Set up of sequence analysis of PCR fragments of HCV genome isolates. Obtaining of basic data about variability of HCV in infected persons from low-risk group of blood donors and high-risk group of injection drug users. Set up of database of partial sequences of HCV isolates from Czech Republic. Mapping of geographical distribution of types, subtypes and variants of HCV in low and high-risk groups. Analysis of parcial HCV RNA variability in low-risk population of blood donors in interval of 5 years. Use of molecular epidemiology for analysis of outbreaks of HCV infection in health care facilities and in person-to-person transmission in professional risk cases (en)
Zavedení sekvenační analýzy úseků genomu viru hepatitidy C získaných metodou RT PCR ze sér infikovaných osob. Získání základních údajů o variabilitě HCV v nízkorizikové skupině infikovaných dárců krve a vysoce rizikové skupině injekčních uživatelů drog Vytvoření databáze parciálních sekvencí genomu HCV z izolátů z ČR, jako referenčního souboru pro srovnávací analýzu nových izolátů. Zjištění distribuce typů a subtypů HCV ve skupinách s nízkým a vysokým rizikem infekce HCV. Analýza sekvencí soubor HCV RNA pozitivních sér z nízkorizikové populace v závislosti na době sběru. Budou sledovány změny struktury genomu HCV izolátů v časovém intervalu 5 let. Využití ME při analýze případů epidemických výskytů VHC (hledání zdrojů a způsobů šíření) zejména ve zdravotnických zařízeních, vyhodnocení možností sekvenační analýzy při studiu přenosu HCV mezi konkrétními osobami (profesionání a forenzní případy) (cs)