Projekt předpokládá vyšetření desítek až set kmenů a izolátů poddruhu T. pallidum ssp. pallidum v hypervariabilních oblastech genomu. Rozdíly v těchto sekvencích budou použity pro identifikaci individuálních kmenů tohoto poddruhu. Rozdíly v genomech kmenů a izolátů poddruhu T. pallidum ssp. pallidum budou zjišťovány po PCR amplifikaci sekvenací PCR produktů. Bude navržen zjednodušený protokol na identifikaci nejčastějších kmenů na základě PCR amplifikace a RFLP. (cs)
The main aim of this project is to collect over one hundred strains and clinical isolates of T. pallidum ssp. pallidum, the causative agent of syphilis. Variable parts of the genomes will be amplified and sequenced. Molecular identification of individual Treponema pallidum ssp. pallidum strains and isolates is important for epidemiologic consequences and for clinical discrimination between reinfection and reactivation of the syphylitic process. (en)
Molekulární typizace kmenů a izolátů Treponema pallidum subsp. pallidum: základ pro epidemiologickou a klinickou identifikaci jednotlivých kmenů (cs)
Molecular typing of Treponema pallidum subsp. pallidum strains and isolates: the background for epidemiological and clinical identifications of individual strains (en)