About: Identification and biotyping of phytopathogens of cultivated plants using mass spectrometry

Facets (new session)
Description
Metadata
Settings
- owl:sameAs
- Inference Rule:

About: Identification and biotyping of phytopathogens of cultivated plants using mass spectrometry Goto Sponge NotDistinct Permalink

An Entity of Type : http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/Projekt, within Data Space : linked.opendata.cz associated with source document(s)

Attributes	Values
rdf:type	http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/Projekt
Description	Plísně jsou obligátními biotrofními patogeny rostlin, které způsobují vážná onemocnění ekonomicky důležitých plodin. Jejich současná diagnostika je založena na kombinaci specifičnosti hostitele, symptomech a mikroskopii. Ačkoli bývá význam fenotypových rysů diskutován, mikroskopická pozorování zůstávají nenahraditelnými. Tato metoda je však silně závislá na praxi a zkušenostech fytopatologa. Navrhujeme vypracovat alternativní přístup založený na hmotnostní spektrometrii, která vyžaduje pouze malé množství materiálu a přitom využívá velmi rychlého a relativně jednoduchého zpracování vzorku a interpretace dat. Vyhledávání v databázi založené na porovnávání typických a neznámých hmotnostních spekter umožňuje identifikaci a taxonomickou klasifikaci mikroorganismů např. analýzou hlavních komponent. Většina plánovaných experimentů bude založena na hmotnostně spektrometrické analýze povrchových proteinů uvolněných působením kyseliny na rostlinné patogeny. V rámci projektu se předpokládá předání know-how rak (cs) Downy and powdery mildews are obligate biotrophic plants pathogens causing severe diseases in economically important crops. Their diagnostics is currently based on a combination of host specificity, symptoms and microscopy. Although the relevance of phenotypic characters has been discussed, microscopic investigation still remains indispensable. However, this method depends strongly on systematic practice and experience of a plant pathologist. We suggest to develop an alternative approach based on mass spectrometry, which requires only very small amount of biological material and sample processing and data interpretation are fast and relatively easy. Database searches with comparing typical and unknown mass spectra then allow identification and taxonomical classification of microorganisms for example by principle component analysis. A majority of planned experiments will rely on mass spectrometric analyses of surface proteins released by an acidic treatment of the plant pathogens. In the frame of this (en)
Title	Identification and biotyping of phytopathogens of cultivated plants using mass spectrometry (en) Identifikace a biotypizace fytopatogenů kulturních rostlin pomocí hmotnostní spektrometrie (cs)
http://linked.open...vai/cislo-smlouvy	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/smlouva/7535/2010-32
http://linked.open...lsi-vedlejsi-obor	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/obor/CB
http://linked.open...avai/druh-souteze	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/druh-souteze/M2
http://linked.open...domain/vavai/faze	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/faze/54023634
http://linked.open...vavai/hlavni-obor	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/obor/CE
http://linked.open...vai/vedlejsi-obor	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/obor/EF
http://linked.open...vavai/id-aktivity	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/aktivita/ME
http://linked.open.../vavai/id-souteze	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/soutez/
http://linked.open...n/vavai/kategorie	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/kategorie/1
http://linked.open...vai/klicova-slova	biotyping; matrix-assisted laser desorption/ionization; mass spectrometry; microorganism; mildew; plant pathogen (en)
http://linked.open...avai/konec-reseni	2011-12-31 (xsd:date)
http://linked.open...nujicich-prijemcu	0 (xsd:integer)
http://linked.open...avai/poskytovatel	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/poskytovatel/MSM
http://linked.open...avai/start-reseni	2010-01-01 (xsd:date)
http://linked.open...ai/statni-podpora	160 (xsd:integer)
http://linked.open...vavai/typProjektu	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/typ/P
http://linked.open...ai/uznane-naklady	160 (xsd:integer)
http://linked.open...ai/pocet-prijemcu	1 (xsd:integer)
http://linked.open...cet-spoluprijemcu	0 (xsd:integer)
http://linked.open...ai/pocet-vysledku	1 (xsd:integer)
http://linked.open...ku-zverejnovanych	1 (xsd:integer)
is http://linked.open...ain/vavai/projekt of	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/2010/MEB061003/orjk-15310 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/2011/MEB061003/orjk-15310 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/2012/MEB061003/orjk-15310

Faceted Search & Find service v1.16.118 as of Jun 21 2024

Alternative Linked Data Documents: ODE Content Formats:

RDF

ODATA

Microdata

About

OpenLink Virtuoso version 07.20.3240 as of Jun 21 2024, on Linux (x86_64-pc-linux-gnu), Single-Server Edition (126 GB total memory, 58 GB memory in use)
Data on this page belongs to its respective rights holders.
Virtuoso Faceted Browser Copyright © 2009-2024 OpenLink Software