	2014-03-31 (xsd:date)
http://linked.open.../prideleniPodpory	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/prideleniPodpory/14-32432S
http://linked.open...iciPoslednihoRoku	2015
http://linked.open...atUdajeProjZameru	2015
http://linked.open.../vavai/cep/soutez	SGA0201400001
http://linked.open...usZobrazovaneFaze	DRRVB
http://linked.open...ai/cep/typPojektu	P - Projekt výzkumu a vývoje financovaný ze státního rozpočtu
http://linked.open...ep/ukonceniReseni	2016-12-31 (xsd:date)
http://linked.open...ep/zahajeniReseni	2014-01-01 (xsd:date)
http://linked.open...tniCyklusProjektu	ZB
http://linked.open.../cep/klicoveSlovo	chloroethenes biodegradation biotransformation metagenomics
is http://linked.open...vavai/cep/projekt of	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GA14-32432S/2014/orjk%3A22330 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GA14-32432S/2014/orjk%3A24620 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GA14-32432S/2015/orjk%3A22330 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GA14-32432S/2015/orjk%3A24620 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GA14-32432S/2016/orjk%3A22330 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GA14-32432S/2016/orjk%3A24620

Faceted Search & Find service v1.16.118 as of Jun 21 2024

Alternative Linked Data Documents: ODE Content Formats:

RDF

ODATA

Microdata

About

OpenLink Virtuoso version 07.20.3240 as of Jun 21 2024, on Linux (x86_64-pc-linux-gnu), Single-Server Edition (126 GB total memory, 77 GB memory in use)
Data on this page belongs to its respective rights holders.
Virtuoso Faceted Browser Copyright © 2009-2024 OpenLink Software