Increase in incidence of multidrug resistant Salmonella spp. has been observed over the past few years. This is one of the reasons why we propose a project which would deal with the presence of such strains in the Czech Republic. After a set up of the collection of the multidrug resistant isolates of Salmonella spp. (incl. the epidemiological information for each strain), specific PCRs for the detection of genes most frequently responsible for drug resistance in Salmonella will be developed. After the verification process, such techniques will be made available for the diagnostic laboratories involved in the project. In the next step we will focus on less frequent resistances in Salmonella especially against trimethoprim and fluoroquinolones using realtime PCR (mutational analysis of gyrA gene) followed by DNA sequencing of gyrA and dhfr genes in selected strains. Final part of the project will deal with possible modes of transmission of the drug resistances among different Salmonella populations usi (en)
V posledních letech dochází k nárůstu incidence multirezistentních kmenů Salmonella spp. Proto navrhujeme projekt, který by se dlouhodobě zabýval sběrem rezistentních kmenů salmonel izolovaných z lidí, zvířat, potravin, krmiv a prostředí včetně příslušných epidemiologických a epizootologických údajů. Následně budou vyvinuty a do diagnostické praxe zavedeny genově specifické PCR pro průkaz genů zodpovědných za nejčastěji se vyskytující rezistence u salmonel. Po zavedení základních PCR reakcí se zaměřímena rezistence, které se u salmonel vyskytují méně často. Jedná se zejména o rezistenci k trimetoprimu a fluorochinolonům. Kmeny budou charakterizovány pomocí real time PCR (mutační analýza gyrA genu) a u vybraných kmenů budou geny gyrA a dhfr sekvenovány. Závěrečná část projektu bude věnována možným způsobům přenosu rezistencí v populacích salmonel s využitím metod molekulární genetiky a funkční genomiky. (cs)